| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,146,011 | C→T | intergenic (‑154/‑6) | yceF ← / → yceD | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,146,011 | 0 | C | T | 99.1% | 803.3 / ‑5.3 | 226 | intergenic (‑154/‑6) | yceF/yceD | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (133/91); total (134/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
AGTAACCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGCGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTATCTATACCCCT > NC_000913/1145921‑1146100 | cgcaaCCCGCGATGTGTGCGAATTATTGGCAACCAGCACCCACAGGCTGCCTATTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATgcgtgc < 2:7039952/90‑1 (MQ=255)agcaaCCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATgcgtgc > 2:6070958/4‑93 (MQ=255) gcaaCCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGcc < 2:5090781/91‑1 (MQ=255) gcaaCCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGcc > 2:3352466/3‑93 (MQ=255) gcaaCCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGcc > 1:7515756/3‑93 (MQ=255) aaCCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCt < 1:3392802/93‑1 (MQ=255) aCCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTa > 2:991474/1‑93 (MQ=255) cccGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTAt > 1:5690874/1‑93 (MQ=255) cccGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTAt > 1:4228249/1‑93 (MQ=255) cGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGc > 1:7410989/1‑93 (MQ=255) gCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCa > 2:2850793/1‑93 (MQ=255) gCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCa > 1:3085462/1‑93 (MQ=255) cAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCaa > 1:7802118/1‑93 (MQ=255) aaTGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCaaa > 1:3397952/1‑93 (MQ=255) aTGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCaaaa < 1:1177888/93‑1 (MQ=255) aTGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCaaaa < 1:7916242/93‑1 (MQ=255) aTGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCaaaa > 2:6358765/1‑93 (MQ=255) tgtgtgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAg < 1:4623069/93‑1 (MQ=255) tgtgtgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAg < 2:5235388/93‑1 (MQ=255) tgtgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGt < 1:416138/93‑1 (MQ=255) gtgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTa > 1:2550268/1‑93 (MQ=255) tgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTaa < 2:7122066/93‑1 (MQ=255) tgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTaa < 2:1404007/93‑1 (MQ=255) tgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTaa > 2:2456183/1‑93 (MQ=255) tgCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTaa > 2:4650938/1‑93 (MQ=255) gCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTaaa < 2:4480779/93‑1 (MQ=255) cGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTaaaa < 1:2135358/93‑1 (MQ=255) gAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAAt > 1:4260364/1‑93 (MQ=255) aaTTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAAtt < 1:967772/93‑1 (MQ=255) tattGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTAcc > 1:6831891/1‑93 (MQ=255) tattGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTAcc > 1:5329927/1‑93 (MQ=255) ttGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTAcccc > 2:3849590/1‑93 (MQ=255) gCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGa < 1:5551767/93‑1 (MQ=255) aaaaGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGAct > 1:6497664/1‑93 (MQ=255) aaaaGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGAct > 2:3688369/1‑93 (MQ=255) aaaGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGActc > 2:7104935/1‑93 (MQ=255) aaaGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGActc > 1:2742612/1‑93 (MQ=255) aaaGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGActc > 2:2717140/1‑93 (MQ=255) aaaGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGActc < 2:4972952/93‑1 (MQ=255) ggCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCg > 1:2293819/1‑93 (MQ=255) ggCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCg > 2:7806482/1‑93 (MQ=255) gCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGa < 1:4443873/93‑1 (MQ=255) cAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGAt < 1:3328419/93‑1 (MQ=255) aaCCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATc < 2:5567060/93‑1 (MQ=255) aaCCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATc > 1:2667795/1‑93 (MQ=255) aCCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATcc < 1:1459422/93‑1 (MQ=255) aCCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCCGACTCTCGATcc < 1:7656913/93‑1 (MQ=255) ccACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCg > 2:169200/1‑93 (MQ=255) cacaGCCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCgg < 2:4331449/93‑1 (MQ=255) acaGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGt < 2:5393869/93‑1 (MQ=255) acaGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGt > 1:579117/1‑93 (MQ=255) acaGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGt > 2:7074744/1‑93 (MQ=255) aGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTc < 2:5028083/93‑1 (MQ=255) aGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTc < 2:491141/93‑1 (MQ=255) aGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTc < 1:3202530/93‑1 (MQ=255) ggatGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCg > 2:6853226/4‑93 (MQ=255) ggCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCg > 2:5505154/1‑93 (MQ=255) gCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGt > 1:7102231/1‑93 (MQ=255) cTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTa > 1:7071153/1‑93 (MQ=255) cTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTa > 2:2684593/1‑93 (MQ=255) cTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTa < 2:3162306/93‑1 (MQ=255) cTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTa < 2:7532828/93‑1 (MQ=255) tGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTAc > 2:5827011/1‑93 (MQ=255) tGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTAc > 2:5267255/1‑93 (MQ=255) tGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTAc < 1:6049660/93‑1 (MQ=255) tGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTAc > 2:4866360/1‑93 (MQ=255) gCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACg > 1:745456/1‑93 (MQ=255) ccTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACgg > 1:2067594/1‑93 (MQ=255) ccTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACgg > 1:4013194/1‑93 (MQ=255) cTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGc < 1:1377931/93‑1 (MQ=255) cTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGc < 1:1300965/93‑1 (MQ=255) cTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGc > 1:3491148/1‑93 (MQ=255) cTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGc > 1:1098974/1‑93 (MQ=255) tttttCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACggat > 2:1375282/1‑91 (MQ=255) tttttCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCt > 2:1500791/1‑93 (MQ=255) tttttCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCt > 1:3254750/1‑93 (MQ=255) ttttCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTc < 1:5153617/93‑1 (MQ=255) tttCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCa < 2:3000061/93‑1 (MQ=255) ttGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAAc > 1:4518628/1‑93 (MQ=255) gACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGc < 2:4487528/93‑1 (MQ=255) aCTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGcc > 1:1849147/1‑93 (MQ=255) aCTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGcc < 1:5406366/93‑1 (MQ=255) aCTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGcc < 2:4466021/93‑1 (MQ=255) ctctATGACGTTACAAAGTTAATGTGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTCCCCCTGCCTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCt < 1:1489180/93‑1 (MQ=255) tctATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCtt > 2:4770570/1‑93 (MQ=255) tctATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCtt > 2:3750913/1‑93 (MQ=255) tATGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGa < 1:4366753/93‑1 (MQ=255) aTGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTCCCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGAt < 2:5812336/93‑1 (MQ=255) aTGACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGAt > 2:3132443/1‑93 (MQ=255) gACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTa < 1:5859651/93‑1 (MQ=255) gACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTa < 1:3894338/93‑1 (MQ=255) gACGTTACAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTa > 2:459759/1‑93 (MQ=255) cAAAGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGt > 2:5905274/1‑93 (MQ=255) aaaGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTa < 1:3936077/93‑1 (MQ=255) aaaGTTAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTa > 2:1999319/1‑93 (MQ=255) tAATATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTATCtat > 1:6974089/1‑93 (MQ=255) aaTATGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTATCtata > 2:859603/1‑93 (MQ=255) atatGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTATCTATAc > 1:3656012/1‑93 (MQ=255) atatGCGCGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCACTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGTTCAAAAACGACTTGATTACCAGGGTATCTATAc > 1:6711820/1‑93 (MQ=255) tatGCGTGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTATCTATAcc > 1:7109761/1‑93 (MQ=255) | AGTAACCCGCAATGTGTGCGAATTATTGGCAAAAGGCAACCACAGGCTGCCTTTTTCTTTGACTCTATGACGTTACAAAGTTAATATGCGCGCCCTATGCAAAAGGTAAAATTACCCCTGACTCTCGATCCGGTTCGTACGGCTCAAAAACGCCTTGATTACCAGGGTATCTATACCCCT > NC_000913/1145921‑1146100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |