| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,410,534 | (G)5→6 | coding (569/663 nt) | envR ← | putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,410,529 | 1 | . | G | 95.9% | 669.2 / 19.2 | 220 | coding (574/663 nt) | envR | putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/6); new base G (137/74); total (140/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
AATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑GGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCAC > NC_000913/3410437‑3410619 | aaTTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑Gc > 2:821254/1‑93 (MQ=255) aTTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑g < 2:6496196/93‑1 (MQ=255) aTTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑g > 2:6367602/1‑93 (MQ=255) aTTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑g > 1:7760198/1‑93 (MQ=255) aTTTACATGACACATAATTCATACGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGTACATTCTTAATACGTTAACGACCAGA‑GC‑g < 1:7033364/93‑1 (MQ=255) tttACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gg > 2:448512/1‑93 (MQ=255) tttACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gg > 1:3732155/1‑93 (MQ=255) tttACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gg > 1:3156751/1‑93 (MQ=255) tttACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gg < 1:823317/93‑1 (MQ=255) ttACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggg > 2:3759279/1‑93 (MQ=255) tACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gggg < 2:5262081/93‑1 (MQ=255) tACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gggg < 2:7334788/93‑1 (MQ=255) tACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gggg > 1:1309295/1‑93 (MQ=255) aCATGACACTTAGTTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATAAACATTCTTAATTCGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggg < 1:4293806/93‑1 (MQ=255) cATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑gggggg > 2:3079768/1‑92 (MQ=255) aTGGCACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggc < 1:1632156/93‑3 (MQ=255) aTGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggc < 1:982987/93‑3 (MQ=255) tGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggct > 2:946747/1‑90 (MQ=255) tGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggct < 2:4805028/93‑4 (MQ=255) tGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggct > 1:2824018/1‑90 (MQ=255) gACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggctt < 1:1747727/93‑5 (MQ=255) gACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggctt < 1:7377995/93‑5 (MQ=255) gACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑ggggggctt < 1:5018920/93‑5 (MQ=255) cacTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGt > 1:729911/1‑93 (MQ=255) cacTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGt > 2:4989692/1‑93 (MQ=255) acTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGtt > 1:7600283/1‑93 (MQ=255) ttAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTt‑a < 1:5038543/93‑1 (MQ=255) ttAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTt‑a < 2:251993/93‑1 (MQ=255) tAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTt‑at < 1:616466/93‑1 (MQ=255) aaTTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTt‑ata < 1:6823575/93‑1 (MQ=255) attcattcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATaa < 2:1198680/93‑1 (MQ=255) ttcattcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATaaa < 2:5351380/93‑1 (MQ=255) ttcattcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATaaa > 2:7079070/1‑93 (MQ=255) tcattcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑g < 2:3652730/93‑1 (MQ=255) attcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GAt < 2:6429033/93‑1 (MQ=255) attcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GAt < 1:6391557/93‑1 (MQ=255) attcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GAt > 1:3504719/1‑93 (MQ=255) ttcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATc < 2:6073584/93‑1 (MQ=255) tcGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCa < 1:3935622/93‑1 (MQ=255) gTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATa > 1:2429452/1‑93 (MQ=255) tttGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATaa < 2:3226375/93‑1 (MQ=255) tttGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATaa < 2:5901559/93‑1 (MQ=255) tttGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATaa > 2:7812348/1‑93 (MQ=255) ttGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAAc > 1:75610/1‑93 (MQ=255) atgaATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCg > 2:3916619/1‑93 (MQ=255) tgaATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGc > 1:2708503/1‑93 (MQ=255) tgaATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGc > 2:1582999/1‑93 (MQ=255) aattaattTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCa < 2:5010933/93‑1 (MQ=255) aattaattTCGTTATGTTTTCATCTGGAATGAACATTCTTACTACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCa < 1:4772429/93‑1 (MQ=255) attaattTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCat > 2:4352972/1‑93 (MQ=255) ttaattTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCata < 1:2348057/93‑1 (MQ=255) attTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGGG‑GGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTc < 2:6794295/93‑1 (MQ=255) attTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTc > 1:3397324/1‑93 (MQ=255) tttCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGGG‑GGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCa < 2:7650434/93‑1 (MQ=255) ttCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCAt < 2:3472630/93‑1 (MQ=255) tCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCAtt > 1:6302467/1‑93 (MQ=255) ttATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAAc > 2:5198931/1‑93 (MQ=255) tATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAAcc > 1:5609939/1‑93 (MQ=255) tGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAg > 1:5298942/1‑93 (MQ=255) gTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGt > 1:4730408/1‑93 (MQ=255) gTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGt > 2:744487/1‑93 (MQ=255) ttttCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGtt > 2:4166673/1‑93 (MQ=255) ttttCATCTGGAAGGAATATTCTTAATGTGTTAGCGACCGGG‑GCGGGGGG‑CTTTTTT‑ATAAA‑GATAATACCCCGCCATATTCATTAACCAGtt < 2:5453995/93‑1 (MQ=255) tttCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGttt > 1:2109184/1‑93 (MQ=255) ttCATCTGCAATAAACTTTCTTAATACTTTATCGACAAGA‑GCTGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑TATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGtttt < 2:1056786/93‑1 (MQ=255) aTCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGaa > 2:4854250/1‑93 (MQ=255) aTCTGGAATAAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑TTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGaa < 2:7163378/93‑1 (MQ=255) aTCGGGCATAAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGAGGG‑GGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGaa < 1:5197214/93‑1 (MQ=255) tCTGGCATGAACATTCTTGATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAAc > 1:2566724/1‑93 (MQ=255) tGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACaa > 1:2148731/1‑93 (MQ=255) tGGCATAAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTTTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACaa < 1:1938920/93‑1 (MQ=255) ggCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAAt > 2:1811192/1‑93 (MQ=255) gCATGACCATTTTTAATACTTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTTTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAAtt < 1:587645/93‑1 (MQ=255) cATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCTTAACCCACCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTc < 2:4761756/93‑1 (MQ=255) cATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTc < 2:2043378/93‑1 (MQ=255) aTGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCCTATTCATTAACCAGTTTTGAACCATTcc > 1:5886474/1‑93 (MQ=255) tGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCg > 1:6754905/1‑93 (MQ=255) gAACATTTTTAATACGTTATCGCCCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATAATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGc < 1:7868649/93‑1 (MQ=255) aaCATTCTTAATCCTTTATCGACAAGA‑GCGGGGGG‑TTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCt < 2:580272/93‑1 (MQ=255) cATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑GGGGGTCTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGa < 1:2237565/93‑1 (MQ=255) aTTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGaa > 2:3602311/1‑93 (MQ=255) aTTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGaa > 2:2785470/1‑93 (MQ=255) aTTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGaa > 1:4008031/1‑93 (MQ=255) aTTCTAAATACGTTATCGACAAGA‑GC‑GGGGGTCTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGaa < 1:2984763/93‑1 (MQ=255) ttCTTAATACGTTATCGACCAGAGGG‑GGGGG‑TTTGTTT‑AAAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAg < 1:115839/93‑1 (MQ=255) ttttAATACGTTATCGACCAGG‑GG‑GGGGGTTTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAgg < 2:1454634/91‑1 (MQ=255) aaTCCGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTTTTT‑AAAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCAcc < 2:6625002/93‑1 (MQ=255) aaTACGTTATCGCCCAGA‑GCGGGGGG‑TTTGTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCAcc < 1:7160970/93‑1 (MQ=255) tgcGTGATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCAt < 1:6042900/91‑1 (MQ=255) cGTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCa > 2:6126391/1‑93 (MQ=255) gTTATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaa > 2:2317387/1‑93 (MQ=255) ttATCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaat > 1:4451643/1‑93 (MQ=255) aTCGACCAGA‑GCGGGGGG‑TTTGTTT‑ATAAA‑TATCAAACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataa < 2:1113802/93‑1 (MQ=255) tCGACCAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataat > 2:4390227/1‑93 (MQ=255) gACCAGG‑GCGGGGGG‑CTTTTTT‑AAAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataataa < 1:1552787/93‑1 (MQ=255) aCCAGA‑GG‑GGGGG‑GTTTTTTAATAAA‑AATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCaataataat < 2:4309843/93‑1 (MQ=255) ccAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatc > 2:3992322/1‑93 (MQ=255) cAGA‑GCGGGGGG‑TTTTTTT‑ATAAA‑GATCATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatca < 1:4137034/93‑1 (MQ=255) cAGA‑GCGGGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatca > 2:2682363/1‑93 (MQ=255) gga‑gG‑GGGGG‑GTTTTTT‑AAAAAGGATAATACCCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAatcat < 1:5413270/92‑1 (MQ=255) | AATTTACATGACACTTAATTCATTCGTTTGATGAATTAATTTCGTTATGTTTTCATCTGGCATGAACATTCTTAATACGTTATCGACCAGA‑GC‑GGGGG‑CTTGTTT‑ATAAA‑GATCATAACCCGCCATATTCATTAACCAGTTTTGAACAATTCCGCTGAAGGCACCATCAATAATAATCATCAC > NC_000913/3410437‑3410619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |