Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 752,007 | T→C | G4G (GGA→GGG) | ybgD ← | putative fimbrial‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 752,007 | 0 | T | C | 99.2% | 819.7 / ‑5.1 | 262 | G4G (GGA→GGG) | ybgD | putative fimbrial‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (63/197); total (65/197) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.08e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
CTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTT > NC_000913/751917‑752096 | ctgaaaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGccc < 1:3106615/90‑1 (MQ=255) cTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGGGCGGCCAATGTTTTTTGccc > 1:6816945/1‑93 (MQ=255) ttAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCt > 2:7323725/1‑93 (MQ=255) ttAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCt < 2:7071459/93‑1 (MQ=255) tAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCtt < 1:6284597/93‑1 (MQ=255) aaaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCttt < 2:2023357/93‑1 (MQ=255) aaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTa < 1:1355976/93‑1 (MQ=255) aaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTa < 1:7149920/93‑1 (MQ=255) aaGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTa < 2:4564872/93‑1 (MQ=255) aGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTaa > 1:5011539/1‑93 (MQ=255) gTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTaaa < 2:2178284/93‑1 (MQ=255) gAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACa < 1:706560/93‑1 (MQ=255) gAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACa < 1:4115175/93‑1 (MQ=255) aaTTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACAt < 2:4654425/93‑1 (MQ=255) tttCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATaa < 2:7742285/93‑1 (MQ=255) tCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACa < 1:2611380/93‑1 (MQ=255) ccAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACagag < 1:3109941/93‑1 (MQ=255) aGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTc > 1:2398770/1‑93 (MQ=255) aaCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCt > 1:7237082/1‑93 (MQ=255) aaCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCt < 2:4465783/93‑1 (MQ=255) aCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCtt < 1:287719/93‑1 (MQ=255) aCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCtt < 1:4402731/93‑1 (MQ=255) aCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCtt > 2:7608776/1‑93 (MQ=255) aCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCtt < 1:815063/93‑1 (MQ=255) aCCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCtt < 1:61892/93‑1 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTa < 2:2731027/93‑1 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTa < 1:5191360/93‑1 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTa > 1:5429589/1‑93 (MQ=255) ttCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTaa > 2:3840627/1‑93 (MQ=255) ttCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTaa < 2:2869304/93‑1 (MQ=255) ttCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTaa > 2:6764053/1‑93 (MQ=255) tcatcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAg > 2:662876/1‑93 (MQ=255) atcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGa < 2:3098870/93‑1 (MQ=255) tcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGat < 1:169476/93‑1 (MQ=255) tcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGat > 1:3093813/1‑93 (MQ=255) tcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGat > 1:7551127/1‑93 (MQ=255) tcaGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGat > 2:1374371/1‑93 (MQ=255) cagcagCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGata < 2:1775994/93‑1 (MQ=255) ggaacaTAAACAGGTGTAGTGAACAGCAGAGATGCAGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGAtata < 1:5857791/89‑1 (MQ=255) gcagcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGAtata < 1:1985409/93‑1 (MQ=255) gcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGaa > 1:1206004/1‑93 (MQ=255) aaaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgg < 1:419628/93‑1 (MQ=255) aaaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgg < 1:6074982/93‑1 (MQ=255) aaaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgg < 2:1051191/93‑1 (MQ=255) aaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAgcg > 1:5674286/1‑91 (MQ=255) cAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGt < 2:5029859/93‑1 (MQ=255) aGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGta < 2:1890824/93‑1 (MQ=255) aGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGta < 2:5509649/93‑1 (MQ=255) aGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGta > 1:920962/1‑93 (MQ=255) ggTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtat < 1:2243789/93‑1 (MQ=255) gTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGtata < 2:7409851/93‑1 (MQ=255) tGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAg > 2:7458470/1‑93 (MQ=255) gCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGc > 1:4927935/1‑93 (MQ=255) cagcagAGATACGGCGAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAg < 2:5375225/93‑1 (MQ=255) cagcagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAg < 1:6521535/93‑1 (MQ=255) cagcagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAg > 2:3487244/1‑93 (MQ=255) cagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAat < 2:2478106/93‑1 (MQ=255) agagATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAata < 2:5956848/93‑1 (MQ=255) agagATACGGCAAGTGCGGCTAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAata < 2:4684957/93‑1 (MQ=255) agaTACGGACAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATc < 1:503560/93‑1 (MQ=255) tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTa < 1:1046425/93‑1 (MQ=255) tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTa < 1:6673295/93‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAt < 1:2926848/93‑1 (MQ=255) aCGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAt < 1:407755/93‑1 (MQ=255) cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAtt < 1:7334114/93‑1 (MQ=255) cGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAtt < 1:6306547/93‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCTGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGATTAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAttt < 2:4110870/93‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAttt < 1:7435153/93‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTAttt < 2:3706258/93‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAGCATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGa < 1:3835390/93‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGa < 1:7775664/93‑1 (MQ=255) agagCGGCCTATGTTTTATGCCCTTTAAACATAGCAGAGACCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatt < 2:7043180/90‑1 (MQ=255) aGTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatt < 1:4889315/93‑1 (MQ=255) gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 2:3210923/93‑1 (MQ=255) gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 1:1412918/93‑1 (MQ=255) gTGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 1:4289413/93‑1 (MQ=255) gTGCGGACAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGatta < 1:6410263/93‑1 (MQ=255) tGCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGattat < 1:1562189/93‑1 (MQ=255) gCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGattatt < 2:7130392/93‑1 (MQ=255) gCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGattatt < 1:1831172/93‑1 (MQ=255) gCGGCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGattatt < 2:5797379/93‑1 (MQ=255) ggCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGc < 1:3582449/93‑1 (MQ=255) ggCCAATGTTTTTTGCCCTTCAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGc > 1:3283252/1‑93 (MQ=255) gCCAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCt < 2:1430546/93‑1 (MQ=255) ccAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCta < 2:4887538/93‑1 (MQ=255) ccAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCta > 2:2408335/1‑93 (MQ=255) ccAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCta < 2:4776814/93‑1 (MQ=255) ccAATGGTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAATGATATAGAATAGGGGGATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCta > 2:2908829/1‑93 (MQ=255) cAATGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtag > 1:3395950/1‑93 (MQ=255) aaTGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTCTTTGATTATTGCtagt < 2:5217458/93‑1 (MQ=255) tGTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttt > 2:6245123/1‑93 (MQ=255) gTTTTTTGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttt < 1:52643/93‑1 (MQ=255) ttttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttttt < 1:934462/93‑1 (MQ=255) tttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttttta < 2:6793739/93‑1 (MQ=255) tttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttttta < 2:123463/93‑1 (MQ=255) ttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttag > 2:4183946/1‑93 (MQ=255) ttttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttag < 1:6562817/93‑1 (MQ=255) tttGCCCCTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttagt < 1:4091729/93‑1 (MQ=255) ttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttagtt < 2:378051/93‑1 (MQ=255) ttGCCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttagtt < 2:3580943/93‑1 (MQ=255) | CTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTT > NC_000913/751917‑752096 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |