Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,964,041 | A→G | T4A (ACC→GCC) | rho → | transcription termination factor Rho |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,964,041 | 0 | A | G | 99.2% | 1198.2 / ‑2.8 | 383 | T4A (ACC→GCC) | rho | transcription termination factor Rho |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); new base G (179/201); total (180/203) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
TAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTACCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGAC > NC_000913/3963951‑3964130 | tAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGcc > 1:3984938/1‑93 (MQ=255) tAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGcc > 2:4567338/1‑93 (MQ=255) aaCAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGa > 2:2079408/1‑93 (MQ=255) aCAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGaa < 1:2545276/93‑1 (MQ=255) aCAGGCATGGAAGATCCAGCCATACCGTTCACAACATTGAGTTAGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGaa < 2:7045247/93‑1 (MQ=255) tcgtcATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAAt < 2:6474756/89‑1 (MQ=255) cAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAAt > 1:6737865/1‑93 (MQ=255) ggCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTa > 1:2864260/1‑93 (MQ=255) cATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTaaa < 2:1564884/93‑1 (MQ=255) tgaatgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGa < 1:1500090/90‑1 (MQ=255) tGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGa > 2:7686077/1‑93 (MQ=255) tGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGa > 2:5958455/1‑93 (MQ=255) ggATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGaa < 2:5447288/93‑1 (MQ=255) ggATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGaa < 1:6281084/93‑1 (MQ=255) gatgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAAt < 1:865225/93‑1 (MQ=255) gatgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCAAAGCTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTCGCCGAATTACAGAAt > 1:4591153/1‑93 (MQ=255) tgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATAc > 2:5699965/1‑93 (MQ=255) tCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGcc > 1:618097/1‑93 (MQ=255) tCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGcc < 2:829542/93‑1 (MQ=255) ccTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCg < 1:114708/93‑1 (MQ=255) cTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCgg < 1:36401/93‑1 (MQ=255) tGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGt > 1:5324667/1‑93 (MQ=255) tGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGt > 1:5036685/1‑93 (MQ=255) tGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGt < 1:2004856/93‑1 (MQ=255) ccATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGttt > 1:3440738/1‑93 (MQ=255) cATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTc > 2:3357148/1‑93 (MQ=255) cATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTc < 2:299409/93‑1 (MQ=255) cATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTc < 1:309040/93‑1 (MQ=255) cATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTc > 1:6651605/1‑93 (MQ=255) cATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTAAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTc > 2:2404592/1‑93 (MQ=255) tACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTg > 2:2005696/1‑93 (MQ=255) tACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTg > 2:6187839/1‑93 (MQ=255) tACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTg > 1:6308573/1‑93 (MQ=255) aCCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGa < 1:1272288/93‑1 (MQ=255) cATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGc < 1:7226154/93‑1 (MQ=255) aTTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCt > 2:3988138/1‑93 (MQ=255) aTTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCt < 1:3825923/93‑1 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg > 1:7367042/1‑93 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg > 2:172666/1‑93 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg > 2:7223395/1‑93 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg < 1:3208720/93‑1 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg > 2:3431537/1‑93 (MQ=255) cacaACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGAt < 1:3326888/93‑1 (MQ=255) acaacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATc < 1:188404/93‑1 (MQ=255) aacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCAc > 2:5553256/1‑93 (MQ=255) acaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCAct > 1:1408395/1‑93 (MQ=255) aTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCActct < 1:2698711/93‑1 (MQ=255) aTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCActct > 1:6986142/1‑93 (MQ=255) ttAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACtctc < 1:7615275/93‑1 (MQ=255) ttAAGTTCAAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACtctc < 2:7528263/93‑1 (MQ=255) aGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGc > 2:498982/1‑93 (MQ=255) gTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCg > 1:499359/1‑93 (MQ=255) agaTTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAat > 2:5083339/1‑93 (MQ=255) gaTTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAata < 2:1425859/93‑1 (MQ=255) gaTTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAata < 1:2330867/93‑1 (MQ=255) gaTTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAata < 2:2197226/93‑1 (MQ=255) gaTTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAata > 2:7371267/1‑93 (MQ=255) tttACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTNATCACTCTCGGCGAAAATATg > 1:5968657/1‑93 (MQ=255) tttACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATg < 1:5844622/93‑1 (MQ=255) tACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATggg > 1:7834600/1‑93 (MQ=255) cccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCt < 2:679171/93‑1 (MQ=255) ccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTg < 2:2929746/93‑1 (MQ=255) ccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTg > 2:7788911/1‑93 (MQ=255) aaGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGa > 2:2695759/1‑93 (MQ=255) aaGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGa > 2:183903/1‑93 (MQ=255) aaGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGa < 2:1185430/93‑1 (MQ=255) aGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGaa < 2:301601/93‑1 (MQ=255) ttAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAAc < 2:4640669/93‑1 (MQ=255) tAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAAcc < 2:1049045/93‑1 (MQ=255) aaGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCt < 2:4794054/93‑1 (MQ=255) aaGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCt < 2:4883733/93‑1 (MQ=255) aGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTg < 1:3511994/93‑1 (MQ=255) aGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTg < 1:5645542/93‑1 (MQ=255) aGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTg < 2:6685220/93‑1 (MQ=255) aGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTg < 2:5300750/93‑1 (MQ=255) aaCTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGc < 2:7452554/93‑1 (MQ=255) aaCTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGc < 2:2590528/93‑1 (MQ=255) cTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTc < 1:4297023/93‑1 (MQ=255) tCACGCCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCg < 2:5223036/93‑1 (MQ=255) tCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCAGGAAAACCTGGCTCg > 1:5445181/1‑93 (MQ=255) acacCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTa < 1:492250/93‑1 (MQ=255) acacCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTa < 2:6911755/93‑1 (MQ=255) acacCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTa < 1:2102532/93‑1 (MQ=255) acacCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTa < 2:6348752/93‑1 (MQ=255) acacCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTa < 2:2318165/93‑1 (MQ=255) caccacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTAt < 1:1753916/93‑1 (MQ=255) caccacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTAt < 1:4114270/93‑1 (MQ=255) ccacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGc < 2:3684134/93‑1 (MQ=255) cacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCg > 1:7892089/1‑93 (MQ=255) cacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCg > 2:7848679/1‑93 (MQ=255) cTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTa < 2:6611921/93‑1 (MQ=255) cTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTa > 1:7017766/1‑93 (MQ=255) cTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTa < 1:2775948/93‑1 (MQ=255) tATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGGATGCGTaa > 2:3142443/1‑93 (MQ=255) aTGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAg < 1:160495/93‑1 (MQ=255) tGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGc > 1:2391025/1‑93 (MQ=255) gAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCa < 2:3242200/93‑1 (MQ=255) tCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGa > 1:6857421/1‑93 (MQ=255) tCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGa < 2:438324/93‑1 (MQ=255) tCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGa < 1:1079120/93‑1 (MQ=255) | TAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTACCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGAC > NC_000913/3963951‑3964130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |