Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,450,334 | G→A | A64T (GCT→ACT) | ytfT → | putative transport system permease protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,450,334 | 0 | G | A | 99.7% | 1035.8 / NA | 308 | A64T (GCT→ACT) | ytfT | putative transport system permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (124/182); minor base C (0/1); total (124/184) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
GTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450244‑4450423 | cGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTcc < 2:1089107/93‑1 (MQ=255) cGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTcc < 1:5464034/93‑1 (MQ=255) cGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTcc < 2:3729672/93‑1 (MQ=255) gATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTccc < 2:1680475/93‑1 (MQ=255) gATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTccc > 1:6212815/1‑93 (MQ=255) aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg < 1:2722065/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt > 2:4754706/1‑93 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 1:1697305/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGCGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 2:1774156/93‑1 (MQ=255) cTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCg < 1:6893457/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGt > 2:4479635/1‑93 (MQ=255) ggTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGtt > 1:6481292/1‑93 (MQ=255) ggTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGtt < 1:1769215/93‑1 (MQ=255) ggTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGtt < 2:7777574/93‑1 (MQ=255) gTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTa > 1:6528574/1‑93 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg > 2:6212695/1‑93 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc > 1:1142711/1‑93 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc > 2:5240105/1‑93 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc > 1:2903141/1‑93 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTGCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc < 2:4409874/93‑1 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATTGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa < 1:6385464/93‑1 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa < 1:1950914/93‑1 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa < 1:317994/93‑1 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa < 1:3262233/93‑1 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa < 1:858672/93‑1 (MQ=255) gCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAt < 1:7885508/93‑1 (MQ=255) cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGTGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt < 1:7524772/93‑1 (MQ=255) aTTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg > 1:1916533/1‑93 (MQ=255) aTTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg < 2:3295048/93‑1 (MQ=255) aTTTCTGGCAGGTGGCGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg < 2:5210611/93‑1 (MQ=255) tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 2:7659244/1‑93 (MQ=255) tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 1:6851338/1‑93 (MQ=255) tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 2:1926788/1‑93 (MQ=255) ttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGc > 2:6795561/1‑93 (MQ=255) tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 2:2608913/93‑1 (MQ=255) tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 2:2991170/93‑1 (MQ=255) ttGGCAGGTGGTGCTTCAGGAGGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCAt < 2:6525372/92‑1 (MQ=255) ggCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGa < 1:5662373/93‑1 (MQ=255) gCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAc < 1:4933135/93‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGc < 1:2172049/93‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCAAGAcac < 1:7012636/93‑3 (MQ=255) ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt > 1:2245089/1‑93 (MQ=255) ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt > 1:2507925/1‑93 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt < 1:3499503/93‑1 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 2:750632/93‑1 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa > 2:5337737/1‑93 (MQ=255) gCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAt < 1:461692/93‑1 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATc < 2:1383872/93‑1 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATc > 2:544239/1‑93 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATc < 2:5715596/93‑1 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATc < 2:813350/93‑1 (MQ=255) cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATc < 1:472042/93‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAc > 1:3817527/1‑93 (MQ=255) tGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCgg > 2:5542598/1‑93 (MQ=255) gggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGCCATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGt < 2:1806544/93‑1 (MQ=255) gggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGt < 1:49831/93‑1 (MQ=255) gggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGt < 2:6737078/93‑1 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTgg < 1:1541215/93‑1 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTgg < 2:2261093/93‑1 (MQ=255) gTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGa < 1:7250874/93‑1 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGGTTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 2:3550649/1‑93 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt < 1:395780/93‑1 (MQ=255) gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGa < 1:1238220/93‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAt > 1:6562271/1‑93 (MQ=255) ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 1:3704127/93‑1 (MQ=255) ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 1:6822476/93‑1 (MQ=255) ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 2:1600751/93‑1 (MQ=255) ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATAGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 2:4886178/93‑1 (MQ=255) tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc > 1:1740887/1‑93 (MQ=255) tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc > 1:5915747/1‑93 (MQ=255) tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc < 1:4350403/93‑1 (MQ=255) aGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc < 1:4803515/93‑1 (MQ=255) gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg < 2:4669735/93‑1 (MQ=255) cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTa < 1:6300172/93‑1 (MQ=255) cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTa < 2:7113537/93‑1 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 1:1382276/1‑93 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg < 2:7401100/93‑1 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 2:5075693/1‑93 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg < 2:689754/93‑1 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 1:672799/93‑1 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 2:396465/93‑1 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg > 1:2806949/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg > 1:7546136/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg > 2:7296930/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg > 2:3150546/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg > 2:7150845/1‑93 (MQ=255) aCATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCgg > 1:4254751/1‑93 (MQ=255) ttCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa < 2:3861909/93‑1 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATTTCTCCGTAGGGGCGGGGag > 2:430766/1‑92 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt > 1:4151878/1‑93 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:3996138/93‑1 (MQ=255) cTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 2:2971377/93‑1 (MQ=255) ttAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATgg > 2:285627/1‑93 (MQ=255) tAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc < 2:3055283/93‑1 (MQ=255) tAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc > 1:7314572/1‑93 (MQ=255) tAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTAGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc < 2:6574449/93‑1 (MQ=255) gTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCAGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCg > 2:4111015/1‑93 (MQ=255) agCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGc < 1:5280122/92‑1 (MQ=255) gCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc < 2:6009683/93‑1 (MQ=255) gCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc > 2:1172921/1‑93 (MQ=255) | GTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450244‑4450423 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |