Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,362,298 | T→C | Q108R (CAG→CGG) | dsbD ← | thiol:disulfide interchange protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,362,298 | 0 | T | C | 83.5% | 690.9 / 128.9 | 316 | Q108R (CAG→CGG) | dsbD | thiol:disulfide interchange protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/27); new base C (125/139); total (150/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > NC_000913/4362206‑4362387 | acggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGt > 1:1492083/1‑93 (MQ=255) acggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGt < 2:2410192/93‑1 (MQ=255) ggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTCAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTg < 2:2353966/93‑1 (MQ=255) aacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGAt < 2:2422448/93‑1 (MQ=255) acggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATg < 2:4846725/93‑1 (MQ=255) acggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATg < 1:2021708/93‑1 (MQ=255) cggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAAACGGCATCAACACAGCCCTGGGAGGGGACAGTTAACGTCGCTTCCGGACTCGCCCGGTTggttg > 1:6146855/1‑89 (MQ=255) ggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGt > 2:1108007/1‑93 (MQ=255) gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTg > 1:3021942/1‑93 (MQ=255) gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTg > 1:4212341/1‑93 (MQ=255) ttttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGa > 1:4084425/1‑93 (MQ=255) ttttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGa < 1:3286162/93‑1 (MQ=255) tttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGAc > 2:2703292/1‑93 (MQ=255) ttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACg < 2:6220897/93‑1 (MQ=255) gTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGa < 2:6108333/93‑1 (MQ=255) tttCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGaa > 1:1155265/1‑93 (MQ=255) tCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGc > 1:2433482/1‑93 (MQ=255) tCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGc < 1:1628120/93‑1 (MQ=255) cTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCg < 2:6430380/93‑1 (MQ=255) tGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGt > 1:1343244/1‑93 (MQ=255) ggCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTc > 1:693676/1‑93 (MQ=255) ggCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTc < 1:2611135/93‑1 (MQ=255) ggCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTc < 2:3626145/93‑1 (MQ=255) ggATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGc < 2:7489790/93‑1 (MQ=255) ggATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGc > 1:5457820/1‑93 (MQ=255) gATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGcc < 1:911017/93‑1 (MQ=255) aTAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCg > 2:1387430/1‑93 (MQ=255) tAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGa > 2:4139009/1‑93 (MQ=255) tAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGa > 2:4749411/1‑93 (MQ=255) aaCAGAGACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGAt > 2:6988216/1‑93 (MQ=255) aCAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATc > 1:4456773/1‑93 (MQ=255) aCAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATc < 2:7189253/93‑1 (MQ=255) cAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcg > 2:6019707/1‑93 (MQ=255) aGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgc < 2:12425/93‑1 (MQ=255) aaaaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgcg < 1:6387099/92‑1 (MQ=255) ccGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTaa < 2:4457958/93‑1 (MQ=255) aTCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtctc > 2:1524840/1‑93 (MQ=255) aTCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtctc > 2:5741297/1‑93 (MQ=255) cAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGc > 2:5317939/1‑93 (MQ=255) cAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGc < 1:7257480/93‑1 (MQ=255) aGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCt < 1:5393272/93‑1 (MQ=255) gCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt < 2:6301751/93‑1 (MQ=255) gCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt > 1:3624725/1‑93 (MQ=255) gCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt < 1:4932321/93‑1 (MQ=255) cacaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCttt > 2:3864984/1‑93 (MQ=255) cacaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCttt < 1:2761301/93‑1 (MQ=255) cacaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCttt < 1:442383/93‑1 (MQ=255) acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 1:4122909/93‑1 (MQ=255) acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 2:3163011/93‑1 (MQ=255) acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt > 2:1320601/1‑93 (MQ=255) acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 1:3866110/93‑1 (MQ=255) acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 1:3730648/93‑1 (MQ=255) caGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTg > 1:7128088/1‑93 (MQ=255) aGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGc < 1:5835331/93‑1 (MQ=255) aGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGc < 2:2748346/93‑1 (MQ=255) ccTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGt > 1:6662824/1‑93 (MQ=255) cTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTa > 2:6523679/1‑93 (MQ=255) tGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaa > 1:5016117/1‑93 (MQ=255) gTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaaa < 1:5918830/93‑1 (MQ=255) tAGGTGACAGTTAACGTTGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAc > 2:2186112/1‑93 (MQ=255) tAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAc > 2:4412765/1‑93 (MQ=255) ggTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTc > 1:1928572/1‑93 (MQ=255) gTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCa < 2:5087347/93‑1 (MQ=255) gTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCa > 2:1448914/1‑93 (MQ=255) tGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCAt > 2:7353413/1‑93 (MQ=255) tGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCAt > 2:4678196/1‑93 (MQ=255) gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc < 1:631206/93‑1 (MQ=255) gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc > 2:4119873/1‑93 (MQ=255) gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc > 2:4252759/1‑93 (MQ=255) aCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCt > 2:594131/1‑93 (MQ=255) aCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCt > 2:6781076/1‑93 (MQ=255) aCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCt < 2:4535122/93‑1 (MQ=255) cAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCtt > 2:302133/1‑93 (MQ=255) cAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCtt < 1:1775164/93‑1 (MQ=255) cAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCtt > 2:1809710/1‑93 (MQ=255) gTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCa < 1:3568782/93‑1 (MQ=255) gTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCa < 2:6885384/93‑1 (MQ=255) gTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCa > 2:7404005/1‑93 (MQ=255) aaCGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGc > 2:2869/1‑93 (MQ=255) aCGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGcc > 1:5547135/1‑93 (MQ=255) tCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGa > 2:924463/1‑93 (MQ=255) tCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGa < 1:3202561/93‑1 (MQ=255) cGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGAc < 1:7020695/93‑1 (MQ=255) gCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACg > 1:1385439/1‑93 (MQ=255) gCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACg > 2:3458829/1‑93 (MQ=255) tCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGcc < 2:1965880/93‑1 (MQ=255) tCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGcc > 2:3745615/1‑93 (MQ=255) ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt > 1:3012485/1‑93 (MQ=255) gcccTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc < 1:5957906/90‑1 (MQ=255) gCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc > 2:2910051/1‑93 (MQ=255) gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc > 1:2902003/1‑93 (MQ=255) gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc < 1:818846/93‑1 (MQ=255) cACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCg < 1:4674323/93‑1 (MQ=255) cACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCg < 2:5164986/93‑1 (MQ=255) cACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCg < 2:5819189/93‑1 (MQ=255) cTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGc > 2:4036085/1‑93 (MQ=255) tCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCa < 1:2266075/93‑1 (MQ=255) gCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc < 1:4870093/93‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc > 2:2616266/1‑93 (MQ=255) gCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc < 2:3300483/93‑1 (MQ=255) | TTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > NC_000913/4362206‑4362387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |