| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,386,329 | C→T | R207H (CGC→CAC) | yjeP ← | putative periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,386,329 | 0 | C | T | 75.8% | 623.3 / 179.2 | 311 | R207H (CGC→CAC) | yjeP | putative periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/31); new base T (120/115); total (165/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.40e-02 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGC > NC_000913/4386237‑4386421 | cTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTaa < 1:1067206/93‑1 (MQ=255) cTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTaa < 1:2725386/93‑1 (MQ=255) tCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGTCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAg < 2:1953021/93‑1 (MQ=255) tCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAg < 1:6820855/93‑1 (MQ=255) cAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAgc < 1:6317054/93‑1 (MQ=255) cAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAgc < 1:907538/93‑1 (MQ=255) aGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAgcgc < 2:4364248/93‑1 (MQ=255) tGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCt > 1:4421758/1‑93 (MQ=255) gACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTa > 2:703081/1‑93 (MQ=255) aCGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTaa < 2:6627868/93‑1 (MQ=255) aCGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTaa < 2:4026435/93‑1 (MQ=255) aCGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTaa < 2:391478/93‑1 (MQ=255) gTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAAtt > 1:140957/1‑93 (MQ=255) gTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAAtt > 1:4113217/1‑93 (MQ=255) ttGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTc < 1:1334387/93‑1 (MQ=255) tGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTcc < 1:7159709/93‑1 (MQ=255) tGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTcc > 2:2980955/1‑93 (MQ=255) tGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTcc < 2:7198661/93‑1 (MQ=255) tGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTcc < 1:4515322/93‑1 (MQ=255) ggCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCt < 2:1556834/93‑1 (MQ=255) ggCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCt < 2:2192954/93‑1 (MQ=255) cTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTgg < 2:905635/93‑1 (MQ=255) tttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCgg < 2:3419803/93‑1 (MQ=255) tttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCgg > 1:5334368/1‑93 (MQ=255) ttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGt > 1:2175834/1‑93 (MQ=255) ttAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGt > 1:5113169/1‑93 (MQ=255) aaTTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTa < 1:3650311/93‑1 (MQ=255) aaTTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTa > 1:313058/1‑93 (MQ=255) aaTTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTa < 1:1967867/93‑1 (MQ=255) aaTTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTa < 1:601769/93‑1 (MQ=255) gATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTgg < 2:5661635/93‑1 (MQ=255) aTTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGc < 2:55111/93‑1 (MQ=255) aCGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGa < 2:796597/93‑1 (MQ=255) cGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGAc < 1:2905681/93‑1 (MQ=255) cGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGAc < 2:4997463/93‑1 (MQ=255) gCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACa < 2:1413871/93‑1 (MQ=255) gCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACa > 2:1718586/1‑93 (MQ=255) gCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACa < 2:1789364/93‑1 (MQ=255) cAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAg < 1:4279218/93‑1 (MQ=255) ggCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTg < 1:7216677/93‑1 (MQ=255) ggCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTg > 1:2994697/1‑93 (MQ=255) gCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTgc > 1:7106499/1‑93 (MQ=255) cTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTgcgc < 1:3570905/93‑1 (MQ=255) tGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGcc < 2:4931326/93‑1 (MQ=255) tGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGcc > 2:5809732/1‑93 (MQ=255) gCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCa > 1:6604608/1‑93 (MQ=255) aaTACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCt > 2:1039713/1‑93 (MQ=255) aaTACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCt > 2:2815062/1‑93 (MQ=255) aaTACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCt > 2:5175896/1‑93 (MQ=255) tACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTcc > 1:5805940/1‑93 (MQ=255) aCGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCa < 1:1825636/93‑1 (MQ=255) cGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAg > 2:5395881/1‑93 (MQ=255) gCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGt < 1:3258427/93‑1 (MQ=255) gCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGt > 2:666044/1‑93 (MQ=255) cATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGtt < 2:73352/93‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtca > 1:4624506/1‑93 (MQ=255) cAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatc > 1:3720937/1‑93 (MQ=255) cAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatc > 1:6367038/1‑93 (MQ=255) cAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatc < 1:93500/93‑1 (MQ=255) aGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTtcatca > 1:1644470/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAAc > 1:2824237/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAAc > 1:1037415/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAAc > 1:2056389/1‑93 (MQ=255) gCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGa < 2:4483423/93‑1 (MQ=255) gCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGa > 1:781040/1‑93 (MQ=255) tGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAgc > 2:510797/1‑93 (MQ=255) tGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAgc > 1:3360934/1‑93 (MQ=255) ggCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAgcg > 1:3963238/1‑93 (MQ=255) gCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAgcgc > 2:4106944/1‑93 (MQ=255) ctctctTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGcc > 1:7429093/1‑93 (MQ=255) tctctTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCTCCt < 1:6980094/93‑1 (MQ=255) ctctTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCtt < 2:5915867/93‑1 (MQ=255) ctctTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCtt > 1:2671914/1‑93 (MQ=255) ctctTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCtt > 2:6814171/1‑93 (MQ=255) tctTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTa < 1:2574085/93‑1 (MQ=255) ctTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTaa < 1:487972/93‑1 (MQ=255) ctTTTTCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTaa < 2:3769520/93‑1 (MQ=255) tttttCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAg > 1:6253588/1‑93 (MQ=255) tttttCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAg < 1:5556686/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACg < 2:3161460/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTg < 2:6020629/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAATTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTg > 1:7530443/1‑93 (MQ=255) cGCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGc > 2:265067/1‑93 (MQ=255) gCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCa > 1:3195934/1‑93 (MQ=255) gCCAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCa > 1:5443729/1‑93 (MQ=255) cAGCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCaga < 1:2390856/93‑1 (MQ=255) cAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCCACGAGCGCCTTAAGACGTGCaga > 1:6682328/1‑93 (MQ=255) gCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGt > 2:6379744/1‑93 (MQ=255) gCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGt < 2:7120743/93‑1 (MQ=255) gCTCTGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGt > 2:3592850/1‑93 (MQ=255) ctctGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTc > 1:1909730/1‑93 (MQ=255) ctctGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTc < 2:570766/93‑1 (MQ=255) tctGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCa < 2:1217100/93‑1 (MQ=255) tctGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCa > 2:2488570/1‑93 (MQ=255) tctGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCa > 1:5734257/1‑93 (MQ=255) tGAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGa > 2:4781107/1‑93 (MQ=255) gAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGAc < 1:5147658/93‑1 (MQ=255) gAGTGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGAc < 1:651507/93‑1 (MQ=255) gAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGAc > 1:5506535/1‑93 (MQ=255) cGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGc < 2:6352812/93‑1 (MQ=255) | CCGCCTCAAGCTGACGTTGGCTGTTTAATTGATTACGCAAGGCCTGCAAATACGCATCCAGTTGCTGGCTCTCTTTTTCCGCCAGCTCTGAGCGTAAGCGCGCTAATTCCTGGCGGTTATTGGCAGACAGCTGCGCCAGCTCCAGTTCATCAACGAGCGCCTTAAGACGTGCAGAGTCAGACTGC > NC_000913/4386237‑4386421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |