Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 629,933 | T→C | W273R (TGG→CGG) | cstA → | carbon starvation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 629,933 | 0 | T | C | 99.5% | 647.3 / ‑5.4 | 213 | W273R (TGG→CGG) | cstA | carbon starvation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (89/123); total (89/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.66e-01 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629843‑630022 | ccGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCgg > 1:1138866/1‑93 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc < 1:4126139/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc < 1:6528548/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTGACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc > 2:4982447/1‑93 (MQ=255) cTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAct > 1:684379/1‑93 (MQ=255) tGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActg < 1:4379485/93‑1 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc > 1:3255335/1‑93 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc < 2:714958/93‑1 (MQ=255) ggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgct < 1:6720578/93‑1 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGc < 2:5397915/93‑1 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAATGCTGGc > 2:7552039/1‑93 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGc > 1:1666764/1‑93 (MQ=255) ccGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGGTACTGCTGGcc > 1:2114181/1‑93 (MQ=255) cGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGccc < 2:7585162/93‑1 (MQ=255) aCTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgc > 1:5506494/1‑93 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTGCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGGTACTGGTGGCCGCGCGt > 1:3948354/1‑93 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgcgg > 2:5214500/1‑92 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgcgg > 1:1262439/1‑92 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGt > 1:4691429/1‑93 (MQ=255) ttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTTGCCCCGCGTg > 2:4317341/1‑93 (MQ=255) tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGa < 2:1720659/93‑1 (MQ=255) tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGa < 1:571590/93‑1 (MQ=255) tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGa > 1:6298505/1‑93 (MQ=255) gACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGAc < 2:4737206/93‑1 (MQ=255) aCTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACt > 2:4151277/1‑93 (MQ=255) aCTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGATTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGCGACt > 1:276625/1‑93 (MQ=255) cTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGGGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTa > 1:3785053/1‑93 (MQ=255) tttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTAc > 1:4201471/1‑93 (MQ=255) ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGTATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTAcc < 2:7750777/93‑1 (MQ=255) tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACct < 1:5149055/93‑1 (MQ=255) tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACct < 2:3743231/93‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctc < 1:2880369/93‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctct < 2:6566703/93‑1 (MQ=255) cGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctc > 1:7848021/1‑93 (MQ=255) cGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctc < 2:2771953/93‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctct > 2:590134/1‑93 (MQ=255) gCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGCGACTACCTCTCTa > 2:1337718/1‑93 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCt < 2:1903101/93‑1 (MQ=255) cAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTc > 1:7529250/1‑93 (MQ=255) aGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTcc < 2:4235169/93‑1 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCt < 2:6137606/93‑1 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCt > 2:729273/1‑93 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCt < 1:1783375/93‑1 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTg > 2:2981817/1‑93 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaa > 2:5259707/1‑93 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaa > 2:5864281/1‑93 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc > 2:1209705/1‑93 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc < 2:684379/93‑1 (MQ=255) ggATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCg > 2:3616869/1‑93 (MQ=255) gATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg > 1:2466627/1‑93 (MQ=255) gATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg < 2:3355808/93‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCggg < 2:233124/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa > 1:5557047/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa < 2:6038111/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa > 1:5050812/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa < 1:7138981/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa > 1:2447576/1‑93 (MQ=255) tggtggGTTCCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTa < 2:7035691/93‑1 (MQ=255) tggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTa > 2:4672579/1‑93 (MQ=255) ggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAt > 1:999770/1‑93 (MQ=255) ggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtc < 1:3408068/93‑1 (MQ=255) gTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtcg < 1:6162679/93‑1 (MQ=255) tACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCggc > 1:2536544/1‑92 (MQ=255) tACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGt < 1:1186886/93‑1 (MQ=255) aCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTc < 1:7609884/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 2:5551175/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 1:7380432/93‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTg > 2:6773465/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTg > 1:7763340/1‑93 (MQ=255) gTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTgg > 1:2572071/1‑93 (MQ=255) gTTTTGTGGCGGCGGTGATGCCCGTGCGGCTACTGATGGTCCCGCGTGACTACCTCTCCACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTAGGTTTgg > 2:5608295/1‑93 (MQ=255) ttttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGc > 1:2031655/1‑93 (MQ=255) tttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCg < 1:3571744/93‑1 (MQ=255) tttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCg > 2:1850325/1‑93 (MQ=255) ttggtgGGGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGTGTGACTCCCTCTCTTCCTTCCTGAAAGTCGGGACTATCGTCGGTCTGGCg < 1:5658650/90‑1 (MQ=255) tgtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCggg > 1:1537793/1‑92 (MQ=255) tgtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGt > 2:7695349/1‑93 (MQ=255) tgGCGGCTGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAg < 1:7801547/93‑1 (MQ=255) tgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAg < 2:2881565/93‑1 (MQ=255) tgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAg > 2:1193308/1‑93 (MQ=255) tgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAg < 2:1627927/93‑1 (MQ=255) ggcggcGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCGGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAgg < 1:4725187/93‑1 (MQ=255) gcggcgGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGc < 2:496203/93‑1 (MQ=255) gcggcgGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGc < 2:399892/93‑1 (MQ=255) cggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCa < 2:4427448/93‑1 (MQ=255) cggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCa < 2:6178158/93‑1 (MQ=255) cggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCa > 1:3835224/1‑93 (MQ=255) ggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAt > 2:5679291/1‑93 (MQ=255) ggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAt < 2:3787059/93‑1 (MQ=255) cggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAttt > 1:6181318/1‑93 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTg > 1:2830866/1‑93 (MQ=255) gctgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAt < 1:5463128/93‑1 (MQ=255) ctgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAtt < 1:6541287/93‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTa < 1:1271713/93‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTa > 2:2204128/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt < 2:7094417/93‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATg < 1:6367814/93‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTCCTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcg < 1:6016371/93‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcg > 1:501923/1‑93 (MQ=255) gtgcGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc > 1:7680328/1‑93 (MQ=255) | CCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629843‑630022 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |