Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,899,957 | (C)5→6 | coding (1373/1413 nt) | bglB ← | phospho‑beta‑glucosidase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,899,952 | 1 | . | C | 98.9% | 1100.0 / 3.3 | 358 | coding (1378/1413 nt) | bglB | phospho‑beta‑glucosidase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base C (177/176); total (179/179) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 |
Only 100 of 413 total aligned reads displayed.
ATGGTGCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTGCATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGATC > NC_000913/3899860‑3900039 | aTGGTGCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAg < 1:5032314/93‑1 (MQ=255) tGGTGCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑c < 2:4337500/93‑1 (MQ=255) tGGTGCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑c < 2:1300491/93‑1 (MQ=255) ggTGCAAAAAAAAAAATAAAGCCATGGCATCCAGACTTTTCTGAATGCGACGAAAATAAAGGTGCTTTAAGGGTTA‑‑TTTTTTTAATGACAG‑‑cc < 2:2750125/93‑1 (MQ=255) gTGCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑ccc > 2:2668535/1‑93 (MQ=255) gCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑ccccc < 1:4619138/93‑1 (MQ=255) cAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑cccccc < 1:7366371/93‑2 (MQ=255) cAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑cccccc > 2:6512544/1‑92 (MQ=255) cAAAGAAAAAATTACCG‑CATCGCTTCAGGACTGTCCTGATTGCGAGGAAAATT‑AGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑ccccccc < 1:5515850/93‑3 (MQ=255) aagaaagaATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑ccccccgc > 1:5659890/1‑90 (MQ=255) aagaaagaATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑ccccccgc > 1:6581500/1‑90 (MQ=255) aaagaaTTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTc > 1:5556405/1‑93 (MQ=255) aaagaaTTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTc > 1:2692381/1‑93 (MQ=255) agaaTTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCtt < 2:5686663/93‑1 (MQ=255) ggcttAACG‑CATCGCATCCAGACTGTACTGAGTGCGACGATAAAAAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTATTAAAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTg < 1:6995622/90‑1 (MQ=255) gaaTTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTg > 2:2173036/1‑93 (MQ=255) gaaTTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTg > 1:5120064/1‑93 (MQ=255) aaTTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGa < 2:3154520/93‑1 (MQ=255) ttAACG‑CATCGCATCCAGACTTTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATc > 1:1396528/1‑93 (MQ=255) ttAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATc > 1:4009413/1‑93 (MQ=255) tAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCa < 2:5441366/93‑1 (MQ=255) aCG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATcccc > 2:1735122/1‑93 (MQ=255) aCG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCAcc > 1:6844459/1‑93 (MQ=255) g‑catcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGT‑CCCCCGCGTCTTGATCACctc > 2:5140629/1‑93 (MQ=255) catcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACctct > 2:1196041/1‑93 (MQ=255) atcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACctcta > 1:5381281/1‑92 (MQ=255) tcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACctctac > 2:1068536/1‑91 (MQ=255) tcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACctctac > 2:1256062/1‑91 (MQ=255) cgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACa < 1:1530246/93‑1 (MQ=255) cgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACa > 1:3525670/1‑93 (MQ=255) catcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATa < 2:3598345/93‑1 (MQ=255) atcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAc > 2:3391467/1‑93 (MQ=255) agccAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAc < 2:389144/91‑1 (MQ=255) tcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAcc < 2:6957673/93‑1 (MQ=255) tcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAcc > 1:4835106/1‑93 (MQ=255) ccAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCa < 1:4518698/93‑1 (MQ=255) cAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCAt < 1:7567297/93‑1 (MQ=255) aGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATc > 2:6164590/1‑93 (MQ=255) gACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATcc > 2:4220549/1‑93 (MQ=255) gACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATcc > 2:751345/1‑93 (MQ=255) gACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATcc < 2:806291/93‑1 (MQ=255) gACCGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATcc > 1:2225931/1‑93 (MQ=255) aCTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCg > 2:4109307/1‑93 (MQ=255) aCTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCg > 2:5783103/1‑93 (MQ=255) tGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGaa < 2:7025856/93‑1 (MQ=255) gTTCTGAATTGGACGATAATTAAGGTGCTTTTATGGGTATTTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGaa < 2:4617440/93‑1 (MQ=255) gTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAg > 1:4146619/1‑93 (MQ=255) ttCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGc > 2:735782/1‑93 (MQ=255) tGAATGCGGCGATAATTAAGGGGCTTTAACGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCttt < 1:6799566/93‑1 (MQ=255) aaTGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCCCCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCtttt < 2:507683/93‑1 (MQ=255) aaTGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTc < 1:6649674/93‑1 (MQ=255) aTGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCt < 2:5368212/93‑1 (MQ=255) tGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCtt < 1:2819917/93‑1 (MQ=255) acgaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgt > 1:1284790/1‑93 (MQ=255) cgaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgtg > 1:2102791/1‑93 (MQ=255) gaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTTATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgtgt > 1:7677809/1‑93 (MQ=255) aaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgtgt < 2:3508668/92‑1 (MQ=255) tAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTc < 2:7612569/93‑1 (MQ=255) aaTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCt < 2:7744059/93‑1 (MQ=255) aTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCtt < 2:1896182/93‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtgt < 1:5762630/93‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtgt < 2:4819136/93‑1 (MQ=255) aaGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtgtg > 2:4851729/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGa > 1:3245175/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGa < 1:6342116/93‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGGCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGTGTGTTCTTGTGa > 2:3058500/1‑93 (MQ=255) ggTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAg > 1:260183/1‑93 (MQ=255) ggTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAg > 2:2349415/1‑93 (MQ=255) gTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAgg < 1:3820325/93‑1 (MQ=255) gCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGct < 2:2540060/93‑1 (MQ=255) gCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGct < 2:6057790/93‑1 (MQ=255) cTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGctt < 1:1759033/93‑1 (MQ=255) cTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGctt > 1:948604/1‑93 (MQ=255) tAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttcct > 1:4774359/1‑93 (MQ=255) aaTGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttcctt < 1:6213893/93‑1 (MQ=255) aaTGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttcctt < 1:6941446/93‑1 (MQ=255) aTGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttccttc > 1:5865096/1‑93 (MQ=255) aTGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttccttc > 1:763312/1‑93 (MQ=255) aTGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttccttc > 2:2434490/1‑93 (MQ=255) tGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTCCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCg < 2:4452733/93‑1 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa > 2:3691595/1‑93 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa > 1:7128594/1‑93 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCAAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa < 1:3152409/93‑1 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCCCCAt > 1:6083444/1‑93 (MQ=255) ttttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTTTGAGGCTTCCTTCGCCATTa > 2:1511427/1‑93 (MQ=255) ttttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTa < 1:1945460/93‑1 (MQ=255) ttttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTa > 2:5000862/1‑93 (MQ=255) tttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTat > 1:376259/1‑93 (MQ=255) tttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTat < 2:6781916/93‑1 (MQ=255) tttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTat > 2:5846798/1‑93 (MQ=255) ttttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTatc < 1:1140761/93‑1 (MQ=255) ttttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTatcat > 1:5264257/1‑93 (MQ=255) tttgAATGACAGC‑CCCCCTCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTatcat < 2:6675874/93‑1 (MQ=255) ttAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTAtcatca > 1:4933024/1‑93 (MQ=255) tAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCAc < 1:2411447/93‑1 (MQ=255) tAATGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCAc < 1:4321066/93‑1 (MQ=255) aaTGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACg > 1:7793533/1‑93 (MQ=255) aTGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGa < 1:4104562/93‑1 (MQ=255) tGACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGAt > 1:3353600/1‑93 (MQ=255) gACAGC‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGATc < 1:7890221/93‑1 (MQ=255) | ATGGTGCAAAGAAAGAATTAACG‑CATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑‑CCCCCGCGTCTTGATCACCTCTGCATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGATC > NC_000913/3899860‑3900039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |