| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 424,669 | C→T | G145G (GGC→GGT) | queA → | putative S‑adenosylmethionine |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 424,669 | 0 | C | T | 99.7% | 1108.2 / NA | 310 | G145G (GGC→GGT) | queA | putative S‑adenosylmethionine |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (159/150); minor base G (1/0); total (160/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TAACGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGCCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCGGGCGC > NC_000913/424579‑424758 | tAACGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCa < 2:7665043/93‑1 (MQ=255)tAACGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCa < 2:1683356/93‑1 (MQ=255) aCGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCata < 1:1207401/93‑1 (MQ=255) aCGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCata < 1:6423050/93‑1 (MQ=255) aCGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCata < 2:3276206/93‑1 (MQ=255) aCGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCata < 1:3011605/93‑1 (MQ=255) cGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCatat < 1:5207336/93‑1 (MQ=255) cGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCatat < 2:1355485/93‑1 (MQ=255) caacaaTGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATAtgc < 2:2570681/93‑1 (MQ=255) caacaaTGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATAtgc < 1:5080853/93‑1 (MQ=255) aacaaTGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATAtgcc > 1:6779494/1‑93 (MQ=255) aacaaTGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATAtgcc > 2:2032211/1‑93 (MQ=255) acaaTGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATAtgccg < 2:1894917/93‑1 (MQ=255) caaTGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATAtgccgc > 1:7893918/1‑93 (MQ=255) 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aaTTCAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTg > 1:5379516/1‑93 (MQ=255) aTTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGa < 2:5739276/93‑1 (MQ=255) ttAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGAcc < 2:1453010/93‑1 (MQ=255) ttAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGAcc > 1:4158134/1‑93 (MQ=255) tAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACcg > 2:6564385/1‑93 (MQ=255) aataatGAACGCTCGGTGCTGTATATTATCAACAGCATCGGTCATATCCCGCAGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACcgc < 2:7333343/93‑1 (MQ=255) tgatgaACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGa > 1:6735276/1‑93 (MQ=255) tgatgaACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGa > 1:3923097/1‑93 (MQ=255) gatgaACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGac > 2:6850785/1‑92 (MQ=255) gatgaACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGaa > 1:5636673/1‑93 (MQ=255) gaACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACtt < 1:4771548/93‑1 (MQ=255) aaCGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACttt > 2:3655747/1‑93 (MQ=255) gCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATc > 1:3171419/1‑93 (MQ=255) gCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATc < 1:3148718/93‑1 (MQ=255) gCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATc > 2:2111954/1‑93 (MQ=255) gCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATc > 1:5539946/1‑93 (MQ=255) cTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCa > 2:6441351/1‑93 (MQ=255) tCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCaa > 2:4445578/1‑93 (MQ=255) cGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCaaa > 2:2930492/1‑93 (MQ=255) cGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCaaa < 2:3985633/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAAc > 2:6708453/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAAc < 1:663884/93‑1 (MQ=255) gttcTGGACATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAAcc < 1:7377258/90‑1 (MQ=255) gTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAAcc < 2:6061185/93‑1 (MQ=255) 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atTCTCAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGc < 2:7086472/93‑1 (MQ=255) ttCTCAACAGCATCGCTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACTAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCg < 1:3660839/93‑1 (MQ=255) tctcAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGa > 1:205600/1‑93 (MQ=255) tctcAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGa > 2:3157509/1‑93 (MQ=255) ctcAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGaa < 2:5477388/93‑1 (MQ=255) ctcAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGaa > 1:1558781/1‑93 (MQ=255) tcAACAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGaaa > 1:410446/1‑93 (MQ=255) aaCAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGaaaaa < 1:1647702/93‑1 (MQ=255) cAGCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAAcc < 2:4970058/93‑1 (MQ=255) gCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCgg > 2:7560929/1‑93 (MQ=255) gCATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCgg < 2:6932664/93‑1 (MQ=255) cATCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCggg < 1:6489338/93‑1 (MQ=255) aTCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCGGgc < 1:1144485/93‑1 (MQ=255) aTCGGTCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCGGgc > 2:2437111/1‑93 (MQ=255) | TAACGCAACAATGACCGCGCGCCACGGCGCACTGTTTGAAGTCGAATTTAATGATGAACGCTCGGTGCTGGATATTCTCAACAGCATCGGCCATATGCCGCTGCCGCCGTATATCGACCGTCCGGACGAAGACGCTGACCGCGAACTTTATCAAACCGTTTATAGCGAAAAACCGGGCGC > NC_000913/424579‑424758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |