| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,991,539 | T→C | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,991,539 | 0 | T | C | 99.7% | 1183.2 / NA | 368 | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (175/192); total (175/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > NC_000913/3991449‑3991630 | ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 2:3780487/93‑1 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCCCtctc > 2:1515399/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:5447959/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:5287817/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 2:6255969/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 2:74623/1‑93 (MQ=255) ttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCa > 2:7430417/1‑93 (MQ=255) tCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTa > 1:7635228/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt > 2:1777909/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:6078134/93‑1 (MQ=255) aaaaTGATAGCCGCCCTGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 2:1294978/93‑1 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg > 2:2580544/1‑93 (MQ=255) aaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg < 1:7745358/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 2:6413385/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 1:4865257/93‑1 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt > 1:5857123/1‑93 (MQ=255) aTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt > 1:1558259/1‑93 (MQ=255) tGGTAGCCGCCTTGTTTGGTTGCCAGCCATGCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 2:3035491/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTTCCAGGCATACCTGGTGCAGCTGCTCCTGGCGGTTGATTATGACTTTGCTGCCACTCTCTAAGTCTATGGTc > 2:619244/1‑93 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 2:3968956/93‑1 (MQ=255) aggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc < 1:749719/92‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCa > 2:3356212/1‑93 (MQ=255) gtcgccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg < 1:2613574/90‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg > 1:579998/1‑93 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 1:7270995/93‑1 (MQ=255) gccgccCTGTTGGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc < 1:1054560/93‑1 (MQ=255) cgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgc > 2:6678860/1‑93 (MQ=255) cgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgc < 1:5545768/93‑1 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc > 2:2546312/1‑93 (MQ=255) cccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccg > 1:2665445/1‑93 (MQ=255) cttGTTTGGTGGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccgc < 2:780180/91‑1 (MQ=255) cTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACgccgcc > 2:6500580/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg > 1:1967113/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGATTTTGCTGGCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGccgccg > 2:603147/1‑93 (MQ=255) gTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt > 1:7351614/1‑93 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt > 2:720555/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGa < 2:836532/93‑1 (MQ=255) tGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGa < 1:24554/93‑1 (MQ=255) gTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt > 2:3878497/1‑93 (MQ=255) gTTGCCAGCCATACCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 1:3982993/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:1389183/93‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 2:5648286/93‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 1:5694895/93‑1 (MQ=255) ccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGc > 2:269353/1‑93 (MQ=255) cagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATTATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa > 1:4794465/1‑93 (MQ=255) cagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 2:4970061/93‑1 (MQ=255) agccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 1:6962333/93‑1 (MQ=255) ccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTc < 2:412664/93‑1 (MQ=255) caTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGCTTTCGCAGTCg > 1:6666897/1‑93 (MQ=255) aTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGa < 1:62935/93‑1 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 1:2170115/1‑93 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 2:7007837/1‑93 (MQ=255) aCCTGGCGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGata > 2:437500/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc > 2:7579639/1‑93 (MQ=255) tGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCg < 2:2363919/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc < 2:545772/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc > 1:5063248/1‑93 (MQ=255) gCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGt < 1:6399452/93‑1 (MQ=255) aGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCg < 1:3199762/93‑1 (MQ=255) gCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGc > 1:4525289/1‑93 (MQ=255) cGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGcc < 1:444679/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 1:792096/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 2:3688533/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTAATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCa < 1:1827530/93‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt > 1:4643681/1‑93 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt > 1:2313714/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc > 1:2937285/1‑93 (MQ=255) ccTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATccc < 2:4740954/93‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 2:6789927/1‑93 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 1:3585586/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAg < 1:7115540/93‑1 (MQ=255) cGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtca < 2:5135644/93‑2 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:1969236/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 1:3712675/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:4188052/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:5773753/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcatc > 2:5372913/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg < 1:971082/93‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 1:2521524/1‑93 (MQ=255) gATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAg > 2:2916088/1‑93 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg < 2:2823850/93‑1 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg < 1:4046735/93‑1 (MQ=255) aTAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAgg > 1:2393523/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 2:4436826/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 2:1625299/1‑93 (MQ=255) aaTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTAAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCg > 1:4131584/1‑93 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt < 1:6749378/93‑1 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt > 2:3561919/1‑93 (MQ=255) aTGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGt > 2:3196609/1‑93 (MQ=255) tGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGtt > 1:4315896/1‑93 (MQ=255) tGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGtt > 1:7830595/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttct < 1:3275131/93‑1 (MQ=255) aTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttct > 1:3440804/1‑93 (MQ=255) ttttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttctt < 2:2171843/93‑1 (MQ=255) ttttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGttctt > 1:6177133/1‑93 (MQ=255) ttGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCa < 2:6565018/93‑1 (MQ=255) ctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATg < 2:490327/93‑1 (MQ=255) tccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCATCCAGGCGTTCTTCAATGGt < 2:1209844/92‑1 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGGAATGGTCAGCACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCCCTGTCGCCATCCCAGCTATCCGGGCGATCTTCAATGGta > 1:1326343/1‑92 (MQ=255) aTTCTCAAAGGTAATGCTCAGTAAGCATCCGTAGCTGTCGCATTCGATATCGCTGCCGCCACCCCAGTCTTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAg < 2:7677986/93‑1 (MQ=255) | CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAG > NC_000913/3991449‑3991630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |