Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 502,653 | C→T | intergenic (‑191/+47) | ybaL ← / ← fsr | putative transport protein/fosmidomycin resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 502,653 | 0 | C | T | 99.3% | 945.4 / NA | 273 | intergenic (‑191/+47) | ybaL/fsr | putative transport protein/fosmidomycin resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (155/116); minor base A (2/0); total (157/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGCGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATC > NC_000913/502563‑502742 | attattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGa < 2:3488097/93‑1 (MQ=255) ttattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGAc < 1:416691/93‑1 (MQ=255) tattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACt > 2:7621006/1‑93 (MQ=255) tattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACt < 1:2609307/93‑1 (MQ=255) attGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTg > 1:7482937/1‑93 (MQ=255) attGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAAGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTg > 2:842719/1‑93 (MQ=255) gAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaa > 1:658446/1‑93 (MQ=255) ttttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAAc > 1:6114999/1‑93 (MQ=255) tggCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGTCTTATGGTGACTGTAAAACGa < 2:1780534/91‑1 (MQ=255) tGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGAt > 1:2739427/1‑93 (MQ=255) cAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGc < 2:6562321/93‑1 (MQ=255) aGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCa > 2:102864/1‑93 (MQ=255) aaaaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGc < 1:2683371/93‑1 (MQ=255) aaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCa > 1:4441740/1‑93 (MQ=255) aTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaaa < 2:4175154/93‑1 (MQ=255) aTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGAGACTGTAAAACGATGCAGCCaaa > 1:2288528/1‑93 (MQ=255) tGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAg > 1:2873828/1‑93 (MQ=255) tGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAg > 2:7864680/1‑93 (MQ=255) ggAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGt > 1:388360/1‑93 (MQ=255) aaTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGttt < 1:6664948/93‑1 (MQ=255) ttAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGGCAAAGTTTGc > 2:866580/1‑93 (MQ=255) ttAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGc < 1:2445125/93‑1 (MQ=255) tGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTg < 2:6141869/93‑1 (MQ=255) tGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTg > 1:3453173/1‑93 (MQ=255) gCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTgg < 1:3538269/93‑1 (MQ=255) gCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTgg > 2:6467812/1‑93 (MQ=255) aaaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCt > 1:5432751/1‑93 (MQ=255) aaaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCt > 1:1161279/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 1:7743369/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 2:3767918/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 1:2122984/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 1:282552/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 1:5887995/1‑93 (MQ=255) aaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGc > 1:4888817/1‑93 (MQ=255) aaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCa > 2:570754/1‑93 (MQ=255) aaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCaa < 1:5376499/93‑1 (MQ=255) aaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCaa > 2:3205220/1‑93 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAAt > 1:5184907/1‑93 (MQ=255) aGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATg > 1:328677/1‑93 (MQ=255) cACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaa < 1:2170279/93‑1 (MQ=255) aCGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaaa > 1:3665833/1‑93 (MQ=255) cGGATCGTAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAAt < 2:5278260/93‑1 (MQ=255) cGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAAt < 1:7283259/93‑1 (MQ=255) ggATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATc > 2:4504937/1‑93 (MQ=255) ggATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATc < 1:11025/93‑1 (MQ=255) gATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCa < 1:2209810/93‑1 (MQ=255) tCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGt > 2:4398089/1‑93 (MQ=255) tCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGt > 1:4071697/1‑93 (MQ=255) cGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTc < 1:6517579/93‑1 (MQ=255) ggAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCt > 1:7557173/1‑93 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCtt < 1:2474728/93‑1 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCtt > 2:2531062/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 2:5247745/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 2:7351821/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 2:913182/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa > 1:7816825/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa > 1:4592651/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa > 1:4807258/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 1:5510843/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 1:6823073/93‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTAt > 2:5478888/1‑93 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTAt < 2:5058591/93‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGc > 2:7240554/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGcc > 1:1282627/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGcc < 2:3611757/93‑1 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGcc > 1:7341966/1‑93 (MQ=255) aGGCGGGTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGGAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGt > 2:1881385/1‑93 (MQ=255) gCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTa < 1:6957154/93‑1 (MQ=255) gCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTa > 2:2135432/1‑93 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTtctc > 1:4989164/1‑93 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATc < 2:2856529/93‑1 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATc < 2:5655434/93‑1 (MQ=255) gTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca < 2:3054552/93‑1 (MQ=255) gTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca > 1:7103718/1‑93 (MQ=255) gTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca < 2:2045310/93‑1 (MQ=255) tAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggc > 1:6000660/1‑93 (MQ=255) aaCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggca < 1:7139324/93‑1 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa > 2:1263791/1‑93 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa < 1:183936/93‑1 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa > 1:4856635/1‑93 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa < 1:5615715/93‑1 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa > 2:2676036/1‑93 (MQ=255) agGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAat < 2:5960093/93‑1 (MQ=255) agGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAat < 1:1770429/93‑1 (MQ=255) ggAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAata > 1:296276/1‑93 (MQ=255) ggAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAata > 2:7689226/1‑93 (MQ=255) ggAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAata < 2:5322990/93‑1 (MQ=255) aaaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATg > 2:5141223/1‑93 (MQ=255) aaaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATg > 1:4578704/1‑93 (MQ=255) aaaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGATATCAGGCAGGAATATg > 2:757713/1‑93 (MQ=255) aaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATgg > 1:6201430/1‑93 (MQ=255) aGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGt < 2:4839125/93‑1 (MQ=255) aGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGt < 2:1173468/93‑1 (MQ=255) aGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGt > 2:4765656/1‑93 (MQ=255) ggCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTc > 1:2929669/1‑93 (MQ=255) ttATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAAc < 2:6788864/93‑1 (MQ=255) tATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACa < 2:3920458/93‑1 (MQ=255) tATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACa > 1:880604/1‑93 (MQ=255) aTGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACAt < 2:1462345/93‑1 (MQ=255) aTGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACAt > 1:5975681/1‑93 (MQ=255) | ATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGCGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATC > NC_000913/502563‑502742 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |