| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 487,376 | T→C | G539G (GGT→GGC) | aefA → | putative alpha helix protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 487,376 | 0 | T | C | 87.5% | 636.4 / 68.1 | 256 | G539G (GGT→GGC) | aefA | putative alpha helix protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/16); new base C (119/104); total (136/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGT > NC_000913/487284‑487468 | tGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTc > 1:448149/1‑93 (MQ=255) tGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTc > 1:4820531/1‑93 (MQ=255) ggTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTcc > 2:2148280/1‑93 (MQ=255) gTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTccc > 1:805453/1‑93 (MQ=255) gTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTccc < 1:2134516/93‑1 (MQ=255) tttGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGCATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGGCCCCt > 1:4022394/1‑93 (MQ=255) cGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTa < 1:3393415/93‑1 (MQ=255) cGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTa > 2:1431474/1‑93 (MQ=255) gctgctGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTaa < 2:4666442/93‑1 (MQ=255) gctgctGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTaa > 2:2449490/1‑93 (MQ=255) gctgctGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTaa < 2:6608419/93‑1 (MQ=255) ctgctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAAc < 1:1843170/93‑1 (MQ=255) ctgctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAAc > 1:3795457/1‑93 (MQ=255) ctgctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAAc < 1:351969/93‑1 (MQ=255) tgctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACg > 1:3750417/1‑93 (MQ=255) tgctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACg > 1:7337681/1‑93 (MQ=255) gctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGa < 2:3879449/93‑1 (MQ=255) ctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAc < 1:6149416/93‑1 (MQ=255) ctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAc < 2:7103527/93‑1 (MQ=255) ctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAc < 2:1255146/93‑1 (MQ=255) ctgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAc < 2:6937137/93‑1 (MQ=255) tgTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAca > 2:2965150/1‑93 (MQ=255) ttGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGAcagc < 2:7452580/93‑1 (MQ=255) ttGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAcagc < 1:296088/93‑1 (MQ=255) ttGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCCGTGGGCTCCCTGCGTAACGAcagc < 2:7359610/93‑1 (MQ=255) gATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAcagcca < 1:7039581/93‑1 (MQ=255) gATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAcagcca > 1:6587783/1‑93 (MQ=255) aTTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGAcagccag > 2:5584069/1‑93 (MQ=255) tGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCt < 2:4317041/93‑1 (MQ=255) ggCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAaca > 1:5459080/1‑93 (MQ=255) gCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAacac < 1:1005424/93‑1 (MQ=255) gCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAacac < 2:3349862/93‑1 (MQ=255) cTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAacaca > 2:2032410/1‑93 (MQ=255) cTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAacaca > 2:5462263/1‑93 (MQ=255) gATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACAcc > 2:5941985/1‑93 (MQ=255) aTCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCa > 2:7200143/1‑93 (MQ=255) tCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaa > 1:5806707/1‑93 (MQ=255) ccACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaaa < 1:5875740/93‑1 (MQ=255) cACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaaaa < 2:5151429/93‑1 (MQ=255) cACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaaaa < 2:1691968/93‑1 (MQ=255) cACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCaaaa < 2:6253715/93‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAg < 2:2873438/93‑1 (MQ=255) tGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCg > 1:1929152/1‑93 (MQ=255) gCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGAt > 1:5094932/1‑93 (MQ=255) gCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGAt < 1:4878055/93‑1 (MQ=255) gCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGAt > 1:2230411/1‑93 (MQ=255) gCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGAt < 1:7448172/93‑1 (MQ=255) cGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATc < 2:3318035/93‑1 (MQ=255) gTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGTTcc > 2:6376796/1‑93 (MQ=255) gTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATcc < 2:4809293/93‑1 (MQ=255) tCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCt > 2:1026448/1‑93 (MQ=255) tCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCt > 1:1107322/1‑93 (MQ=255) ggctggctGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATc > 1:3667016/1‑93 (MQ=255) ggctggctGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATc < 2:4200780/93‑1 (MQ=255) gctggctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATcc > 2:3009429/1‑92 (MQ=255) gctggctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCg > 2:3193823/1‑93 (MQ=255) ctggctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGa < 1:3162683/93‑1 (MQ=255) tggctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGAc < 1:7155029/93‑1 (MQ=255) ggctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGAcc > 2:3724656/1‑93 (MQ=255) gctgAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCt < 1:1173388/93‑1 (MQ=255) gAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGAt > 1:3536536/1‑93 (MQ=255) gAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGAt > 2:4966649/1‑93 (MQ=255) gAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGAt > 1:2819780/1‑93 (MQ=255) gAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGAt > 1:7010466/1‑93 (MQ=255) gAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGAt > 1:7114390/1‑93 (MQ=255) aaaGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATc < 1:3265558/93‑1 (MQ=255) aaGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATcc < 1:6449561/93‑1 (MQ=255) aaGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATcc > 2:1358133/1‑93 (MQ=255) aaGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATcc < 1:469841/93‑1 (MQ=255) aGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCg > 1:1400927/1‑93 (MQ=255) gCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGt < 2:6390538/93‑1 (MQ=255) gCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGt < 1:2658655/93‑1 (MQ=255) cGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTg < 2:641420/93‑1 (MQ=255) gTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTgc < 2:2512270/93‑1 (MQ=255) gTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTgc > 1:2897868/1‑93 (MQ=255) gTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTgc > 1:3987758/1‑93 (MQ=255) tCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCt < 1:4622788/93‑1 (MQ=255) tCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCt > 2:1798138/1‑93 (MQ=255) aacaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGc < 2:3568595/93‑1 (MQ=255) aacaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGc > 2:2769173/1‑93 (MQ=255) aacaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGc > 2:6800309/1‑93 (MQ=255) aacaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGc < 1:6581566/93‑1 (MQ=255) acaaAAACTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGcc < 1:1500937/93‑1 (MQ=255) aaaaCTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgt < 1:6312045/93‑1 (MQ=255) aaaaCTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgt > 1:6638539/1‑93 (MQ=255) aaaaCTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgt < 1:6199174/93‑1 (MQ=255) aaaCTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGgtg < 2:3070528/93‑1 (MQ=255) aCTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGtgtg > 1:5002274/1‑93 (MQ=255) aCTGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCCGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGtgtg > 1:2253992/1‑93 (MQ=255) tGGCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGcc > 2:6541887/1‑93 (MQ=255) ggCTTCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCt > 2:1130009/1‑93 (MQ=255) tCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGatt < 2:4081430/93‑1 (MQ=255) tCCGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGatt < 2:896562/93‑1 (MQ=255) cGCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGattat > 1:2424778/1‑93 (MQ=255) gCTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCCTGCGCTGCCGGTGTGCCTGattatt > 2:3440397/1‑93 (MQ=255) cTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATtc > 2:5674499/1‑93 (MQ=255) cTGTGGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATtc > 1:1241128/1‑93 (MQ=255) tgtgGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATtct > 2:5861757/1‑93 (MQ=255) gtgGGCTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATtctc < 1:4239129/93‑1 (MQ=255) gTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCgg > 1:5138053/1‑93 (MQ=255) | GCTGGTTTGCCGCTGCTGTTGATTGCCGGGCTGATCCACTGGCGTCTGGGCTGGCTGAAAGCGTATCAACAAAAACTGGCTTCCGCTGTGGGTTCCCTGCGTAACGACAGCCAGCTCAACACACCAAAAGCGATCCTTATCGACCTGATCCGTGCGCTGCCGGTGTGCCTGATTATTCTCGCGGT > NC_000913/487284‑487468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |