| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,242 | +C | intergenic (+55/‑342) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 99.0% | 921.6 / 0.9 | 299 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base C (156/140); total (157/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.12e-01 | |||||||||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 | cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct > 1:6190151/1‑93 (MQ=255) tGGGGGAATTATCGGCATGTTAAGCAGCGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCCGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c > 2:2241688/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc < 2:6398614/93‑1 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc > 1:6750277/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc < 2:2936372/93‑1 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑cc > 2:3186988/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccc < 2:4048917/93‑2 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccct > 1:6102058/1‑91 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑ccctc > 1:2154548/1‑90 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGTGGTGGATAATTTGTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑cc < 2:5861947/93‑1 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑cc < 1:4834073/93‑1 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑cccttc > 1:4323438/1‑89 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑cccttc < 2:6792034/93‑5 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccctct‑cccttc > 1:5155835/1‑89 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:4770380/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa > 1:7502375/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa > 2:5637997/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:1854462/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:2366199/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAg > 1:1287166/1‑93 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAgg < 1:58271/93‑1 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAgg < 2:2826623/93‑1 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAgg > 2:4993914/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGga < 1:1967066/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:5316594/1‑93 (MQ=255) tGACAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:2889856/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaggg < 1:6424086/93‑3 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaggg > 2:3929734/1‑91 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaggg < 1:1079218/93‑3 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaggg < 1:2519573/93‑3 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAgggg < 1:7059131/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGt < 1:2363838/93‑1 (MQ=255) cagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTc < 2:7596122/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCg > 2:3148420/1‑93 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCgg > 1:2637503/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGACTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCggg < 2:4325242/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCgggg < 1:874667/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCgggg > 2:7795071/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGt > 1:3270153/1‑93 (MQ=255) gagtgtATAATTGTTCATCTGCCTAAGCCGTGTACTCTGTCATTAACATGAGCTCCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGt < 1:3833858/91‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTg > 2:200856/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGa > 1:5094985/1‑93 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAg > 1:4406191/1‑93 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAgg > 1:7204965/1‑93 (MQ=255) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAggg < 1:7486580/93‑1 (MQ=255) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAggg > 2:7171678/1‑93 (MQ=255) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAggg > 2:6191550/1‑93 (MQ=255) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAggg > 2:4201068/1‑93 (MQ=255) aTAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGt > 2:5119070/1‑93 (MQ=38) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTaa > 2:3092265/1‑93 (MQ=38) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTaa > 1:158725/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 1:5883218/1‑93 (MQ=38) tttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 1:7363947/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 2:3864906/1‑93 (MQ=38) aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCg > 1:4144348/1‑93 (MQ=38) aTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGc > 1:3548255/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 1:939648/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:4880606/1‑93 (MQ=38) cTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAc > 1:3911360/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 2:7910807/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg < 2:929933/93‑1 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 1:5502450/1‑93 (MQ=38) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa < 1:7659464/93‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa < 2:4655225/93‑1 (MQ=255) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt < 2:7402543/93‑1 (MQ=255) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt < 2:1789961/93‑1 (MQ=38) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 1:6653596/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:2589599/1‑93 (MQ=38) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc < 2:3498137/93‑1 (MQ=255) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc < 2:1603692/93‑1 (MQ=255) aGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCt < 1:7113252/93‑1 (MQ=38) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTg < 2:403499/93‑1 (MQ=37) cGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGc < 2:6754552/93‑1 (MQ=38) cGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGCGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGc > 2:2682821/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 1:1027574/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc < 1:3134098/93‑1 (MQ=38) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc < 2:6469851/93‑1 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:1504946/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt < 1:5413969/93‑1 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 1:171245/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt < 1:3094425/93‑1 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt < 2:3569121/93‑1 (MQ=38) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 1:804229/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt < 2:5203542/93‑1 (MQ=38) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 1:7709780/1‑93 (MQ=37) cccTGCGATTACCATGAGCACCTTTTGCTGCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc < 1:4523398/93‑1 (MQ=21) acccgTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc > 2:1389941/5‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc > 2:6628340/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc < 2:7279238/93‑1 (MQ=38) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc > 1:4237052/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc < 2:5384047/93‑1 (MQ=37) tAACATGAGCTCCGGTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAccc < 2:3354295/93‑1 (MQ=18) tAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAccc > 1:7829146/1‑93 (MQ=21) aCATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTa < 1:1373388/93‑1 (MQ=21) cATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTaa < 1:3696500/93‑1 (MQ=21) cATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGGTTCCCTCCCCCTaa > 2:3756513/1‑93 (MQ=25) gTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCCCCCCCACCCAcccccc > 2:168697/1‑93 (MQ=16) gTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcccc < 1:461819/93‑1 (MQ=18) gTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcccc > 2:1118584/1‑93 (MQ=18) gTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCCAACCCTCTcccc > 2:6296694/1‑93 (MQ=18) | CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |