Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,670,614 | C→T | R215C (CGT→TGT) | yhjC → | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,670,614 | 0 | C | T | 99.8% | 1425.2 / ‑5.8 | 398 | R215C (CGT→TGT) | yhjC | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (197/200); total (197/201) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.03e-01 |
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
CTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTG > NC_000913/3670524‑3670703 | cTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAgtgtgt < 2:4149834/93‑1 (MQ=255) tGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGtt < 1:7525936/93‑1 (MQ=255) tGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGtt > 1:6187203/1‑93 (MQ=255) gACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTta > 2:7932155/1‑93 (MQ=255) gACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTta < 2:1638514/93‑1 (MQ=255) gACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTta < 1:629787/93‑1 (MQ=255) gACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTta < 2:5551601/93‑1 (MQ=255) aCCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtat < 2:20065/93‑1 (MQ=255) ccATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtata < 2:1918241/93‑1 (MQ=255) ccATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtata < 1:5043794/93‑1 (MQ=255) cATGGTCAAATGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATac < 1:476040/93‑1 (MQ=255) tGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCACTAGTGTGTTATagac > 1:2087769/1‑93 (MQ=255) ggTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACAcc < 1:4291038/93‑1 (MQ=255) ggTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACAcc > 2:2394802/1‑93 (MQ=255) gTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCg < 1:6689000/93‑1 (MQ=255) taaaCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGc < 2:762410/91‑1 (MQ=255) tCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCCCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGc < 1:7086844/93‑1 (MQ=255) aCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCAcc > 2:5466837/1‑93 (MQ=255) aCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCAcc < 2:7342004/93‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCt < 2:1748879/93‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCACAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTg < 2:7011562/93‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTg < 2:3685957/93‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTg < 1:29822/93‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTg > 1:6867569/1‑93 (MQ=255) tgtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTg > 1:1804112/1‑93 (MQ=255) gtgCCAGTCCGCTCTATCTGACCCGCTTTGGTTATCCGCAAATCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTgg < 1:5981182/93‑1 (MQ=255) gtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTgg < 2:2559932/93‑1 (MQ=255) gtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTgg < 1:1620236/93‑1 (MQ=255) ccAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAATCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGgtg < 2:6615644/93‑1 (MQ=255) aGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTa < 1:3214471/93‑1 (MQ=255) tCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACa > 2:1365908/1‑93 (MQ=255) tCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACa > 2:6526783/1‑93 (MQ=255) tCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACa > 2:4059569/1‑93 (MQ=255) cGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATc > 2:6155947/1‑93 (MQ=255) aCTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGt > 2:3898672/1‑93 (MQ=255) aCTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGt > 1:790253/1‑93 (MQ=255) cTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGtt > 1:5860408/1‑93 (MQ=255) cTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTAAATCCGtt > 1:5337509/1‑93 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa < 1:2425790/93‑1 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa < 1:4568254/93‑1 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa < 2:4466147/93‑1 (MQ=255) aTCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAg > 2:2700055/1‑93 (MQ=255) aTCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAg > 1:4826700/1‑93 (MQ=255) tCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAgg > 1:4720753/1‑93 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGtt < 2:3354560/93‑1 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGtt < 1:1995739/93‑1 (MQ=255) gACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGttt < 2:7215680/93‑1 (MQ=255) gACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGttt < 2:591038/93‑1 (MQ=255) cTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGt < 2:5809547/93‑1 (MQ=255) cTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGt < 1:3415545/93‑1 (MQ=255) tttGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGtt < 2:111962/93‑1 (MQ=255) ttGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTg < 1:5595753/93‑1 (MQ=255) tGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCGCCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGc > 2:6479198/1‑93 (MQ=255) tGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGc > 1:3816466/1‑93 (MQ=255) ggTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGcc > 1:226642/1‑93 (MQ=255) gTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCa < 1:6936858/93‑1 (MQ=255) gTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCa < 1:7747583/93‑1 (MQ=255) ttATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAg < 2:3453084/93‑1 (MQ=255) ttATCCGCAAAGCACCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAg < 2:7796998/93‑1 (MQ=255) tATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGc < 2:5688773/93‑1 (MQ=255) tCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt > 2:156051/1‑93 (MQ=255) tCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt > 2:2985413/1‑93 (MQ=255) cGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTa < 2:7712305/93‑1 (MQ=255) cGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTa > 1:4009657/1‑93 (MQ=255) gCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTaa > 2:3397725/1‑93 (MQ=255) gCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTaa < 1:850569/93‑1 (MQ=255) cAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAAt < 1:2684955/93‑1 (MQ=255) aaaGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATg > 2:2202329/1‑93 (MQ=255) aaGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACATCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATgg > 1:2558657/1‑93 (MQ=255) aGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGc > 2:2076573/1‑93 (MQ=255) aGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGc < 2:6317066/93‑1 (MQ=255) gCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCg > 1:1726131/1‑93 (MQ=255) cccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTc > 1:6424448/1‑93 (MQ=255) ccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTcc > 2:3145846/1‑93 (MQ=255) cGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCa < 2:2893395/93‑1 (MQ=255) gatgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAg < 1:7209316/93‑1 (MQ=255) gatgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAg > 1:2797796/1‑93 (MQ=255) gatgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAg > 1:395222/1‑93 (MQ=255) gatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTgg > 1:291221/1‑93 (MQ=255) atCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGt > 2:7466805/1‑93 (MQ=255) atCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGt > 1:6627921/1‑93 (MQ=255) tCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGCGGTTGACAGCGTTAATGGCGTCCAGTCGtt > 1:3485597/1‑93 (MQ=255) aCTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAg < 1:100598/93‑1 (MQ=255) aCTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAg < 2:6601261/93‑1 (MQ=255) aCTTCACACCCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGCTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAg > 2:5031455/1‑93 (MQ=255) ttCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTc < 1:4953155/93‑1 (MQ=255) ttCACACGCAACAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTc < 1:1404398/93‑1 (MQ=255) cacGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggc < 2:6804811/93‑1 (MQ=255) cAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCa > 1:1238951/1‑93 (MQ=255) aaTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTTCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCAt > 2:4303420/1‑93 (MQ=255) aaTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCAt < 1:7615387/93‑1 (MQ=255) aaTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGCTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCAt > 1:650168/1‑93 (MQ=255) aTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATg > 1:6985757/1‑93 (MQ=255) tAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGt > 2:6728623/1‑93 (MQ=255) tAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGt > 1:3268444/1‑93 (MQ=255) tAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGt > 2:4736630/1‑93 (MQ=255) aGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGtt < 2:6883810/93‑1 (MQ=255) aGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGtt < 2:3541322/93‑1 (MQ=255) gtgtgtTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTg < 2:5128742/93‑1 (MQ=255) gtgtgtTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTg > 1:5397902/1‑93 (MQ=255) | CTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTG > NC_000913/3670524‑3670703 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |