| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,791,507 | T→C | intergenic (‑182/‑107) | htrL ← / → rfaD | HtrL/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,791,507 | 0 | T | C | 99.7% | 922.4 / ‑4.9 | 290 | intergenic (‑182/‑107) | htrL/rfaD | HtrL/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (245/44); total (246/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
AATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTCCATA > NC_000913/3791417‑3791596 | aaTATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCAccc > 2:1012962/1‑93 (MQ=255) atatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCt > 1:7072728/1‑93 (MQ=255) tatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCtt > 1:4973894/1‑93 (MQ=255) tatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCtt > 2:1914313/1‑93 (MQ=255) ttGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGc > 1:4403638/1‑93 (MQ=255) aTACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCAcc > 2:7581244/1‑93 (MQ=255) aCTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACctc > 2:7167927/1‑93 (MQ=255) cTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACctct > 2:5275905/1‑93 (MQ=255) tAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTa > 2:4733136/1‑93 (MQ=255) tAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTa > 1:7741870/1‑93 (MQ=255) tAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTa > 1:5298738/1‑93 (MQ=255) tAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTa > 2:7075657/1‑93 (MQ=255) aaaGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTAt > 2:5857559/1‑93 (MQ=255) cTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAg > 2:2931505/1‑93 (MQ=255) tATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAgg > 1:6885769/1‑93 (MQ=255) tATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAgg > 2:5950984/1‑93 (MQ=255) tATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAgg > 1:4076549/1‑93 (MQ=255) tATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAgg > 2:6600914/1‑93 (MQ=255) aTTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAggg > 2:1178266/1‑93 (MQ=255) aTTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAggg > 1:1351805/1‑93 (MQ=255) ttCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGc > 2:4899952/1‑93 (MQ=255) cacaTGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTg > 1:6909170/1‑93 (MQ=255) tGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAgg > 2:4853760/1‑93 (MQ=255) tGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAgg < 2:5764053/93‑1 (MQ=255) tGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAgg > 2:7253635/1‑93 (MQ=255) aaaaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGAt > 1:6302099/1‑93 (MQ=255) aaaaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGAt > 2:3795495/1‑93 (MQ=255) aaaaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGAt > 2:407441/1‑93 (MQ=255) aaaCCAACATCCGCCATGGAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGAtt > 2:7742835/1‑93 (MQ=255) aaaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGAtt < 1:1929006/93‑1 (MQ=255) aaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTc > 1:2882966/1‑93 (MQ=255) aCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCg > 2:1833824/1‑93 (MQ=255) aaCATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAt > 2:4504449/1‑93 (MQ=255) aCATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtg > 2:419436/1‑93 (MQ=255) aCATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtg > 1:5430121/1‑93 (MQ=255) cATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtgt > 1:2812927/1‑93 (MQ=255) aTCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtgtg > 1:6663811/1‑93 (MQ=255) aTCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtgtg > 2:5986287/1‑93 (MQ=255) aTCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtgtg > 1:1544672/1‑93 (MQ=255) tCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGa > 1:5077859/1‑93 (MQ=255) tCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGa > 1:5924306/1‑93 (MQ=255) tCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGa > 2:206496/1‑93 (MQ=255) cGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATg > 1:7424482/1‑93 (MQ=255) cGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATg > 2:6449705/1‑93 (MQ=255) ccATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGt > 1:4730237/1‑93 (MQ=255) ccATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGt > 1:2144744/1‑93 (MQ=255) aTGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTAt > 2:2311202/1‑93 (MQ=255) tGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATg > 1:6092211/1‑93 (MQ=255) gAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATgt > 1:1798339/1‑92 (MQ=255) gAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGa > 1:2693565/1‑93 (MQ=255) aGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGAtt > 2:150178/1‑93 (MQ=255) aGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGAtt > 1:311580/1‑93 (MQ=255) ggACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTa < 1:576291/93‑1 (MQ=255) gACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTaa > 2:1381496/1‑92 (MQ=255) aCTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACa < 2:1356157/93‑1 (MQ=255) aCTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACa < 2:5632444/93‑1 (MQ=255) tAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGa > 1:2943626/1‑93 (MQ=255) tAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGa > 2:2585875/1‑93 (MQ=255) tAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGa > 2:3192284/1‑93 (MQ=255) cTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACAt > 1:926158/1‑93 (MQ=255) tAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACAtt > 1:3814200/1‑93 (MQ=255) aaaaCCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTc > 1:2329203/1‑93 (MQ=255) aaCCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCgt > 2:3551051/1‑93 (MQ=255) aCCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCgtg > 2:1303427/1‑93 (MQ=255) aCCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCgtg > 2:554360/1‑93 (MQ=255) ccAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTc > 1:373817/1‑93 (MQ=255) cAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCt > 2:6233792/1‑93 (MQ=255) cAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCt > 2:6836481/1‑93 (MQ=255) cAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCt > 2:4412253/1‑93 (MQ=255) aaaCTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTg > 2:3262814/1‑93 (MQ=255) aaaCTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTg > 2:2235552/1‑93 (MQ=255) aaCTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTga > 1:1428792/1‑93 (MQ=255) aCTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTgag > 2:3055181/1‑93 (MQ=255) cTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTgaga > 1:5046099/1‑93 (MQ=255) cTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTgaga < 1:4153584/93‑1 (MQ=255) cTAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTgaga < 1:6465753/93‑1 (MQ=255) tAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGAt > 1:6748981/1‑93 (MQ=255) tAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGAt > 2:7662547/1‑93 (MQ=255) tAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGAt < 2:6522610/93‑1 (MQ=255) tAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGAt > 2:2835949/1‑93 (MQ=255) tAGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGAt > 2:6911869/1‑93 (MQ=255) aGTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGAtt > 1:3464612/1‑93 (MQ=255) gTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTg > 1:7581521/1‑93 (MQ=255) gTTTGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTg > 2:7425001/1‑93 (MQ=255) tttGTTGCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGt > 2:5153984/1‑93 (MQ=255) ttgttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGtc > 2:1644061/1‑93 (MQ=255) tgttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGtct > 1:3009435/1‑93 (MQ=255) gttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGtctc > 2:2978766/1‑93 (MQ=255) gttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGtctc < 1:7146010/93‑1 (MQ=255) ttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTctct < 2:5289141/93‑1 (MQ=255) ttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTctct > 2:2704028/1‑93 (MQ=255) ttgCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTctct > 2:1792894/1‑93 (MQ=255) gCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGa < 1:2220648/93‑1 (MQ=255) gCAATTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGa > 1:3231919/1‑93 (MQ=255) aaTTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACt > 1:5695597/1‑93 (MQ=255) aTTAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTc > 2:5672205/1‑93 (MQ=255) ttAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTcc > 1:1230799/1‑93 (MQ=255) ttAGCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTcc < 2:1203546/93‑1 (MQ=255) gCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTCCATa < 1:1012962/93‑1 (MQ=255) gCACCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTCCATa > 2:7868289/1‑93 (MQ=255) | AATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGTCTGAGATTGTCTCTGACTCCATA > NC_000913/3791417‑3791596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |