Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,301,617 | T→C | V232A (GTG→GCG) | oppB → | oligopeptide transport permease protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,301,617 | 0 | T | C | 99.5% | 631.1 / ‑4.9 | 208 | V232A (GTG→GCG) | oppB | oligopeptide transport permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (108/99); total (108/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
ACTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAC > NC_000913/1301527‑1301706 | acTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCgcgc > 2:2228793/1‑93 (MQ=255) cTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGct > 2:5095536/1‑93 (MQ=255) ccAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctct > 1:6104297/1‑93 (MQ=255) ccAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctct > 1:4715333/1‑93 (MQ=255) cttttATCCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCtt < 1:5381400/92‑1 (MQ=255) aTTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCtt < 2:36816/93‑1 (MQ=255) aTTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCtt > 1:3264951/1‑93 (MQ=255) ttttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTta > 2:5543477/1‑93 (MQ=255) ttttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTta < 1:882124/93‑1 (MQ=255) ttttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTta < 1:1713136/93‑1 (MQ=255) ttttATGCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTta < 1:3001669/93‑1 (MQ=255) ttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTtata < 2:1152013/93‑1 (MQ=255) tATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTatat < 1:139101/93‑1 (MQ=255) tATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTatat > 2:3602611/1‑93 (MQ=255) tATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTatat < 1:3578241/93‑1 (MQ=255) aTTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATg < 1:2385623/93‑1 (MQ=255) aTTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATg < 2:5794394/93‑1 (MQ=255) aTTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATg < 1:2509510/93‑1 (MQ=255) ttCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATgg > 1:3217831/1‑93 (MQ=255) ttCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATgg > 1:6951392/1‑93 (MQ=255) cGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGc < 1:3414808/93‑1 (MQ=255) cGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGc < 2:7104357/93‑1 (MQ=255) gTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATggggc > 1:6285370/1‑91 (MQ=255) gTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGcc > 2:3440008/1‑93 (MQ=255) gTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGcc > 2:1888361/1‑93 (MQ=255) gTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGcc > 1:1555693/1‑93 (MQ=255) tACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGccc > 1:2506600/1‑93 (MQ=255) tACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGccc > 1:4397497/1‑93 (MQ=255) tACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTCTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGccc < 2:271269/93‑1 (MQ=255) aCTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGcccc < 2:6641362/93‑1 (MQ=255) aCTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGcccc < 2:320622/93‑1 (MQ=255) atGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCCGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCg < 1:6704695/92‑1 (MQ=255) gccGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCAt < 1:5492227/92‑1 (MQ=255) cccGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCAt > 1:7843743/1‑93 (MQ=255) cGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCAttt < 1:4023238/93‑1 (MQ=255) ggCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGt < 1:7111478/93‑1 (MQ=255) aaaGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGc > 2:1345213/1‑93 (MQ=255) aaaGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGc > 1:2759544/1‑93 (MQ=255) aGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCat > 2:7215580/1‑93 (MQ=255) aGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCat < 1:2056944/93‑1 (MQ=255) gggTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCatt > 2:900108/1‑93 (MQ=255) gggTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCatt < 2:6158/93‑1 (MQ=255) ttACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCattatt > 2:2023655/1‑93 (MQ=255) tACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCAttatta > 1:6979569/1‑93 (MQ=255) tACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCAttatta > 1:5142233/1‑93 (MQ=255) tACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCAttatta < 1:6591685/93‑1 (MQ=255) tACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCAttatta < 1:566452/93‑1 (MQ=255) ccTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTAcc > 2:4009712/1‑93 (MQ=255) cTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCg > 2:4883969/1‑93 (MQ=255) tATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCgg > 1:7686963/1‑93 (MQ=255) tATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCgg > 1:7346109/1‑93 (MQ=255) aTGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGt < 2:4213747/93‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGt < 2:3849221/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGtt > 2:2095586/1‑93 (MQ=255) tGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGtt > 2:7107381/1‑93 (MQ=255) gcggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTAt > 1:1781235/1‑93 (MQ=255) gATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGt > 2:5925006/1‑93 (MQ=255) aTCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGtt > 1:2279594/1‑93 (MQ=255) tCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGCTCTATGGTTa > 1:5124991/1‑93 (MQ=255) ttttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCg > 1:747451/1‑93 (MQ=255) tttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGa > 2:7005142/1‑93 (MQ=255) tCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCAt < 2:349793/93‑1 (MQ=255) aCGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCAttt > 1:7749324/1‑93 (MQ=255) aCGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCAttt < 1:1008959/93‑1 (MQ=255) gCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTAt < 1:1281877/93‑1 (MQ=255) gCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTAt < 1:7931523/93‑1 (MQ=255) gCATTAAAACCGGCTCTGTTACCTGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTAt < 2:5658215/93‑1 (MQ=255) cATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATg < 2:2361341/93‑1 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATgg > 2:3297389/1‑93 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCCATGGTTATCGAAACCATTTATgg > 1:5464121/1‑93 (MQ=255) ttAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGt > 1:7433839/1‑93 (MQ=255) ttAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGt > 1:6372354/1‑93 (MQ=255) tAAAACCTGCTCTGTGACCCGCGCTCTCTTATATGGTCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGtt < 1:5095743/93‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGttt < 2:6386118/93‑1 (MQ=255) aaCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTATTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGc > 1:5843487/1‑93 (MQ=255) aCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGcc < 1:4205350/93‑1 (MQ=255) ccTGCTCTGTTACCCCCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCCGTTCTATGGTTATTGAAACCATTTATGGTTTGCCg > 2:3051648/1‑93 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg < 2:5136520/93‑1 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg > 2:725411/1‑93 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg > 2:3137510/1‑93 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg > 1:7197038/1‑93 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg > 2:4053604/1‑93 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg > 1:258890/1‑93 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg < 2:672938/93‑1 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg > 1:4774097/1‑93 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg < 2:1730066/93‑1 (MQ=255) gCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg > 1:5240438/1‑93 (MQ=255) gCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg > 2:6217320/1‑93 (MQ=255) ctctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 1:1861050/93‑1 (MQ=255) ctctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 1:6819459/93‑1 (MQ=255) tctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAt > 2:446807/1‑93 (MQ=255) tctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAt < 2:71651/93‑1 (MQ=255) gTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTgg < 1:5989078/93‑1 (MQ=255) tACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTAACGGTTCTATGGTTATCGAACCCATTTATGGTTTGCCGTGCATTGGAc > 1:5887988/1‑93 (MQ=255) cccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACaa < 2:1526556/93‑1 (MQ=255) cccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACaa < 1:5090538/93‑1 (MQ=255) cccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACaa < 2:6583139/93‑1 (MQ=255) cccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACaa < 2:5270993/93‑1 (MQ=255) ccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAc > 2:4596077/1‑93 (MQ=255) ccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAc < 2:3014626/93‑1 (MQ=255) | ACTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAC > NC_000913/1301527‑1301706 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |