Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,888,054 | A→G | N64D (AAT→GAT) | tnaB → | low affinity tryptophan permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,888,054 | 0 | A | G | 86.2% | 726.0 / 101.2 | 296 | N64D (AAT→GAT) | tnaB | low affinity tryptophan permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/17); new base G (132/123); total (156/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.20e-01 |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
TCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCC > NC_000913/3887963‑3888146 | cTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGAt < 2:2549086/93‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGAtt < 1:5441217/93‑1 (MQ=255) tGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAAttt < 2:1944915/93‑1 (MQ=255) gCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTa > 2:1479833/1‑93 (MQ=255) ccGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTaa > 2:1791207/1‑93 (MQ=255) cGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTaaa < 2:5947399/93‑1 (MQ=255) gTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAAtt > 2:6509804/1‑93 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTa < 2:2159263/93‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTa < 2:5271645/93‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTa < 1:1943074/93‑1 (MQ=255) gCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTAt < 2:6045337/93‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATc < 1:3505641/93‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATc < 1:6479058/93‑1 (MQ=255) cTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATcc > 2:5023404/1‑93 (MQ=255) tGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATccc > 1:1997518/1‑93 (MQ=255) tGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATccc > 1:2957896/1‑93 (MQ=255) tGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATccc > 1:7409325/1‑93 (MQ=255) tGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATccc > 1:3750365/1‑93 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCg < 1:7124361/93‑1 (MQ=255) gTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGt > 2:5495989/1‑93 (MQ=255) gTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGt > 2:2844281/1‑93 (MQ=255) tttttCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTc < 1:4655690/93‑1 (MQ=255) ggggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCa < 2:405136/93‑1 (MQ=255) ggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGt > 2:6558250/1‑93 (MQ=255) ggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGt < 2:727047/93‑1 (MQ=255) gTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGtt > 2:6791496/1‑93 (MQ=255) tGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGttt > 1:751706/1‑93 (MQ=255) gCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGtttt > 1:5542768/1‑93 (MQ=255) gCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGttnn > 1:1297794/1‑91 (MQ=255) cTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTaa < 2:6379805/93‑1 (MQ=255) cTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTaa > 1:3609087/1‑93 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAac < 2:673700/93‑1 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAac > 2:3807022/1‑93 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAac > 1:4784295/1‑93 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAac > 1:6689311/1‑93 (MQ=255) tttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAac > 2:2949328/1‑93 (MQ=255) ttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAaca > 1:3913903/1‑93 (MQ=255) tCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCa > 1:5938621/1‑93 (MQ=255) ccTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCAt > 2:4923629/1‑93 (MQ=255) cTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATc < 2:1156678/93‑1 (MQ=255) tATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCAc > 2:3250890/1‑93 (MQ=255) tCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCa > 1:1471488/1‑93 (MQ=255) tCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCa < 1:4853492/93‑1 (MQ=255) cATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCaa > 1:6818491/1‑93 (MQ=255) aTTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCaaa < 2:697284/93‑1 (MQ=255) ttGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAg > 1:2642795/1‑93 (MQ=255) gCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAt > 1:1156167/1‑93 (MQ=255) ccTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAtt > 1:6259387/1‑93 (MQ=255) ccTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAtt < 1:3036531/93‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAttt > 2:1426845/1‑93 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAttt > 1:3550773/1‑93 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAttt > 2:612889/1‑93 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTaa < 1:2348134/93‑1 (MQ=255) gTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAAt < 1:841257/93‑1 (MQ=255) gTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAAt > 2:3435167/1‑93 (MQ=255) tttCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCg < 2:5911893/93‑1 (MQ=255) ttaaTTCTTCCTTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGGCGGCTCCAATTTTAACACCATCGCCAAAGATTTAATCGGt < 1:5734700/91‑1 (MQ=255) tCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGt > 1:6376124/1‑93 (MQ=255) tCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGt > 1:7274976/1‑93 (MQ=255) cAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTACCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTa < 1:7003895/93‑1 (MQ=255) aaTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa < 2:7344161/93‑1 (MQ=255) aaTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa > 2:5582578/1‑93 (MQ=255) aaTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa > 2:3160700/1‑93 (MQ=255) aaTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa > 1:7480697/1‑93 (MQ=255) tGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAaca > 2:1066011/1‑93 (MQ=255) gCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAacac > 2:5781990/1‑93 (MQ=255) gCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAacac > 2:5673635/1‑93 (MQ=255) cTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACAcc < 1:4200244/93‑1 (MQ=255) ttCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCt > 2:271951/1‑93 (MQ=255) ttCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCt > 1:2132800/1‑93 (MQ=255) tCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTg < 2:1700476/93‑1 (MQ=255) tCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTg < 1:434391/93‑1 (MQ=255) tCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTg < 2:4634514/93‑1 (MQ=255) aTTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGa < 2:2230487/93‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGaa > 1:5667436/1‑93 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGaa > 2:4790326/1‑93 (MQ=255) ccGGGTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACa < 1:5143758/93‑1 (MQ=255) gggTTATTGTTATTAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACAtt > 1:7376101/1‑93 (MQ=255) gttattgttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTAt > 2:2102479/1‑93 (MQ=255) gttattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTAt > 1:3193923/1‑93 (MQ=255) ttattgttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATc < 2:3676139/93‑1 (MQ=255) ttgttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGc > 2:6227441/1‑93 (MQ=255) ttgttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGc < 1:1594094/93‑1 (MQ=255) tgttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCg < 1:2779395/93‑1 (MQ=255) gttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCgg > 2:75204/1‑93 (MQ=255) gttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCgg < 2:4703680/93‑1 (MQ=255) gttattAGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCgg > 1:4071288/1‑93 (MQ=255) tattaGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTa < 2:1239245/93‑1 (MQ=255) attaGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTAt < 2:6181575/93‑1 (MQ=255) attaGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTAt < 2:3993556/93‑1 (MQ=255) ttaGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTAtt > 1:3293805/1‑93 (MQ=255) taGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTa < 2:4865201/93‑1 (MQ=255) aGAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTAc < 2:1670169/93‑1 (MQ=255) gAAGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTAcc > 2:6894373/1‑93 (MQ=255) aaGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCg < 2:2797480/93‑1 (MQ=255) aGCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGt > 2:1558300/1‑93 (MQ=255) gCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGtt < 2:4151931/93‑1 (MQ=255) gCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGtt < 2:3565467/93‑1 (MQ=255) gCAGATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGtt > 1:103760/1‑93 (MQ=255) aaTTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGcc > 2:5200336/1‑93 (MQ=255) | TCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCC > NC_000913/3887963‑3888146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |