Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 350,318 | A→G | Q361Q (CAA→CAG) | prpC → | putative citrate synthase; propionate metabolism? |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 350,318 | 0 | A | G | 99.6% | 864.8 / ‑5.3 | 277 | Q361Q (CAA→CAG) | prpC | putative citrate synthase; propionate metabolism? |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (131/145); total (132/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
TACAACATGATGGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAACGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTAAAC > NC_000913/350229‑350407 | caacaTGATGGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCa < 1:3869343/93‑1 (MQ=255) caacaTGATGGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCa < 1:3047721/93‑1 (MQ=255) caacaTGATGGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCa < 2:601560/93‑1 (MQ=255) caTGATGGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGa < 2:3117973/93‑1 (MQ=255) tgatgGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGaca > 1:3561329/1‑93 (MQ=255) tgatgGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGaca > 2:2750319/1‑93 (MQ=255) tgGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGacaaca > 2:5119158/1‑93 (MQ=255) tgGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGacaaca > 1:4539514/1‑93 (MQ=255) ggCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACaaa < 1:2188906/93‑1 (MQ=255) ggCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACaaa > 1:6002870/1‑93 (MQ=255) gCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACacaa > 2:2712622/1‑93 (MQ=255) gCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACaaaa < 2:7860903/93‑1 (MQ=255) gCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACaaaa < 1:5279103/93‑1 (MQ=255) ttCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTa > 2:6613484/1‑93 (MQ=255) ttCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTa > 1:3353302/1‑93 (MQ=255) ttCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCCCACATTATCGAACAGCGCCAGAACAACAAAATTa > 1:5085781/1‑93 (MQ=255) tCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTAt > 1:6988564/1‑93 (MQ=255) cccACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATc < 1:6717961/93‑1 (MQ=255) cccACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATc < 2:4171809/93‑1 (MQ=255) cACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCg > 1:6527276/1‑93 (MQ=255) cGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTcc > 2:1916887/1‑93 (MQ=255) gagaTGTTCACCCCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCt < 1:2651024/93‑1 (MQ=255) gagaTGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTTTCCGTCCt > 2:6452368/1‑93 (MQ=255) gagaTGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCt > 2:1538861/1‑93 (MQ=255) gagaTGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCt < 1:208231/93‑1 (MQ=255) gaTGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTc > 2:4771377/1‑93 (MQ=255) gaTGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTc > 1:1393812/1‑93 (MQ=255) aTGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGTGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAAGACAACAAAATTATCCGTCCTTcc > 1:3324135/1‑93 (MQ=255) tGTTCACACCACAGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCACACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCg > 1:7701560/1‑93 (MQ=255) gTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACCAAATTATCCGTCCTTCCGc > 1:5471736/1‑93 (MQ=255) gTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGc > 2:4665577/1‑93 (MQ=255) gTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGc < 2:6711246/93‑1 (MQ=255) ttCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGcc > 1:4225502/1‑93 (MQ=255) acacCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAAt > 2:2921190/1‑93 (MQ=255) accacTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTa < 2:3049468/93‑1 (MQ=255) accacTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTa < 1:2845038/93‑1 (MQ=255) cacTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATg < 1:5127626/93‑1 (MQ=255) cacTGTTTGTTATCGCCCGCGTCAACGGCTGGGCGGCGCACATTATAGAACCGCGACAGGACAACAAAATTAAACGTCCTTCACCCAACTATg > 2:4078828/1‑93 (MQ=255) acTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGt > 1:2334935/1‑93 (MQ=255) cTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGtt < 2:355709/93‑1 (MQ=255) cTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGtt < 1:3990101/93‑1 (MQ=255) tgtttgttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAGATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTg < 2:7204871/93‑1 (MQ=255) tgtttgttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTg > 2:447040/1‑93 (MQ=255) tttgttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGa > 2:3845057/1‑93 (MQ=255) tttgttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGa > 2:792756/1‑93 (MQ=255) tgttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGAcc < 1:1048328/93‑1 (MQ=255) gttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCg < 2:4249372/93‑1 (MQ=255) gttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCg < 1:6384169/93‑1 (MQ=255) ttATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCgg > 2:7415758/1‑93 (MQ=255) tATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGa < 2:4975668/93‑1 (MQ=255) ttCGCCCGGGGCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGaa < 1:7818300/92‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGaa < 1:53754/93‑1 (MQ=255) tCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAg > 2:6352440/1‑93 (MQ=255) cccGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGAcc > 2:6581650/1‑93 (MQ=255) cccGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGAcc > 1:5623127/1‑93 (MQ=255) cccGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGAcc > 1:5526408/1‑93 (MQ=255) cccGCGTCACCGGCTGGGCAGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGAcc > 1:3153265/1‑93 (MQ=255) gcgTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGcc < 1:3253956/93‑1 (MQ=255) gcgTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGcc < 1:4984696/93‑1 (MQ=255) gcgTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGcc > 2:1379588/1‑93 (MQ=255) cgTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGccc < 2:1402609/93‑1 (MQ=255) cgTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGccc < 1:4673228/93‑1 (MQ=255) gTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCg > 2:1966313/1‑93 (MQ=255) tCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGt > 1:867067/1‑93 (MQ=255) tCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGt > 2:5350233/1‑93 (MQ=255) cACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGtt < 1:4727512/93‑1 (MQ=255) cACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGtt < 1:7427712/93‑1 (MQ=255) cccGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGttt < 2:5813718/92‑1 (MQ=255) aCCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGttt < 2:2974106/93‑1 (MQ=255) aCCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGttt > 1:6728016/1‑93 (MQ=255) ccGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTg < 2:5884338/93‑1 (MQ=255) ccGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTg > 2:3931140/1‑93 (MQ=255) cGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGt > 2:1758987/1‑93 (MQ=255) cGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGt > 1:1687229/1‑93 (MQ=255) ggCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTc > 2:1267170/1‑93 (MQ=255) gCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTcg > 1:5830118/1‑93 (MQ=255) gCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTcg > 1:973155/1‑93 (MQ=255) tGGGCGGCGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTcgcg > 1:1900928/1‑93 (MQ=255) ggcggcGCACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCt > 2:3212742/1‑93 (MQ=255) gcgcACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGAt < 1:2749299/93‑1 (MQ=255) gcgcACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGAt < 2:2497292/93‑1 (MQ=255) cgcACATTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATa < 2:381514/93‑1 (MQ=255) gcACATTATCGACCAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCAGGCTaa > 2:2264870/1‑93 (MQ=255) cacaTTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAg < 2:54644/93‑1 (MQ=255) cacaTTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAg < 1:4354353/93‑1 (MQ=255) acaTTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTCTGCTGGACTGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGATGGATAAgc > 1:4099528/1‑93 (MQ=255) acaTTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAgc < 2:6915856/93‑1 (MQ=255) aTTATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAgcgc < 2:6772607/93‑1 (MQ=255) ttATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGcc > 1:1076271/1‑93 (MQ=255) ttATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCCCGCTGGATAAGCGcc > 2:1844432/1‑93 (MQ=255) tATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCa < 1:3733291/93‑1 (MQ=255) tATCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCa < 2:773587/93‑1 (MQ=255) aTCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAg < 2:3330969/93‑1 (MQ=255) aTCGAACAGCGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAg > 2:7506978/1‑93 (MQ=255) aacagcGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTaaa < 1:4122806/93‑1 (MQ=255) aacagcGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTaaa > 1:7329521/1‑93 (MQ=255) aacagcGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTaaa > 2:7626113/1‑93 (MQ=255) aacagcGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTaaa < 2:4220541/93‑1 (MQ=255) acagcGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTAAAc < 1:6161146/93‑1 (MQ=255) acagcGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTAAAc < 1:7263617/93‑1 (MQ=255) | TACAACATGATGGGCGTTCCCACCGAGATGTTCACACCACTGTTTGTTATCGCCCGCGTCACCGGCTGGGCGGCGCACATTATCGAACAACGTCAGGACAACAAAATTATCCGTCCTTCCGCCAATTATGTTGGACCGGAAGACCGCCCGTTTGTCGCGCTGGATAAGCGCCAGTAAAC > NC_000913/350229‑350407 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |