Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,747,858 | A→G | Y48C (TAC→TGC) | sgbE → | putative epimerase/aldolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,747,858 | 0 | A | G | 99.8% | 1325.4 / ‑5.3 | 432 | Y48C (TAC→TGC) | sgbE | putative epimerase/aldolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (179/252); total (179/253) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 |
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
CTCACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACAC > NC_000913/3747768‑3747947 | tCACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcga < 2:3052729/93‑1 (MQ=255) tCACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcga < 1:4842969/93‑1 (MQ=255) tCACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcga < 2:2374576/93‑1 (MQ=255) tCACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGGCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcga < 1:1233184/93‑1 (MQ=255) cACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcgac > 2:4909724/1‑93 (MQ=255) aCCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcgacg < 1:6678630/93‑1 (MQ=255) ccATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTgcgacgg > 2:1496466/1‑92 (MQ=255) ccATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGt > 2:2697253/1‑93 (MQ=255) cATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGtg > 2:4454000/1‑93 (MQ=255) aTCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGtga > 2:1127956/1‑93 (MQ=255) aTCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGtga < 1:5123089/93‑1 (MQ=255) aTCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGtga < 2:2620897/93‑1 (MQ=255) tGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGtgatga < 2:3289857/93‑1 (MQ=255) gTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGAcc > 1:2175769/1‑93 (MQ=255) tGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGAccg > 1:1624755/1‑93 (MQ=255) gACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGAccgc > 1:563687/1‑93 (MQ=255) gTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCcga > 1:2276798/1‑93 (MQ=255) gTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCcga < 2:1565944/93‑1 (MQ=255) aCCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGat < 1:7532566/93‑1 (MQ=255) ccTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGata < 1:5038270/93‑1 (MQ=255) ccTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGata < 2:1297428/93‑1 (MQ=255) cTGGGGCAATGTCAGCGCTGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGatat < 1:681142/93‑1 (MQ=255) cTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGatat < 1:6295842/93‑1 (MQ=255) cTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGatat < 1:2118070/93‑1 (MQ=255) cTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGatat < 2:34478/93‑1 (MQ=255) tGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtg < 2:4598040/93‑1 (MQ=255) tGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtg > 2:6190451/1‑93 (MQ=255) gggCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtggt < 2:6853895/93‑1 (MQ=255) gCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtggtgg > 1:1087640/1‑93 (MQ=255) gCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtggtgg < 1:4741204/93‑1 (MQ=255) cAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtggtggt < 1:3654857/93‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATAtggtggtg > 1:7640099/1‑93 (MQ=255) gTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGtt < 1:4364813/93‑1 (MQ=255) gTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGtt < 1:5824603/93‑1 (MQ=255) gTCAGCGCGGGAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGtt < 2:4030157/93‑1 (MQ=255) aGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTgag > 1:391406/1‑93 (MQ=255) aGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTgag < 1:1002155/93‑1 (MQ=255) aGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTgag > 2:3984770/1‑93 (MQ=255) gcgcGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTgaga > 2:7288536/1‑93 (MQ=255) ggcgGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGAt < 1:5941327/92‑1 (MQ=255) cgcgGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGAt < 2:5903202/93‑1 (MQ=255) gcgGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATa < 2:2915362/93‑1 (MQ=255) gcgGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATa < 2:3612528/93‑1 (MQ=255) cgGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAg > 1:5317957/1‑93 (MQ=255) ggTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGc < 2:879623/93‑1 (MQ=255) tAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCa < 2:665414/93‑1 (MQ=255) tAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCa > 1:6460399/1‑93 (MQ=255) tAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCa < 2:2214607/93‑1 (MQ=255) aGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAg > 1:6127054/1‑93 (MQ=255) gACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGc > 1:939604/1‑93 (MQ=255) gACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGc > 1:5768246/1‑93 (MQ=255) cGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCgg < 1:2922552/93‑1 (MQ=255) gAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCGAGCgga > 2:1878158/1‑92 (MQ=255) gAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGt > 1:694648/1‑93 (MQ=255) aaaCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGtg < 1:1413622/93‑2 (MQ=255) aaaCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACAGCCGACGATATGGAGGTGTTTGAGATAGCCAGCGGTa > 2:3849004/1‑93 (MQ=38) aaCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTaa > 1:3082719/1‑93 (MQ=255) aaCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTaa < 1:2354876/93‑1 (MQ=255) aaCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTaa < 1:5568484/93‑1 (MQ=255) aCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAg > 2:3736686/1‑93 (MQ=255) aCGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTGCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAg < 1:4517689/93‑1 (MQ=255) cgGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAggtg < 2:3601795/93‑1 (MQ=255) ggCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAggtgg > 2:6278009/1‑93 (MQ=255) gtaaTGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAggtggt < 1:7732100/91‑1 (MQ=255) cAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGgtggtg < 1:7396854/93‑1 (MQ=255) aaTGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGtggtgg < 2:5422845/93‑1 (MQ=255) atggatggAAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGGGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGCGGTGGa > 2:5170484/1‑93 (MQ=37) tggatggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGag > 1:2992103/1‑92 (MQ=255) ggatggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAg < 2:7205302/93‑1 (MQ=255) atggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGgc > 2:7551172/1‑93 (MQ=255) atggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGgc < 1:5416542/93‑1 (MQ=255) atggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGgc > 1:2035907/1‑93 (MQ=255) tggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGgca < 1:462138/93‑1 (MQ=255) gTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGgcagc < 1:2491244/93‑1 (MQ=255) aTCAAACCTTCCGGCGTCGAGGCCGACGTGATGACCACCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCaaa < 1:4002597/93‑1 (MQ=255) tCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCaaaa > 1:5893337/1‑93 (MQ=255) tCAAACCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCaaaa > 2:165039/1‑93 (MQ=255) aaaCCTTCCGGCGTCGTGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGGGGTGGAAGGCAGCaaaaaa > 2:7030478/1‑93 (MQ=255) aaaCCTTCCGGCGTCGAGTGCGAAGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCaaaaaa < 2:4321172/93‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAAc < 2:7692296/93‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAAc < 2:5024030/93‑1 (MQ=255) aCCTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAAcc < 2:5598801/93‑1 (MQ=255) ccTTCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAATGGGGGGGAAGGCGGCAAAAAAccc > 2:7770699/1‑93 (MQ=38) ttCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGCCCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCctc < 2:4733856/93‑1 (MQ=255) ttCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCctc < 1:2640611/93‑1 (MQ=255) ttCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCctc < 2:2138372/93‑1 (MQ=255) ttCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCctc < 2:5957921/93‑1 (MQ=255) ttCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGGGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGGGGAAGGCAGCAAAAAACActc > 2:180663/1‑93 (MQ=255) tCCGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCctct < 1:7286128/93‑1 (MQ=255) ccGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCtt < 2:6419756/93‑1 (MQ=255) cGGCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCTAGGGGTAAGGTGGTCGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTc < 2:5302101/93‑1 (MQ=255) ggCGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTcc < 1:3208529/93‑1 (MQ=255) cGTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCATCAAAAAACCCTCTTCCGa < 2:7924367/93‑1 (MQ=255) gTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGAt < 1:3839515/93‑1 (MQ=255) gTCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGAt > 1:6576458/1‑93 (MQ=255) tCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATa > 2:5762611/1‑93 (MQ=255) tCGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATa > 1:3387960/1‑93 (MQ=255) cGAGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGAGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATac > 1:4244291/1‑93 (MQ=255) aGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATacac > 1:1847405/1‑93 (MQ=255) aGTGCGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATacac < 2:6037073/93‑1 (MQ=255) | CTCACCATCTGGTGACGTTCACCTGGGGCAATGTCAGCGCGGTAGACGAAACGCGGCAATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACAC > NC_000913/3747768‑3747947 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |