Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,915,980 | G→A | G502G (GGC→GGT) | atpA ← | membrane‑bound ATP synthase, F1 sector, alpha‑subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,915,980 | 0 | G | A | 84.8% | 836.1 / 104.0 | 336 | G502G (GGC→GGT) | atpA | membrane‑bound ATP synthase, F1 sector, alpha‑subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/22); new base A (152/132); total (181/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.35e-02 |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CCATGAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTAAGC > NC_000913/3915890‑3916069 | ccATGAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATAcc < 1:4282218/93‑1 (MQ=255) aTGAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCtt > 2:6874784/1‑93 (MQ=255) aTGAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCtt < 1:7428571/93‑1 (MQ=255) tGAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCttt > 2:129663/1‑93 (MQ=255) gAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTc > 1:2116649/1‑93 (MQ=255) gAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTc < 1:6922130/93‑1 (MQ=255) gAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTc < 2:6174892/93‑1 (MQ=255) aGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCa < 2:749097/93‑1 (MQ=255) aGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCa > 1:1945288/1‑93 (MQ=255) cTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGc < 2:7031864/93‑1 (MQ=255) cTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGc < 2:5438725/93‑1 (MQ=255) ttCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTTAGCt > 1:6287718/1‑93 (MQ=255) ttCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCt < 1:6713543/93‑1 (MQ=255) tctcCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCtt > 2:4095271/1‑93 (MQ=255) tctcCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCtt < 2:4396512/93‑1 (MQ=255) cctcAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGcc > 1:346610/1‑93 (MQ=255) cctcAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGcc < 2:2905669/93‑1 (MQ=255) ctcAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCt > 1:3876723/1‑93 (MQ=255) tcAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCtt < 2:3620406/93‑1 (MQ=255) cAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTc < 1:708236/93‑1 (MQ=255) aaTGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCg < 1:6200834/93‑1 (MQ=255) gCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGAtt < 1:5105324/93‑1 (MQ=255) ccTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGAttt < 2:4991003/93‑1 (MQ=255) ccTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGAttt > 2:3318630/1‑93 (MQ=255) cTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTtc < 2:2730690/93‑1 (MQ=255) cTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTtc < 1:376951/93‑1 (MQ=255) tGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTtcgt > 1:272227/1‑93 (MQ=255) cGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTtcgtcg < 2:1916292/93‑1 (MQ=255) ggCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTcgtcgt > 2:2140331/1‑93 (MQ=255) cTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGt < 1:4625501/93‑1 (MQ=255) tGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTa < 2:260822/93‑1 (MQ=255) cccTAAGGAAAGCCCCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATCCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGc < 1:2485533/93‑1 (MQ=255) ccTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGcc > 1:4410563/1‑93 (MQ=255) cTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCa > 1:4517464/1‑93 (MQ=255) cTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCa > 1:6401576/1‑93 (MQ=255) cTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCa < 2:6306950/93‑1 (MQ=255) tAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCAc > 1:1382335/1‑93 (MQ=255) tAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCAc > 1:1460919/1‑93 (MQ=255) tAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCAc > 2:4601460/1‑93 (MQ=255) tAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCAc > 2:2946683/1‑93 (MQ=255) aaGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCAcc < 1:5129185/93‑1 (MQ=255) ggCAAGCCTCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCgg > 2:3527943/1‑93 (MQ=255) gCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGt < 2:6496795/93‑1 (MQ=255) cAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTc < 1:3160726/93‑1 (MQ=255) aaGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCt < 1:5043872/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTg > 1:752901/1‑93 (MQ=255) aGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTg > 2:1777338/1‑93 (MQ=255) ccAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGa > 1:2597761/1‑93 (MQ=255) cAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGAt < 2:3768271/93‑1 (MQ=255) cAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGAt < 1:2186821/93‑1 (MQ=255) aGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGAtc > 2:1499157/1‑93 (MQ=255) aGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGAtc < 2:3235727/93‑1 (MQ=255) aCGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGAtctc > 1:3981446/1‑93 (MQ=255) aCGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGAtctc > 2:7512986/1‑93 (MQ=255) cGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATctct < 1:1150059/93‑1 (MQ=255) cGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATctct > 1:362238/1‑93 (MQ=255) cGTTACCAGGATTGGCTTGCTTTGAAGGAATCGCGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATCTCGTCGGTCTAGCCCCCGGTCCGCGTGAtctca > 1:705483/1‑92 (MQ=255) tACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGc < 1:959479/93‑1 (MQ=255) ccAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCAt > 2:3008724/1‑93 (MQ=255) ccAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCAt > 1:7222253/1‑93 (MQ=255) cAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATc > 2:4027871/1‑93 (MQ=255) cAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATc < 1:1561523/93‑1 (MQ=255) ggATTGGGTTGCTTTGAAGGAATTGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCaa > 1:5707990/1‑93 (MQ=255) ggATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCaa < 2:3117267/93‑1 (MQ=255) ggATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCaa < 1:5650095/93‑1 (MQ=255) ggATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCaa > 1:5891644/1‑93 (MQ=255) ggATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCaa > 1:4909216/1‑93 (MQ=255) ggATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCaa > 1:5410530/1‑93 (MQ=255) aTTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACg > 2:1949670/1‑93 (MQ=255) ttGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACgg > 1:6762448/1‑93 (MQ=255) ttGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACgg < 1:2442209/93‑1 (MQ=255) ttGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACgg > 1:3856714/1‑93 (MQ=255) gTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCg < 2:7178144/93‑1 (MQ=255) gTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCg < 2:5213247/93‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGt < 2:5264944/93‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGt < 1:1038241/93‑1 (MQ=255) gCTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGa > 2:2502946/1‑93 (MQ=255) cTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGAt < 1:3079638/93‑1 (MQ=255) cTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGAt < 1:652248/93‑1 (MQ=255) cTTTGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGAt > 2:5565857/1‑93 (MQ=255) tttGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATc < 2:381774/93‑1 (MQ=255) tttGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATc < 1:6067543/93‑1 (MQ=255) tttGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATc > 2:5107475/1‑93 (MQ=255) ttGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCa > 2:6675465/1‑93 (MQ=255) tGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCAc < 1:3552587/93‑1 (MQ=255) tGAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCAc < 2:1627013/93‑1 (MQ=255) gAAGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACg > 2:2231040/1‑93 (MQ=255) aaGGAATCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACgg > 2:6616642/1‑93 (MQ=255) aaTCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGa < 1:1219742/93‑1 (MQ=255) aaTCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGa > 2:5643954/1‑93 (MQ=255) aTCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGAc < 2:5921273/93‑1 (MQ=255) tCGAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACg > 2:1432875/1‑93 (MQ=255) gAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTa < 1:3016301/93‑1 (MQ=255) gAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTa > 2:4803535/1‑93 (MQ=255) gAGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTa > 2:2274746/1‑93 (MQ=255) aGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTaa > 1:29017/1‑93 (MQ=255) aGGATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTaa < 2:1134929/93‑1 (MQ=255) ggATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTAAg > 1:5318288/1‑93 (MQ=255) gATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTAAGc > 2:4490085/1‑93 (MQ=255) gATACCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTCCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTAAGc < 2:3910221/93‑1 (MQ=255) | CCATGAGCTTCTCCTCAATGCCTTGCGGCCTGCCCTAAGGCAAGCCGCCAGACGTTACCAGGATTGGGTTGCTTTGAAGGAATCGAGGATGCCTTTCAGCTTGCCTTCGATTTCGTCGTTGTAGCCACCGGTCTGGTTGATCTCTTGCATCAACGGAGCGTGATCACGGTCGACGTAAGC > NC_000913/3915890‑3916069 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |