Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,170,208 | T→C | G191G (GGT→GGC) | murB → | UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,170,208 | 0 | T | C | 83.6% | 727.5 / 127.0 | 325 | G191G (GGT→GGC) | murB | UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/30); new base C (127/144); total (151/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.30e-01 |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
TATTTTTAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGATCCAA > NC_000913/4170118‑4170299 | tATTTTTAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGa > 2:4839227/1‑93 (MQ=255) tATTTTTAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGa < 2:631623/93‑1 (MQ=255) aTTTTTAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGAc < 1:7099693/93‑1 (MQ=255) tttttAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACt > 2:384558/1‑93 (MQ=255) tttAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTa > 1:4751359/1‑93 (MQ=255) tAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAAc < 2:3003507/93‑1 (MQ=255) aaCATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTc > 1:2209996/1‑93 (MQ=255) aaCATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTc < 1:6632766/93‑1 (MQ=255) aCATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCg > 1:2964331/1‑93 (MQ=255) cATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGt < 1:3426703/93‑1 (MQ=255) aTGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTc > 2:1444185/1‑93 (MQ=255) aTGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTc < 1:271430/93‑1 (MQ=255) aTGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTc < 2:2604121/93‑1 (MQ=255) tGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCt < 1:4694280/93‑1 (MQ=255) tGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCt > 1:1040261/1‑93 (MQ=255) tGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCt > 1:68006/1‑93 (MQ=255) aaTACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑gg > 2:6830604/1‑93 (MQ=255) aTACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGa > 1:805386/1‑93 (MQ=255) aTACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGa < 2:3650522/93‑1 (MQ=255) aTACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGa < 2:909704/93‑1 (MQ=255) ccAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATcc > 2:5724250/1‑93 (MQ=255) cAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCt > 2:2548536/1‑93 (MQ=255) ggACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTac > 2:769632/1‑93 (MQ=255) ggACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTac > 1:4543909/1‑93 (MQ=255) ggACCGCTTCACTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTac < 2:660111/93‑1 (MQ=255) ccGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTacaac > 2:2890358/1‑93 (MQ=255) gCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAg > 1:4198573/1‑93 (MQ=255) cTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGt > 1:4125562/1‑93 (MQ=255) ttCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTa > 1:5192190/1‑93 (MQ=255) tCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTaa < 2:6285472/93‑1 (MQ=255) tCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTaa < 2:227497/93‑1 (MQ=255) cGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAAc < 2:5964798/93‑1 (MQ=255) cTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGc < 2:4030529/93‑1 (MQ=255) cTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGc > 2:361928/1‑93 (MQ=255) aTTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCca < 2:168530/93‑1 (MQ=255) aTTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCca < 2:3263835/93‑1 (MQ=255) aTTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCca < 2:418914/93‑1 (MQ=255) ttGTAGCCGTAGGTCTGTGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCcac > 1:3616356/1‑93 (MQ=255) ttGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCcac < 1:5121674/93‑1 (MQ=255) tGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCcaca < 1:383142/93‑1 (MQ=255) tGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCcaca < 2:1496371/93‑1 (MQ=255) gTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAg < 1:3909816/93‑1 (MQ=255) ccGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAg < 1:620822/93‑1 (MQ=255) cGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGt > 1:658068/1‑93 (MQ=255) gTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTa < 1:4844443/93‑1 (MQ=255) gTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTa > 1:754518/1‑93 (MQ=255) tAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTAt > 2:3143802/1‑93 (MQ=255) aGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTAtt < 2:5651385/93‑1 (MQ=255) aGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTAtt < 2:580218/93‑1 (MQ=255) aGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGCAtt < 1:6977049/93‑1 (MQ=255) ggTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTAttt > 2:5335659/1‑93 (MQ=255) ggTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTAttt > 2:109718/1‑93 (MQ=255) ggTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTAttt < 1:2168304/93‑1 (MQ=255) tctgcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTaa < 2:6876938/93‑1 (MQ=255) ctgcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAAt > 1:3317142/1‑93 (MQ=255) tgcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGGGACTTAACTCGTCT‑GGCTCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATg > 1:1853239/1‑93 (MQ=255) tgcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATg < 1:1094973/93‑1 (MQ=255) tgcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATg > 2:2079903/1‑93 (MQ=255) gcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACGACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGc < 1:6001055/93‑1 (MQ=255) gcgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGc < 2:3947947/93‑1 (MQ=255) cgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCg < 2:1276386/93‑1 (MQ=255) cgtctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCg < 1:2754693/93‑1 (MQ=255) tctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgt < 2:5441862/93‑1 (MQ=255) tctgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTAATATCGTATGGCGTCTTCTCTTTGAA‑AGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgt > 2:6938874/1‑93 (MQ=255) tgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgtgt > 1:5882009/1‑93 (MQ=255) tgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgtgt > 2:4582938/1‑93 (MQ=255) tgcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgtgt > 2:5211887/1‑93 (MQ=255) gcCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgtgtg > 2:191880/1‑93 (MQ=255) ccAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgtgtgt > 1:2778640/1‑93 (MQ=255) ccAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGgtgtgt > 1:3175765/1‑93 (MQ=255) aaaaGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCa > 2:1176740/1‑93 (MQ=255) aaaGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCat > 1:2315201/1‑93 (MQ=255) aaGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCata > 1:5447362/1‑93 (MQ=255) aaGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCata < 1:7417382/93‑1 (MQ=255) agagTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCatat > 2:4896767/1‑93 (MQ=255) gagTGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATg < 1:1509570/93‑1 (MQ=255) tGGCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATgcgc > 1:5653532/1‑93 (MQ=255) gCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGcac < 2:845438/93‑1 (MQ=255) gCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGcac < 1:6060241/93‑1 (MQ=255) gCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGcac > 1:7285805/1‑93 (MQ=255) gCAACCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGcac < 2:275521/93‑1 (MQ=255) aCCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGcaccac > 1:2062626/1‑93 (MQ=255) aCCTGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGcaccac < 1:3950042/93‑1 (MQ=255) cTGTACTAACGTATGGCGACTTTACTCGTTTGGGTTCTTACAAAGGAAACCCCCAACAAAGAATTAATTCCGGGGTGTCATATGCGcaccaca > 1:2365101/1‑92 (MQ=255) tGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCaa > 1:4022184/1‑93 (MQ=255) tGTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCaa > 2:6127531/1‑93 (MQ=255) gTACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCaaa < 2:7140698/93‑1 (MQ=255) tACTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAAc > 1:6325598/1‑93 (MQ=255) aCTAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCGCCACCAAACt < 1:4972681/93‑1 (MQ=255) tAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTcc < 2:3449814/93‑1 (MQ=255) tAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTcc > 2:5036277/1‑93 (MQ=255) tAACGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTcc < 1:2876741/93‑1 (MQ=255) cGTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTg < 2:7444576/93‑1 (MQ=255) gTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGa < 1:1260352/93‑1 (MQ=255) gTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGa < 1:2447036/93‑1 (MQ=255) gTATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGa > 2:4339908/1‑93 (MQ=255) tATGGTGAGTTATCGCGTGT‑GGATGCGACCGGAGTAAAGCAACAGCAAGTGTTTACTGGGGTGTGCAATATGCGTTCCACCAAACTCCCTGac < 1:1957662/93‑2 (MQ=255) tATGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGAt > 2:4053862/1‑93 (MQ=255) aTGGCGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGATc < 2:5571453/93‑1 (MQ=255) gTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGATCCaa > 1:266164/1‑93 (MQ=255) | TATTTTTAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCT‑GGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAAGTATTTAATGCGGTGTGTCATATGCGCACCACCAAACTCCCTGATCCAA > NC_000913/4170118‑4170299 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |