| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,819,792 | A→G | V20V (GTA→GTG) | rpoZ → | RNA polymerase omega subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,819,792 | 0 | A | G | 99.6% | 1531.8 / ‑4.5 | 488 | V20V (GTA→GTG) | rpoZ | RNA polymerase omega subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (233/253); total (233/255) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819702‑3819881 | gTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCt > 1:1259025/1‑93 (MQ=255)gTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCt > 1:3608200/1‑93 (MQ=255) tCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTg > 1:428388/1‑93 (MQ=255) aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 2:1110835/1‑93 (MQ=255) tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc < 2:5406528/93‑1 (MQ=255) tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 2:4791028/1‑93 (MQ=255) ttcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcg > 1:23459/1‑93 (MQ=255) tcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgc < 2:3392769/93‑1 (MQ=255) cttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgcc > 2:3002914/1‑93 (MQ=255) ttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTagccg < 2:55390/93‑1 (MQ=255) aCCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcgc > 1:5275685/1‑93 (MQ=255) cTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGt < 2:239415/93‑1 (MQ=255) cTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGt < 1:2143865/93‑1 (MQ=255) tgtgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTc > 1:987826/1‑93 (MQ=255) tgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgc < 1:7167431/93‑1 (MQ=255) tgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgc > 1:5143112/1‑93 (MQ=255) ggAGCTTTTGAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgcg > 2:5239216/1‑93 (MQ=255) gAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCgtgc > 1:5391148/1‑93 (MQ=255) gAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCgcgc > 1:1844713/1‑93 (MQ=255) ggCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAAGTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCt < 1:7205060/92‑1 (MQ=255) aGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCt < 1:38646/93‑1 (MQ=255) gCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTc > 2:3213992/1‑93 (MQ=255) tttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGt > 2:7566670/1‑93 (MQ=255) tttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGt > 2:4035287/1‑93 (MQ=255) tttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGt > 1:4892085/1‑93 (MQ=255) ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTc < 1:865860/93‑1 (MQ=255) tttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCa > 1:7009363/1‑93 (MQ=255) aaGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGag > 2:6029196/1‑92 (MQ=255) aaGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGAt < 1:7914557/93‑1 (MQ=255) tATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCa > 2:7203506/1‑93 (MQ=255) tATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCa < 2:3950722/93‑1 (MQ=255) tATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCa < 2:3158500/93‑1 (MQ=255) tATGGCACGCGTAACTGTTCAATACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTCGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCa > 1:1385977/1‑93 (MQ=255) aTGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAg < 2:4164917/93‑1 (MQ=255) gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 2:1613380/93‑1 (MQ=255) cACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAg < 1:2840795/93‑1 (MQ=255) cACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAg < 2:3648223/93‑1 (MQ=255) aCGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAgg > 1:3350138/1‑93 (MQ=255) cgcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGc > 1:1947972/1‑93 (MQ=255) cgcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGc < 1:3235052/93‑1 (MQ=255) gcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCg < 1:4491400/93‑1 (MQ=255) gcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGCAGGCg > 1:2483229/1‑93 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 2:7655286/1‑93 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 1:3020755/1‑93 (MQ=255) aaCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaaa > 1:4817172/1‑93 (MQ=255) aCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAg < 1:7467230/93‑1 (MQ=255) aCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAg < 1:6153885/93‑1 (MQ=255) cTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAgg > 1:7611614/1‑93 (MQ=255) cTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAgg < 2:4940244/93‑1 (MQ=255) tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa < 2:562878/93‑1 (MQ=255) ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:5793993/93‑1 (MQ=255) ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:6503/93‑1 (MQ=255) tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 2:1745212/93‑1 (MQ=255) tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 2:2000032/93‑1 (MQ=255) cAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCg > 2:2164659/1‑93 (MQ=255) aGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGc < 2:1238636/93‑1 (MQ=255) aGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGc < 2:6717066/93‑1 (MQ=255) ggACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCt > 2:1018/1‑93 (MQ=255) ggACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCt < 2:2671485/93‑1 (MQ=255) ggACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCt < 2:6925239/93‑1 (MQ=255) gACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTg > 2:4861438/1‑93 (MQ=255) aCGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTgg < 1:3716773/93‑1 (MQ=255) gCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTa < 1:1464842/93‑1 (MQ=255) cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc < 2:445641/93‑1 (MQ=255) cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc > 1:771527/1‑93 (MQ=255) cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc < 2:6985042/93‑1 (MQ=255) tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGTTCCGCTGGTAcc > 1:2769140/1‑93 (MQ=255) tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc > 2:7903335/1‑93 (MQ=255) tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc > 2:4627555/1‑93 (MQ=255) tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc > 1:1058109/1‑93 (MQ=255) tAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa > 1:5991725/1‑68 (MQ=255) tAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCgg < 2:1330063/93‑1 (MQ=255) tAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTAGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCgg < 2:3836789/93‑1 (MQ=255) gagaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaa < 2:7031058/93‑1 (MQ=255) gaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaaga > 2:3591170/1‑93 (MQ=255) aaTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGaaaa > 1:3474339/1‑93 (MQ=255) aTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAAc < 2:5960915/93‑1 (MQ=255) aTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAAc > 1:4719447/1‑93 (MQ=255) ttGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACg > 2:4401651/1‑93 (MQ=255) tGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGa < 1:7650191/93‑1 (MQ=255) gTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATa < 1:4559462/93‑1 (MQ=255) tAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaa > 1:7554727/1‑93 (MQ=255) aaCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCATGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaaa < 1:1191206/93‑1 (MQ=255) aCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaaaa < 2:836878/93‑1 (MQ=255) aCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaaaa > 1:294525/1‑93 (MQ=255) ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 2:5848633/93‑1 (MQ=255) ttttGACCGGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 1:6769158/93‑1 (MQ=255) ttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTg < 1:3145102/93‑1 (MQ=255) tGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt > 1:4026751/1‑93 (MQ=255) gccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa < 2:2843437/92‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa < 1:5045799/93‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa > 2:6361001/1‑93 (MQ=255) aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa < 2:2938901/93‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATc < 2:6187514/93‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATc > 1:266074/1‑93 (MQ=255) tGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcg > 1:5539355/1‑93 (MQ=255) tGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcg < 1:1791730/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc > 1:6304521/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc > 2:7304177/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc > 2:1834222/1‑93 (MQ=255) | GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819702‑3819881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |