Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,118,257 | T→C | A357A (GCA→GCG) | hslU ← | heat shock protein hslVU ATPase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,118,257 | 0 | T | C | 84.2% | 749.5 / 131.2 | 330 | A357A (GCA→GCG) | hslU | heat shock protein hslVU ATPase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/22); new base C (138/140); total (168/162) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.37e-01 |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
TCGGTAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAACGCGGATTG > NC_000913/4118165‑4118348 | ggTAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAgcgc > 2:6866279/1‑93 (MQ=255) ggTAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAgcgc < 2:4868376/93‑1 (MQ=255) gTAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCt > 1:1516967/1‑93 (MQ=255) gTAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCt > 2:712257/1‑93 (MQ=255) tAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCtt < 2:3616178/93‑1 (MQ=255) tAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCtt < 1:4998877/93‑1 (MQ=255) aGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCttt > 1:1235568/1‑93 (MQ=255) gATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTg > 1:3389908/1‑93 (MQ=255) aTTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGt < 2:2924381/93‑1 (MQ=255) aTTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGt < 2:201293/93‑1 (MQ=255) ttCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTa < 1:2607558/93‑1 (MQ=255) ttCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTa < 1:7008459/93‑1 (MQ=255) tCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTAc < 2:899056/93‑1 (MQ=255) tCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTAc < 2:7510364/93‑1 (MQ=255) tCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTAc < 1:7149207/93‑1 (MQ=255) cGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACt < 2:6427555/93‑1 (MQ=255) gTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTg < 1:7512153/93‑1 (MQ=255) ttCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGc > 2:4519340/1‑93 (MQ=255) ttCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGc > 2:100914/1‑93 (MQ=255) tCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCa > 1:2361441/1‑93 (MQ=255) tCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCa < 2:5429499/93‑1 (MQ=255) cACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCAc > 2:4677382/1‑93 (MQ=255) cACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCAc < 1:5152843/93‑1 (MQ=255) aCCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACg < 2:3548094/93‑1 (MQ=255) ccTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACgg < 1:2025902/93‑1 (MQ=255) ccTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACgg > 2:7236132/1‑93 (MQ=255) tGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTg < 2:262655/93‑1 (MQ=255) gCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGa < 2:4924244/93‑1 (MQ=255) tGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATaga > 1:6820590/1‑93 (MQ=255) tGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATaga < 2:1297300/93‑1 (MQ=255) gCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATagag > 1:2498436/1‑93 (MQ=255) gCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATagag < 2:6116836/93‑1 (MQ=255) ccGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAgg > 2:5141111/1‑93 (MQ=255) cGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGc < 1:4600745/93‑1 (MQ=255) gCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCa > 2:2528497/1‑93 (MQ=255) cTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCAt > 2:314242/1‑93 (MQ=255) tCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTc < 1:5306903/93‑1 (MQ=255) tCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTc > 1:4714031/1‑93 (MQ=255) ccGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCg > 1:1083324/1‑93 (MQ=255) ccGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCg < 1:640372/93‑1 (MQ=255) gcgATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGc > 2:7097530/1‑93 (MQ=255) gATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTc < 1:7328291/93‑1 (MQ=255) gTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCa < 2:6012521/93‑1 (MQ=255) gTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCa < 1:4126980/93‑1 (MQ=255) tttAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAg > 1:330796/1‑93 (MQ=255) tAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGaa < 2:6303069/93‑1 (MQ=255) aaTACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAAt > 2:1880969/1‑93 (MQ=255) tACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATAc < 2:4829310/93‑1 (MQ=255) aCCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACg < 1:314729/93‑1 (MQ=255) ccGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGc < 1:6693186/93‑1 (MQ=255) cGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCt < 1:4399801/93‑1 (MQ=255) cGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCt < 2:1790535/93‑1 (MQ=255) aGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGa > 1:6297444/1‑93 (MQ=255) gTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGaa < 2:5928323/93‑1 (MQ=255) tCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAg > 2:5309976/1‑93 (MQ=255) tCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAg < 2:4132340/93‑1 (MQ=255) ggTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTc > 2:2298797/1‑93 (MQ=255) ggTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTc > 1:6348123/1‑93 (MQ=255) ggTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTc > 1:6464335/1‑93 (MQ=255) tAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGc > 1:5599994/1‑93 (MQ=255) tAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGc > 2:3863434/1‑93 (MQ=255) aaaCTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCt < 1:2764589/93‑1 (MQ=255) aaaCTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCt < 1:5428841/93‑1 (MQ=255) aaCTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtg > 1:6034493/1‑93 (MQ=255) aCTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtgg < 2:6030210/93‑1 (MQ=255) cTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtggt < 2:1545838/93‑1 (MQ=255) tCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtggtg > 2:1184602/1‑93 (MQ=255) tCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtggtg > 2:5822069/1‑93 (MQ=255) cGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtggtgg < 1:4361987/93‑1 (MQ=255) cGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCtggtgg < 2:4655226/93‑1 (MQ=255) gATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTggtggt < 2:4221556/93‑1 (MQ=255) atatTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTc < 1:5725035/93‑1 (MQ=255) atatTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTCTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTc < 2:2187345/93‑1 (MQ=255) tatTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCa < 2:403824/93‑1 (MQ=255) tatTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCa < 1:1855150/93‑1 (MQ=255) tatTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCa < 1:373975/93‑1 (MQ=255) atTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAg > 2:6712408/1‑93 (MQ=255) tttACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAgc < 1:4004169/93‑1 (MQ=255) tttACGCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAgc > 2:6097602/1‑93 (MQ=255) aCGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGcc < 1:6070747/93‑1 (MQ=255) gCCTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTg > 1:3463375/1‑93 (MQ=255) ccTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGc < 2:1231286/93‑1 (MQ=255) cTTCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCa < 2:4615506/93‑1 (MQ=255) ttCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAg > 1:6525691/1‑93 (MQ=255) ttCAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAg > 2:5266538/1‑93 (MQ=255) cAGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGtt > 1:2671709/1‑93 (MQ=255) aGTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTc < 1:566671/93‑1 (MQ=255) gTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCa > 1:1716873/1‑93 (MQ=255) gTCGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCa < 2:3071280/93‑1 (MQ=255) cGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAc > 2:3735201/1‑93 (MQ=255) cGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAc < 1:7095060/93‑1 (MQ=255) cGCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAc > 1:4546529/1‑93 (MQ=255) gCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAcg > 1:3903335/1‑93 (MQ=255) gCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAcg > 1:5459984/1‑93 (MQ=255) gCCATCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAcg > 2:5647069/1‑93 (MQ=255) ccATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAAcgc < 2:6948880/93‑1 (MQ=255) aTCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAACGCgg > 1:5876829/1‑93 (MQ=255) tCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAACGCGGa > 2:3271874/1‑93 (MQ=255) tCAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAACGCGGa > 2:2378209/1‑93 (MQ=255) cAGCGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAACGCGGAt < 1:2972583/93‑1 (MQ=255) | TCGGTAGATTCGTTCACCTGCCATGCCGCTTCCGCGATGCGTTTAATACCGGAGTCGGTAAACTCGATATTTACGCCTTCAGTCGCCATCAGTGCTTTGTACTGCACGGTGATAGAGGCATTCGGCTCGGTCAGAATACGCTCGAAGTCGCTGGTGGTCAGCGCCTGCAGTTCAACGCGGATTG > NC_000913/4118165‑4118348 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |