Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,555,245 | T→C | Y205C (TAC→TGC) | yjiE ← | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,555,245 | 0 | T | C | 87.0% | 757.5 / 90.4 | 301 | Y205C (TAC→TGC) | yjiE | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/16); new base C (133/129); total (156/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.16e-01 |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
TTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAA > NC_000913/4555155‑4555336 | tttAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAg > 1:4459551/1‑93 (MQ=255) tAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGa < 2:365170/93‑1 (MQ=255) tAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGa < 1:6941591/93‑1 (MQ=255) tAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGa > 2:744245/1‑93 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt > 1:4343284/1‑93 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt < 1:3110676/93‑1 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt > 2:2245579/1‑93 (MQ=255) aGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTg < 2:4667629/93‑1 (MQ=255) gctcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTGACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGc < 2:7256472/93‑1 (MQ=255) gctcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGCTGc > 2:5810785/1‑93 (MQ=255) gctcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGc > 2:4816460/1‑93 (MQ=255) tcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCgg > 1:5218682/1‑93 (MQ=255) tcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGAGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCgg > 2:1464130/1‑93 (MQ=255) tcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGt > 1:437686/1‑93 (MQ=255) tcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGt > 2:1931747/1‑93 (MQ=255) cATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTa > 2:2120202/1‑93 (MQ=255) aTCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTaa < 1:7106949/93‑1 (MQ=255) aTCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTaa > 1:5460531/1‑93 (MQ=255) tCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAAt > 1:7401733/1‑93 (MQ=255) cGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAAtt < 1:1296034/93‑1 (MQ=255) gAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTc > 2:5382511/1‑93 (MQ=255) aaGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGCAATTCa < 2:6988238/93‑1 (MQ=255) agaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTa > 1:1007982/1‑93 (MQ=255) agaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTa > 1:6102986/1‑93 (MQ=255) gaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTaa < 1:4747940/93‑1 (MQ=255) gaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTaa < 1:1390385/93‑1 (MQ=255) gaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCACGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTaa < 2:6416312/93‑1 (MQ=255) aCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAAc > 1:1158234/1‑93 (MQ=255) cAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACg < 2:5874922/93‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACgg > 2:5031233/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACgg > 1:5076658/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACgg < 1:3029312/93‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGa > 2:4091835/1‑93 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGa < 2:5747770/93‑1 (MQ=255) aaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaa > 2:3794502/1‑93 (MQ=255) aaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaa < 2:3493737/93‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaaa < 2:6883746/93‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaaa < 1:3998783/93‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaaa > 1:1691749/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgt > 2:5644430/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgt > 1:1768307/1‑93 (MQ=255) gTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtgt > 1:4550120/1‑93 (MQ=255) gTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtgt < 1:6448004/93‑1 (MQ=255) gTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtgt > 2:2386303/1‑93 (MQ=255) tGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGtgtg > 2:3413861/1‑93 (MQ=255) gCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTgg < 2:5781467/93‑1 (MQ=255) cTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc < 1:4944528/93‑1 (MQ=255) cTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc < 1:1462100/93‑1 (MQ=255) tGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCt < 1:6003049/93‑1 (MQ=255) aaCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcg > 1:3254441/1‑93 (MQ=255) aaCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcg > 2:7515725/1‑93 (MQ=255) aCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcgc > 1:985909/1‑93 (MQ=255) aCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcgc > 2:6732500/1‑93 (MQ=255) ttAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCACCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGa < 2:7098096/93‑1 (MQ=255) aCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGt > 1:3584319/1‑93 (MQ=255) aCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGt > 1:2645932/1‑93 (MQ=255) tCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTa > 1:386444/1‑93 (MQ=255) cACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaa < 2:1801756/93‑1 (MQ=255) cACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaa > 1:813149/1‑93 (MQ=255) aCTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaa > 2:2459825/1‑93 (MQ=255) aCTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaa > 2:2767764/1‑93 (MQ=255) tgtgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaaa > 1:2199522/1‑93 (MQ=255) tCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtctc < 1:4137833/93‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc < 1:6335298/93‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTcc < 2:4440112/93‑1 (MQ=255) aGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCg > 2:2586653/1‑93 (MQ=255) aGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCg > 2:5197522/1‑93 (MQ=255) aGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCg > 2:7184730/1‑93 (MQ=255) gggTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCgt < 1:37020/93‑1 (MQ=255) gggTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCgt < 1:1051716/93‑1 (MQ=255) gggTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCgt < 1:2457641/93‑1 (MQ=255) gggTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCgt < 2:2975333/93‑1 (MQ=255) gggTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCgt < 1:2853375/93‑1 (MQ=255) tGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGtt < 1:277690/93‑1 (MQ=255) gCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTGAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTc > 2:6275211/1‑93 (MQ=255) gCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTc > 1:483688/1‑93 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGt > 2:7286825/1‑93 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGt > 1:1860251/1‑93 (MQ=255) 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tcaatcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTgg < 2:3136509/93‑1 (MQ=255) tcaatcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTgg < 1:4670000/93‑1 (MQ=255) caatcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGgc < 2:428926/93‑1 (MQ=255) atcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGgcgc > 2:5339461/1‑93 (MQ=255) tcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCa < 1:5392613/93‑1 (MQ=255) gCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGa < 2:1621690/93‑1 (MQ=255) ccccATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGAc < 2:1758205/93‑1 (MQ=255) cccATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACa > 2:492422/1‑93 (MQ=255) ccATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAg > 2:5723987/1‑93 (MQ=255) ccATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAg > 2:3282110/1‑93 (MQ=255) ccATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAg < 1:2073004/93‑1 (MQ=255) cATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAgg > 1:5546677/1‑93 (MQ=255) aTGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAggg < 2:6228866/93‑1 (MQ=255) gTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGaa < 2:3994415/93‑1 (MQ=255) | TTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGGAA > NC_000913/4555155‑4555336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |