Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,785,382 | G→A | T306T (ACG→ACA) | b3613 → | putative membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,785,382 | 0 | G | A | 99.8% | 1479.3 / ‑6.1 | 411 | T306T (ACG→ACA) | b3613 | putative membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (173/237); total (173/238) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.27e-01 |
Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > NC_000913/3785292‑3785471 | accgaccgAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACt < 1:6426333/93‑1 (MQ=255) ccgaccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTg > 2:2451846/1‑93 (MQ=255) cgacagaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGCACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGc < 2:3174687/93‑1 (MQ=255) gaccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCa > 1:516489/1‑93 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCAt > 2:3579212/1‑93 (MQ=255) ccgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATc > 2:2866335/1‑93 (MQ=255) cgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGCGGTCTGCGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGCGCCGTCCCTGCATCg > 2:3274454/1‑93 (MQ=255) gaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGc < 1:7235745/93‑1 (MQ=255) aaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCCTCGCTa > 2:2707534/1‑93 (MQ=255) aaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTa < 2:2207150/93‑1 (MQ=255) aaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTa > 2:4626897/1‑93 (MQ=255) aaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTa > 2:6064575/1‑93 (MQ=255) aGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTAt < 1:5226015/93‑1 (MQ=255) gCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATg < 2:1508596/93‑1 (MQ=255) cGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATgg < 2:2080598/93‑1 (MQ=255) gAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCAGTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATTGc > 2:7013827/1‑93 (MQ=255) aaaaaTCGCTCATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCg > 2:4061398/1‑93 (MQ=255) aaaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGa > 1:4870707/1‑93 (MQ=255) aaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAc < 1:4753321/93‑1 (MQ=255) aaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAc < 2:2975808/93‑1 (MQ=255) aaTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAAc < 2:5981449/93‑1 (MQ=255) aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa < 1:7161847/93‑1 (MQ=255) aTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACa < 1:5333998/93‑1 (MQ=255) tCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGAGAACAg > 1:2277068/1‑93 (MQ=255) cGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGc > 2:5696477/1‑93 (MQ=255) gCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCt > 1:2172770/1‑93 (MQ=255) cTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGACCAGCTa > 1:2749943/1‑93 (MQ=255) cTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTa < 2:1841627/93‑1 (MQ=255) tGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTAc > 1:7811595/1‑93 (MQ=255) gATGTCCGGTCCCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACa < 2:5528508/93‑1 (MQ=255) gATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACa > 2:555437/1‑93 (MQ=255) gATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACa > 2:1199068/1‑93 (MQ=255) aTGTCCCGTCCCGGTGGTCGGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAg < 2:1681041/93‑1 (MQ=255) gTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAggg > 1:3075349/1‑93 (MQ=255) tCCCGTACCGGTGGTCTGGGGGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGt < 1:144447/93‑1 (MQ=255) ccGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGa > 2:4158226/1‑93 (MQ=255) ccGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGa < 1:7489931/93‑1 (MQ=255) ccGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGa < 1:1360934/93‑1 (MQ=255) cGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGaa > 2:4902457/1‑93 (MQ=255) gtgccGGTGTTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAt < 1:2343798/90‑1 (MQ=255) gTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAt > 1:4235332/1‑93 (MQ=255) tACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAAtt < 2:903356/93‑1 (MQ=255) gccGGTGGTCTGGGCGCGCCGCTTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTa < 2:3441706/92‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTa > 2:173787/1‑93 (MQ=255) ccGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTAc > 1:381640/1‑93 (MQ=255) ggtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGc < 1:5009218/93‑1 (MQ=255) ggtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGc > 1:406697/1‑93 (MQ=255) gtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCt > 1:1232335/1‑93 (MQ=255) gtggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCt < 2:510069/93‑1 (MQ=255) gtggtCGGGGCCCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCt < 1:5618920/93‑1 (MQ=255) tggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTg > 2:539394/1‑93 (MQ=255) tggtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTg < 2:256001/93‑1 (MQ=255) gtCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGa > 2:7631638/1‑93 (MQ=255) cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 2:1978863/93‑1 (MQ=255) cTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 1:1847848/93‑1 (MQ=255) cTGAGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGaaa < 2:7787014/93‑1 (MQ=255) tGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAg > 1:1561208/1‑93 (MQ=255) tGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAg < 1:763879/93‑1 (MQ=255) ggCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGt > 1:300055/1‑93 (MQ=255) ggcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 2:2642043/92‑1 (MQ=255) cgcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 1:3655922/93‑1 (MQ=255) cgcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 1:1002726/93‑1 (MQ=255) cgcgcCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 1:2643501/93‑1 (MQ=255) cccgccgcGTGGTCAGGCATTCTGCCCGTTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAt < 2:5223936/91‑1 (MQ=255) cgccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATgg < 2:7159483/93‑1 (MQ=255) cgccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATgg < 2:619018/93‑1 (MQ=255) gccgcGTGGGCAGGAATGCTTGCCGGTACGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGt < 2:3686719/93‑1 (MQ=255) ccgcGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGtt > 2:5034706/1‑93 (MQ=255) gcgTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTAt < 2:7084205/93‑1 (MQ=255) cgTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATc < 1:6125792/93‑1 (MQ=255) gTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGAGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCg > 1:5833373/1‑93 (MQ=255) tGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCgg > 1:439316/1‑93 (MQ=255) tGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCgg < 2:628164/93‑1 (MQ=255) tCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGc < 1:3502307/93‑1 (MQ=255) tCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGc > 1:6762273/1‑93 (MQ=255) cAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCt > 2:1342253/1‑93 (MQ=255) ggCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTc < 1:6311456/93‑1 (MQ=255) ggCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTc < 2:7917499/93‑1 (MQ=255) ggCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTc < 1:1691995/93‑1 (MQ=255) gCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCt < 1:1147408/93‑1 (MQ=255) gCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCt > 2:4674494/1‑93 (MQ=255) cATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTg < 2:6449581/93‑1 (MQ=255) aTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGa > 2:219309/1‑93 (MQ=255) tCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAg > 1:6870867/1‑93 (MQ=255) tgtgCCGCTTCGCCGGCCGACACTGCACCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAgg < 2:234373/90‑1 (MQ=255) tGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGt < 1:4441071/93‑1 (MQ=255) tGGCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGt > 2:7299402/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTAc < 1:842215/93‑1 (MQ=255) gCCGGTTCGCAGCCCCACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACTCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTAc < 1:325011/93‑1 (MQ=255) cGGTTCCCGGGCCGACATTGCATCGTTATCGCGAACAGCTACATGGCGAATTACGCTGCAAAGGTATGGTTATCGGTTCTTGTGACGGTACTg > 2:6667226/1‑93 (MQ=255) gTTCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGaa > 2:6810182/1‑93 (MQ=255) ttCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAg > 1:2438722/1‑93 (MQ=255) tCGCGGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGt < 1:3415264/93‑1 (MQ=255) cgGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaa < 2:4282038/93‑1 (MQ=255) cgGGCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTaa < 1:6621228/93‑1 (MQ=255) ggCCGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAg < 2:4570098/93‑1 (MQ=255) ccGACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGAGAATTACGCTGGAAAGGCATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCg > 1:698813/1‑93 (MQ=255) gACACTGTATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGCATGGATATCGGTGCTTCTGGAGGTACTGAAGTTAAAGCGAt > 2:74322/1‑93 (MQ=255) gACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAt < 1:5897161/93‑1 (MQ=255) gACACTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAt > 1:999560/1‑93 (MQ=255) | ACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAT > NC_000913/3785292‑3785471 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |