| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,951,167 | +GCG | coding (36/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3951166 | 37 (0.120) | 239 (0.800) +GGC |
104/176 | 0.9 | 86.9% | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| ? | NC_000913 | 3951167 = | 37 (0.120) | coding (36/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase | |||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
ACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3951077‑3951166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCC‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCCATCT > NC_000913/3951167‑3951256 ||| GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGCGCGCTGTGGCGCGCC > 2:1063409/1‑93 CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCGCCac < 1:3375115/93‑3 ACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCGCCacc < 2:2338883/93‑4 TGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGCGCGCTGGGGGGTGCC‑Cccgg > 2:2608957/1‑89 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAA < 2:50413/93‑1 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAAT < 2:4339506/93‑1 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGGGGCGCGCC‑CCCCGGAg > 2:5355054/1‑92 GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGA < 2:4315578/93‑1 TAAATATAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGAC < 2:412724/93‑1 TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGAC < 2:6909455/93‑1 TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGAC < 1:1535230/93‑1 TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGGCGCC‑CCCCGGAtgac > 1:257170/1‑89 agATAAAGTAGGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACC < 2:2492763/91‑1 AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGGTCGTGGGCCGTGGGGCGCC‑CCCCGGAAGGAC > 1:5098284/1‑93 ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGA < 2:6235901/93‑1 ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGGCGCC‑C‑CCGGGATGAACGc > 2:2087177/1‑92 TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGAC < 2:5084479/93‑1 AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGC < 2:1715031/93‑1 AGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGTGGCGCC‑ACCCGGGA‑GACCGAaccc > 2:7236786/1‑89 TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGA < 2:6038259/93‑1 TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGA < 1:3350959/93‑1 GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCTCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTT < 1:3224235/93‑1 GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTT < 2:4599566/93‑1 GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTT > 1:836865/1‑93 CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTC < 1:3038711/93‑1 CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTC < 1:1831671/93‑1 CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCCGTGGGGCGCC‑CCCCGGAA‑GAGCGACGCCGCTTTt > 2:6361696/1‑92 TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGG < 2:5823190/93‑1 TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCCGAATGACCGACGCCCATTTCGG > 1:5881697/1‑93 AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < 2:6161610/93‑1 AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < 2:3130264/93‑1 AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < 1:5201550/93‑1 AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTA < 2:3405234/93‑1 AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCCGTGGGGCG‑G‑CACCCGAATGACCGACGCCGCTTTTGGTA > 2:1149812/1‑93 ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < 1:533655/93‑1 ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < 2:2763986/93‑1 ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGCGCGCC‑ACCCGGAA‑GACCGACGCCGACTTCGGTAAGC > 1:3455072/1‑93 CGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCG < 2:2862668/93‑1 GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGA < 1:2589270/93‑1 GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGA < 1:6123623/93‑1 GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGCGCGCC‑CCCCGGAA‑GACCCACGCCGCTTTTGGTGAGCCGA > 2:3779201/1‑93 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 2:3712906/93‑1 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 2:5129116/93‑1 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 1:7838843/93‑1 CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < 2:302457/93‑1 GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < 1:6562893/93‑1 CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCG < 1:1225639/93‑1 CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < 2:122449/93‑1 CCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGG < 1:1320888/93‑1 CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < 2:4779095/93‑1 CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < 1:665579/93‑1 CTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTAGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGA > 1:7649218/1‑93 TCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < 1:5381206/93‑1 ATGGTCGTAATATGGCGGATGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑A‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACT < 1:5041573/93‑1 TGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGGGCGCC‑C‑CCGGGATGACCGACGCCGATTTTGGGAAGCCGATTATCGCGGCTGTGAACTC > 2:1952925/1‑93 TGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑C‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTC < 2:4801095/93‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |