| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 940,394 | C→T | C71C (TGC→TGT) | dmsA → | anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 940,394 | 0 | C | T | 99.2% | 918.9 / ‑4.4 | 258 | C71C (TGC→TGT) | dmsA | anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (120/136); total (121/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 | |||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
GATTGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGCCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCAGGT > NC_000913/940304‑940483 | gATTGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAATTGTGGTAGTCGCTGtcc > 1:2893462/1‑93 (MQ=255)gATTGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGtcc > 2:3792155/1‑93 (MQ=255) aTTGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCg > 2:4676947/1‑93 (MQ=255) ttGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGCGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGc > 1:1144698/1‑93 (MQ=255) ttGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGc > 2:2334058/1‑93 (MQ=255) gcgcACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTa < 2:1353016/93‑1 (MQ=255) cgcACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTAc < 1:7089718/93‑1 (MQ=255) gcACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACg > 1:7765765/1‑93 (MQ=255) gcACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACg > 2:3004696/1‑93 (MQ=255) aCGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTa > 1:4913264/1‑93 (MQ=255) aCGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTa < 1:6076896/93‑1 (MQ=255) gCTGTCGATAGCGCCATTCGAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAATTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATg < 1:1837125/93‑1 (MQ=255) cTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGc < 2:165600/93‑1 (MQ=255) cTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGc > 2:4127139/1‑93 (MQ=255) tGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACCGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCa > 1:5245973/1‑93 (MQ=255) gTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCAc < 1:2019075/93‑1 (MQ=255) gTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCAc > 1:2417320/1‑93 (MQ=255) aTAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCAcgtcg > 2:2699294/1‑93 (MQ=255) aTAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCAcgtcg < 2:6013350/93‑1 (MQ=255) cgcCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGa < 1:4905574/93‑1 (MQ=255) gcCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGAc < 2:3060926/93‑1 (MQ=255) ccATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACg > 2:5152488/1‑93 (MQ=255) cATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACgg > 2:6223992/1‑93 (MQ=255) cATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCGCTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACgg > 1:6646533/1‑93 (MQ=255) ttCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTg > 1:4600556/1‑93 (MQ=255) ttCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTg > 1:5176388/1‑93 (MQ=255) ttCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTg > 2:808557/1‑93 (MQ=255) ttCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTg > 2:4990990/1‑93 (MQ=255) ttCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTg > 2:548981/1‑93 (MQ=255) tCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTATAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGa < 2:3099503/93‑1 (MQ=255) tCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGa < 2:3954565/93‑1 (MQ=255) tCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGa < 2:7809418/93‑1 (MQ=255) tCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGa < 1:7053584/93‑1 (MQ=255) ccAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGaa > 1:5010091/1‑93 (MQ=255) caacaaAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCTCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGaaa < 2:6048758/93‑1 (MQ=255) caacaaAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGaaa < 2:3077883/93‑1 (MQ=255) caacaaAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGaaa < 1:2926167/93‑1 (MQ=255) aacaaAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAATTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAAt < 1:7848559/93‑1 (MQ=255) caaAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCa > 1:5477912/1‑93 (MQ=255) aaaaTCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCaa > 1:7168039/1‑93 (MQ=255) aaaTCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCaaa > 1:4674519/1‑93 (MQ=255) aaTCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAat < 2:5561095/93‑1 (MQ=255) aTCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAata < 1:2996557/93‑1 (MQ=255) aTCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAata < 2:7456111/93‑1 (MQ=255) aTCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAata < 1:3104300/93‑1 (MQ=255) tCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAatat > 2:1291051/1‑93 (MQ=255) tCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAatat > 2:1150846/1‑93 (MQ=255) gAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAATTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTTCGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGaa < 2:5471354/93‑1 (MQ=255) aaaaGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGaaa > 2:7078426/1‑93 (MQ=255) aaaaGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGaaa > 2:3250030/1‑93 (MQ=255) aaaaGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGaaa > 1:1587046/1‑93 (MQ=255) aaaaGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGGCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGaag > 2:1076039/1‑92 (MQ=255) aaaGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAAc > 1:4962706/1‑93 (MQ=255) aGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACgg > 1:3308972/1‑93 (MQ=255) ggTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGa < 1:582264/93‑1 (MQ=255) ttATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACa > 2:2540025/1‑93 (MQ=255) tATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACaa > 2:4850196/1‑93 (MQ=255) tATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACaa < 1:6319869/93‑1 (MQ=255) tATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACaa < 1:2534064/93‑1 (MQ=255) aTCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAAt < 2:1762859/93‑1 (MQ=255) aTCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAAt > 2:334476/1‑93 (MQ=255) tCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATa < 1:1003512/93‑1 (MQ=255) cTGGAGCGCCTGTACAGTTAATTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATAc < 2:5893630/93‑1 (MQ=255) cTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATAc < 1:4383998/93‑1 (MQ=255) tGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATAcc > 2:6857051/1‑93 (MQ=255) tGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATAcc > 2:608826/1‑93 (MQ=255) tGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATAcc > 2:3548227/1‑93 (MQ=255) ggAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCg < 1:7231687/93‑1 (MQ=255) ggAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCg < 2:7555896/93‑1 (MQ=255) ggAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCg < 1:826635/93‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTCAGTTAACTGTGGTAGTAGCTGTACGCTACGTATGCACGTCGTGGGCGGTGAAATCAAATATGTGGAAACGGAGAATACCGTCg > 2:650862/1‑93 (MQ=255) cgcATGTACAGTTAACTGGGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATTCCGGCGa < 2:2633172/93‑1 (MQ=255) cTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGa > 1:1783273/1‑93 (MQ=255) tGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGaa > 1:1357846/1‑92 (MQ=255) tGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGAc > 2:5034774/1‑93 (MQ=255) tGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGAc > 2:922381/1‑93 (MQ=255) gTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTCTGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATCTGTCGACACGGCCAATACCGGCGATGACa > 1:557174/1‑93 (MQ=255) gTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACa > 2:1498170/1‑93 (MQ=255) 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gTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTac < 1:5585931/93‑1 (MQ=255) gTTAACTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTac < 1:3571014/93‑1 (MQ=255) tagatgtgGTAGTCTCTGTCTGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTacga < 2:5254203/89‑1 (MQ=255) aaCTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTacgag > 2:4794941/1‑92 (MQ=255) aCTGTGGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTacgacg < 2:7748215/93‑1 (MQ=255) tgtgGTAGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGc > 2:2873022/1‑93 (MQ=255) aGTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCAc < 1:4101213/93‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCAcc > 1:2612161/1‑93 (MQ=255) tCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCa > 1:6582517/1‑93 (MQ=255) tCGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCa < 2:5212888/93‑1 (MQ=255) gcGCTGTCCCCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCa < 1:6197661/92‑1 (MQ=255) cGCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCAg < 1:2772365/93‑1 (MQ=255) gCTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCAgg < 1:3965712/93‑1 (MQ=255) cTGTCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCAGGt > 2:3107238/1‑93 (MQ=255) | GATTGCGCACGCTGTCGATAGCGCCATTCCAACAAAATCAGACGAAAAGGTTATCTGGAGCGCCTGTACAGTTAACTGTGGTAGTCGCTGCCCGCTACGTATGCACGTCGTGGACGGTGAAATCAAATATGTCGAAACGGACAATACCGGCGATGACAATTACGACGGCCTGCACCAGGT > NC_000913/940304‑940483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |