| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,324,986 | (C)6→7 | coding (858/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,324,980 | 1 | . | C | 81.1% | 548.6 / 133.5 | 218 | coding (852/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (23/18); new base C (81/95); total (104/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
CTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTC > NC_000913/2324889‑2325067 | ctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑c < 1:94270/93‑1 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑c < 2:5328705/93‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cc > 2:1805942/1‑93 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cc < 2:3317677/93‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cc > 1:2908752/1‑93 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cc > 2:3420130/1‑93 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cc > 1:4658668/1‑93 (MQ=255) ctctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑ccc > 1:3529194/1‑92 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cccg > 2:501460/1‑91 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cccc < 1:5538107/93‑3 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑cc‑‑c‑c‑cccgc < 2:5609015/93‑4 (MQ=255) gTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑Att > 1:781136/1‑93 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGa < 2:6079730/93‑1 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGAt < 2:6563954/93‑1 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATg < 1:2252723/93‑1 (MQ=255) ttATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATg > 2:5673995/1‑93 (MQ=255) ttATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATg < 2:433533/93‑1 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATggg < 1:6009785/93‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGt < 2:4859174/93‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTa < 1:6649701/93‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTa < 2:792149/93‑1 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTa > 1:5314366/1‑93 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTAt < 1:3959493/93‑1 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTAt < 2:7355608/93‑1 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATg < 1:2582699/93‑1 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATg < 2:6519343/93‑1 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATg < 2:289497/93‑1 (MQ=255) agaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATgg < 2:3648356/93‑1 (MQ=255) agaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATgg < 2:6640155/93‑1 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTACAAGTTATCCCAGCGGTGGCCT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑CACCCCGCTTGATGGGTATgc > 1:6528979/1‑92 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATggg < 2:3951675/93‑1 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATggg > 2:1412628/1‑93 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATggg < 2:1890989/93‑1 (MQ=255) tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGcc > 1:5709577/1‑93 (MQ=255) cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTTGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCa < 2:7524142/93‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCa < 1:7591828/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAg < 2:2272045/93‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAg < 1:3348253/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTAcc < 2:5462958/93‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg > 1:5528957/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCCCCC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg < 2:2295336/93‑1 (MQ=255) gcagcaGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCAc > 2:390106/1‑93 (MQ=255) gcagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc > 2:6936388/1‑93 (MQ=255) gcagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGAGGAGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATTGGTATCAGGACAGTACTCGACACGCa > 2:5372854/1‑93 (MQ=255) cagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaa < 2:3110388/93‑1 (MQ=255) agGCCTTAACCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaa > 2:118196/1‑93 (MQ=255) ggCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaaaa < 1:3142896/93‑1 (MQ=255) gCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaaaa < 1:2533136/93‑1 (MQ=255) ccTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 1:7277894/1‑93 (MQ=255) cTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 1:1556431/1‑93 (MQ=255) ttACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 2:56951/1‑93 (MQ=255) tccccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt < 2:2458363/92‑1 (MQ=255) aCCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt > 2:4209268/1‑93 (MQ=255) aCCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 2:2596385/93‑1 (MQ=255) ccccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa < 2:4741957/93‑1 (MQ=255) cccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAACAGCGTTACaa > 1:6124612/1‑93 (MQ=255) cccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACaa < 2:2975206/93‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc < 1:4482280/93‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc < 1:2357005/93‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc < 1:700572/93‑1 (MQ=255) ctggctggCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACt < 1:4428721/93‑1 (MQ=255) cTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACt > 1:2750118/1‑93 (MQ=255) cTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACt > 1:3499044/1‑93 (MQ=255) cTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCACAAAGCGTTACAACTg > 1:6910611/1‑93 (MQ=255) ggCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg < 1:3140311/93‑1 (MQ=255) ggCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg > 2:6971645/1‑93 (MQ=255) ggCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGc > 1:7684086/1‑93 (MQ=255) gCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg < 1:2989793/93‑1 (MQ=255) cTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCgg < 1:1280928/93‑1 (MQ=255) cTCCCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCG‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg < 1:75372/93‑1 (MQ=255) tCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCgg > 1:3607152/1‑93 (MQ=255) tCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑CACCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCATTACAACTGGCgg > 1:374638/1‑93 (MQ=255) cGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCggg > 1:5603941/1‑93 (MQ=255) cGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CCCTC‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTCCAACTGGCgg > 2:1537644/1‑93 (MQ=255) cGCATTAAAAGTTATGCAAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCggg < 2:7013169/93‑1 (MQ=255) gCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑CTTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCgggg > 2:5755134/1‑93 (MQ=255) gCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCgggg > 2:6730579/1‑93 (MQ=255) cATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGc > 2:7858553/1‑93 (MQ=255) cATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGc > 1:4316298/1‑93 (MQ=255) cATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGc < 1:1005186/93‑1 (MQ=255) ttAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTg > 2:6306022/1‑93 (MQ=255) tAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGc < 2:5469785/93‑1 (MQ=255) aaaaGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCaa > 1:7646012/1‑93 (MQ=255) aatttATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAAc < 2:2224685/90‑1 (MQ=255) aaGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAAc < 1:5264562/93‑1 (MQ=255) aaGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑CAC‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGcgaa > 2:4146899/1‑90 (MQ=255) aaGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACt < 2:5804087/93‑1 (MQ=255) aGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACt < 1:1999470/93‑1 (MQ=255) gTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACt > 1:5159371/1‑93 (MQ=255) gTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTg < 1:6316250/93‑1 (MQ=255) aTGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCg > 1:2324559/1‑93 (MQ=255) tGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAGGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCgg < 1:1397152/93‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGa > 2:240659/1‑93 (MQ=255) aGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATAtt < 1:5551082/93‑1 (MQ=255) cGGTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTg > 1:512828/1‑93 (MQ=255) ggTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGa < 2:4658255/93‑1 (MQ=255) gTGGCGT‑‑‑GCC‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGa < 2:2840896/93‑1 (MQ=255) gTGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAt < 1:4688305/93‑1 (MQ=255) gTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGGtc > 2:6343959/1‑93 (MQ=255) tGGCGT‑‑‑GC‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAtc > 1:3413687/1‑93 (MQ=255) | CTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGT‑‑‑G‑‑‑CC‑‑C‑C‑CCGC‑ATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTC > NC_000913/2324889‑2325067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |