| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,957,165 | C→T | V89V (GTG→GTA) | ppiC ← | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,957,165 | 0 | C | T | 99.7% | 1302.4 / ‑5.8 | 372 | V89V (GTG→GTA) | ppiC | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (198/173); total (198/174) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
ATGCCCTCACCCCGA‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGG > NC_000913/3957077‑3957254 | aTGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTCGCGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCa > 2:1372492/1‑93 (MQ=21) cTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTa > 1:722109/1‑93 (MQ=25) tCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTaa < 2:3416009/93‑1 (MQ=25) tCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTaa < 2:2522403/93‑1 (MQ=25) tCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTaa > 1:7648439/1‑93 (MQ=25) cACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGGGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAat > 1:1637316/1‑93 (MQ=25) cACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAat > 2:5248539/1‑93 (MQ=37) gaccctctCCCCCAGGGGGAGGGAGAAAACACTCAAA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGGCTTGCTATTAGTTGCGGGACAGTACCTTAATGAtttg > 2:2251075/5‑93 (MQ=255) gaccctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGGCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGAtgtg > 2:7565311/5‑93 (MQ=38) accctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGa < 2:4433766/90‑1 (MQ=38) accctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGa > 1:7716766/4‑93 (MQ=38) accctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGa < 1:3379505/90‑1 (MQ=38) ccctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGat < 1:2279135/91‑1 (MQ=38) cctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGata < 1:1109746/92‑1 (MQ=39) cctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGata > 1:1708125/2‑93 (MQ=39) cctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGata > 1:2094018/2‑93 (MQ=39) ctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGatat > 2:4808518/1‑93 (MQ=255) ctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGatat > 1:7339230/1‑93 (MQ=255) ctcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATcc < 2:3925715/93‑1 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCg < 1:7290944/93‑1 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCg > 1:7474902/1‑93 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCg > 1:4190471/1‑93 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGGTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCg > 1:2900624/1‑93 (MQ=255) ccccACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCg < 2:5868741/92‑1 (MQ=255) ccACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGaa < 1:675440/93‑1 (MQ=255) ccACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGaa < 2:5829797/93‑1 (MQ=255) cacaGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAAc < 2:1866729/93‑1 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACt > 1:3592343/1‑93 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACt > 1:439506/1‑93 (MQ=255) agggagagggagAAAACACTC‑AATGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTgg < 2:4274989/93‑1 (MQ=255) gggagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg < 1:3886679/93‑1 (MQ=255) gggagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg > 1:4215571/1‑93 (MQ=255) gggagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg > 1:5560521/1‑93 (MQ=255) gggagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTACTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg < 1:4654605/93‑1 (MQ=255) gagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtg < 1:6502674/93‑1 (MQ=255) gagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtg < 1:4976138/93‑1 (MQ=255) gagagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtg > 2:2598855/1‑93 (MQ=255) agagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtgt > 1:3808719/1‑93 (MQ=255) agagggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtgt < 2:7219774/93‑1 (MQ=255) gggagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCa < 1:6335355/93‑1 (MQ=255) gaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCgg < 2:4500612/93‑1 (MQ=255) aagcacTC‑AAGGCGTCCTCCTGGAGACGGCATTGCTATGAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc < 1:5372885/90‑1 (MQ=255) aaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc > 1:5500478/1‑93 (MQ=255) aaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc > 2:6108260/1‑93 (MQ=255) aaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc > 1:7512297/1‑93 (MQ=255) aaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGCGGGGCAGCGGGc > 1:2471842/1‑93 (MQ=255) acacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCg < 2:5474092/93‑1 (MQ=255) cacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCgg > 2:1683118/1‑93 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGt < 2:2117424/93‑1 (MQ=255) cTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTc > 2:958030/1‑93 (MQ=255) aaggCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGc > 2:1176033/4‑93 (MQ=255) aggCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTCGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCt > 2:4298993/3‑93 (MQ=255) ggCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTc > 2:4044649/2‑93 (MQ=255) ggCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTc > 1:5088601/2‑93 (MQ=255) gCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTcc < 1:5719506/93‑1 (MQ=255) gCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTcc > 2:7893679/1‑93 (MQ=255) ccTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCa < 1:6157104/93‑1 (MQ=255) ccTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCa < 1:4756836/93‑1 (MQ=255) cTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAg < 2:1939713/93‑1 (MQ=255) cTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAg > 1:3119567/1‑93 (MQ=255) cTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAg < 1:3251358/93‑1 (MQ=255) ttCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGt > 1:997001/1‑93 (MQ=255) tctcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTa > 1:7035870/1‑93 (MQ=255) tcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTAcc > 1:7868876/1‑93 (MQ=255) ggAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGaa > 1:2657489/1‑92 (MQ=255) agaAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACaa < 2:3148480/93‑1 (MQ=255) agaAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACaa > 1:3345208/1‑93 (MQ=255) gaAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAag > 2:1517121/1‑93 (MQ=255) gaAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAag > 1:1853281/1‑93 (MQ=255) aaGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAaga > 1:3137233/1‑93 (MQ=255) aaGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAaga > 1:3559149/1‑93 (MQ=255) ggCCTTGCTATTAGTTGTGGCACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAgaga > 1:6031266/1‑93 (MQ=255) gCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaa > 2:2870479/1‑93 (MQ=255) ccTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaa > 1:1002653/1‑93 (MQ=255) cTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaaa > 2:5120443/1‑93 (MQ=255) cTTGCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaaa > 1:5159689/1‑93 (MQ=255) gCTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCa > 1:928877/1‑93 (MQ=255) cTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCAc > 1:1477933/1‑93 (MQ=255) cTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCAc < 2:2745536/93‑1 (MQ=255) cTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCAc < 2:7757420/93‑1 (MQ=255) cTATTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCAc > 2:1461823/1‑93 (MQ=255) aTTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACtt < 2:6986390/93‑1 (MQ=255) aTTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACtt > 2:8869/1‑93 (MQ=255) aTTAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACtt < 2:4617293/93‑1 (MQ=255) ttAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACttt > 2:6386984/1‑93 (MQ=255) ttAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACttt < 1:2035935/93‑1 (MQ=255) tAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTa < 2:5667471/93‑1 (MQ=255) tAGTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTa < 1:4057616/93‑1 (MQ=255) gTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATc > 1:693438/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATc < 2:2390838/93‑1 (MQ=255) ttGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTCCCGGCCAAGAGAAAACCACTTTATca > 1:282349/1‑92 (MQ=255) ttGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCg > 1:1338999/1‑93 (MQ=255) ttGCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCg > 2:4936082/1‑93 (MQ=255) gCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGaa > 2:6180874/1‑93 (MQ=255) gCGGTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGaa < 2:6561232/93‑1 (MQ=255) cGGTACAGTACGTTACTGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAAc < 2:3808877/93‑1 (MQ=255) ggTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACg > 2:7319981/1‑93 (MQ=255) ggTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACg < 2:3073772/93‑1 (MQ=255) gTACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGc > 1:5285600/1‑93 (MQ=255) tACAGTACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGcc > 1:3085028/1‑93 (MQ=255) | ATGCCCTCACCCCGA‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTC‑AA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGG > NC_000913/3957077‑3957254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |