Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 28,729 | C→T | A119V (GCC→GTC) | dapB → | dihydrodipicolinate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 28,729 | 0 | C | T | 86.8% | 719.9 / 64.7 | 250 | A119V (GCC→GTC) | dapB | dihydrodipicolinate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (18/15); new base T (103/114); total (121/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.13e-01 |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TCGCTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTGA > NC_000913/28639‑28819 | tcGCTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCg > 1:5615164/1‑93 (MQ=255) tttttGTCGCCAGCATGGCATCGGGAGGATGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGatct > 1:383197/1‑91 (MQ=255) ttttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATAtt < 1:1603252/93‑1 (MQ=255) ttttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATAtt > 2:6899210/1‑93 (MQ=255) ttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGCTATTGc < 2:7097763/93‑1 (MQ=255) tGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCg > 1:3570283/1‑93 (MQ=255) gTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGa < 1:1145053/93‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGa < 1:3418689/93‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGa < 1:3359810/93‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGa > 2:3879720/1‑93 (MQ=255) tCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGAt < 1:2574422/93‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGAt > 2:1079029/1‑93 (MQ=255) cGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGAtt > 2:4120589/1‑93 (MQ=255) ccAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGt > 1:1005304/1‑93 (MQ=255) cAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTc < 1:4676992/93‑1 (MQ=255) cAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTc > 1:1821477/1‑93 (MQ=255) gCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCtt < 1:6548044/93‑1 (MQ=255) aTGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTtg > 2:6022917/1‑93 (MQ=255) tGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTtgc > 1:7001800/1‑93 (MQ=255) aaGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCa > 1:2676256/1‑93 (MQ=255) aaGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCa > 1:91896/1‑93 (MQ=255) aaGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCa > 1:3100902/1‑93 (MQ=255) aGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCaa < 2:4634369/93‑1 (MQ=255) aGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCaa < 1:5022832/93‑1 (MQ=255) gggATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAt < 2:1647297/93‑1 (MQ=255) gggATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAt < 2:5712354/93‑1 (MQ=255) ggATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAtt < 2:4394528/93‑1 (MQ=255) gATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAttt > 2:5414199/1‑93 (MQ=255) tGGCGATCGGCACTACGGGGCTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTTGTGACGCCGCTGTCGATAGTGAGATTGTCTCTGCTGCAAATTTTa > 1:5729331/1‑93 (MQ=255) ggTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAg < 1:6440686/93‑1 (MQ=255) gATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGt < 2:4989493/93‑1 (MQ=255) aTCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGtt < 1:5169539/93‑1 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCGATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg < 2:7220960/93‑1 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg < 1:4231313/93‑1 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg > 2:577823/1‑93 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg < 2:1212564/93‑1 (MQ=255) cACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGt < 1:2700425/93‑1 (MQ=255) cACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTGTGCTGCCTATTTTAGCGTTGGCGt < 2:7362796/93‑1 (MQ=255) aCTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGtt > 2:6713350/1‑93 (MQ=255) cTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTa < 2:4202794/93‑1 (MQ=255) gaCGGGTTTTGACGAAGCCGATAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTaa < 2:2181342/92‑1 (MQ=255) aCGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAAc > 2:381114/1‑93 (MQ=255) aCGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAAc < 1:836592/93‑1 (MQ=255) aCGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTATTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAAc > 1:6657741/1‑93 (MQ=255) gggTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTc < 1:5809572/93‑1 (MQ=255) ggTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCa > 1:6223717/1‑93 (MQ=255) gTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCAt < 2:3422391/93‑1 (MQ=255) tttGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATg < 2:138999/93‑1 (MQ=255) taaCGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCt < 1:6376415/91‑1 (MQ=255) tGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCt > 2:1342650/1‑93 (MQ=255) gACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCtt > 1:7250792/1‑93 (MQ=255) cGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTaa > 2:6367775/1‑93 (MQ=255) cGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTaa < 2:4281614/93‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAg < 1:8601/93‑1 (MQ=255) aaGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgc > 2:4761265/1‑93 (MQ=255) aGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgct > 2:194262/1‑93 (MQ=255) aGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgct > 1:4653827/1‑93 (MQ=255) ccGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgctgc < 1:1790643/93‑1 (MQ=255) cGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgctgct > 2:2917458/1‑93 (MQ=255) cGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgctgct < 2:3971826/93‑1 (MQ=255) ggTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGctgctg < 1:5370573/93‑1 (MQ=255) ggTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGctgctg > 1:2579606/1‑93 (MQ=255) ggTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGctgctg > 2:1884844/1‑93 (MQ=255) gTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTgg > 2:6123591/1‑93 (MQ=255) gTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTgg > 2:7424285/1‑93 (MQ=255) gTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTgg > 1:136643/1‑93 (MQ=255) gTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTgg > 2:4613678/1‑93 (MQ=255) tAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGga > 1:1295122/1‑93 (MQ=255) aaCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGgaga > 2:3302158/1‑93 (MQ=255) aaCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGgaga > 2:5137349/1‑93 (MQ=255) aaCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGgaga < 1:360886/93‑1 (MQ=255) aCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaa > 1:440476/1‑93 (MQ=255) aCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaa > 1:1970525/1‑93 (MQ=255) aaGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAag > 2:7933/1‑93 (MQ=255) aGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagc < 1:6084454/93‑1 (MQ=255) gCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagca < 1:4218212/93‑1 (MQ=255) gCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagca < 2:5477070/93‑1 (MQ=255) cAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagcag < 2:3198242/93‑1 (MQ=255) aaTTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagcagc > 1:4763859/1‑93 (MQ=255) aaTTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAtgcagc > 1:4844365/1‑93 (MQ=255) aTTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGcc < 1:7421083/93‑1 (MQ=255) aTTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGcc > 1:2866207/1‑93 (MQ=255) ttCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCa > 1:594846/1‑93 (MQ=255) ttCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCa < 1:5853734/93‑1 (MQ=255) ttCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCa > 1:5295010/1‑93 (MQ=255) cGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCaaa < 2:1408041/93‑1 (MQ=255) cGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCaaa < 2:7038908/93‑1 (MQ=255) cGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCaaa < 1:3912836/93‑1 (MQ=255) gTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAg > 1:158112/1‑93 (MQ=255) gACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTg > 1:1059288/1‑93 (MQ=255) aCGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGa < 1:964088/93‑1 (MQ=255) aCGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGa < 1:2074003/93‑1 (MQ=255) cgccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGAt < 1:2247984/93‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATg > 2:2455251/1‑93 (MQ=255) gccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATg > 1:7318490/1‑93 (MQ=255) cgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATggg < 1:1472947/93‑1 (MQ=255) gcTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGt > 2:7523928/1‑93 (MQ=255) cTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTg > 2:3142807/1‑93 (MQ=255) cTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTg > 2:2663876/1‑93 (MQ=255) cTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTg > 1:2211210/1‑93 (MQ=255) | TCGCTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTGA > NC_000913/28639‑28819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |