BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,479,655	T→C	C241C (TGT→TGC)	ynbD →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,479,655	0	T	C	99.5%	580.2 / NA	183	C241C (TGT→TGC)	ynbD	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (73/109); minor base A (0/1); total (73/110)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 186 total aligned reads displayed.

ACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479568‑1479744

aCTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGcc                                                                                      >  2:6313564/1‑93 (MQ=255)

 cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa                                                                                     <  1:3898845/93‑1 (MQ=255)

  tGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAg                                                                                    >  2:7368349/1‑93 (MQ=255)

  tGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAg                                                                                    <  1:2981535/93‑1 (MQ=255)

  cgCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCCTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAg                                                                                    <  2:2502488/92‑1 (MQ=255)

   gCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGt                                                                                   <  2:1746714/93‑1 (MQ=255)

     ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 >  1:4337904/1‑93 (MQ=255)

     ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 <  2:1441592/93‑1 (MQ=255)

     ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 >  1:5880830/1‑93 (MQ=255)

       tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  1:1342389/93‑1 (MQ=255)

       tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               >  2:6758454/1‑93 (MQ=255)

       tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  2:6558752/93‑1 (MQ=255)

       tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               >  1:7922463/1‑93 (MQ=255)

       tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  2:3886811/93‑1 (MQ=255)

        ttGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat                                                                              <  1:3108823/92‑1 (MQ=255)

         tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  1:225092/93‑1 (MQ=255)

         tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  1:2567291/93‑1 (MQ=255)

           tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           >  2:7267938/1‑93 (MQ=255)

           tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           <  1:4538440/93‑1 (MQ=255)

           tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           >  1:6463549/1‑93 (MQ=255)

              tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  2:6506524/1‑93 (MQ=255)

              tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  1:6667117/1‑93 (MQ=255)

                 gcgcGGGCTCGTGCATTTTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCa                                                                     <  1:2639711/93‑1 (MQ=255)

                  cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt                                                                    <  2:2049046/93‑1 (MQ=255)

                   gcgGGCTCGCGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa                                                                   <  1:4065036/93‑1 (MQ=255)

                    cgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATaa                                                                  <  1:521621/93‑1 (MQ=255)

                     gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt                                                                 >  2:5313418/1‑93 (MQ=255)

                      ggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGGTAATGATGGTGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGGCAGTATTATCGCTACTCATAAtt                                                                >  2:4239429/1‑93 (MQ=255)

                      ggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAtt                                                                <  1:7740175/93‑1 (MQ=255)

                       gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  1:4859537/93‑1 (MQ=255)

                       gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  1:2004129/93‑1 (MQ=255)

                        cTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg                                                              <  2:1865653/93‑1 (MQ=255)

                         tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             >  1:3751931/1‑93 (MQ=255)

                         tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             <  1:1928799/93‑1 (MQ=255)

                         tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             <  2:5652971/93‑1 (MQ=255)

                          cGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGcc                                                            <  2:7849944/93‑1 (MQ=255)

                           gTGCATTGTATTGATGTAGCTAATGATGATGATTCAGCTATTGTGGTCAGGCTGGTTATGATGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           <  1:4186503/93‑1 (MQ=255)

                           gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           >  1:4347227/1‑93 (MQ=255)

                           gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           >  2:5535151/1‑93 (MQ=255)

                           gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           >  1:6324251/1‑93 (MQ=255)

                            tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt                                                          <  2:1909074/93‑1 (MQ=255)

                            tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt                                                          <  1:46966/93‑1 (MQ=255)

                              cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        <  1:491840/93‑1 (MQ=255)

                              cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        >  2:7069774/1‑93 (MQ=255)

                               aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  2:1058263/1‑93 (MQ=255)

                               aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  1:7787250/1‑93 (MQ=255)

                               aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       <  2:1565402/93‑1 (MQ=255)

                                ttGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGt                                                      >  2:2429102/1‑93 (MQ=255)

                                ttGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGt                                                      >  2:4282843/1‑93 (MQ=255)

                                 tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTAAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     <  1:965923/93‑1 (MQ=255)

                                 tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTAGGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     <  1:3287505/93‑1 (MQ=255)

                                  gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    <  1:2814411/93‑1 (MQ=255)

                                   tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACg                                                   >  1:1106553/1‑93 (MQ=255)

                                     ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 >  1:3524339/1‑93 (MQ=255)

                                      tGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTg                                                <  1:6808364/93‑1 (MQ=255)

                                           gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           >  1:1566737/1‑93 (MQ=255)

                                           gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           <  2:2110373/93‑1 (MQ=255)

                                            aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg                                          <  1:6908435/93‑1 (MQ=255)

                                              cTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgc                                        >  2:5537523/1‑93 (MQ=255)

                                              cTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgc                                        >  2:374796/1‑93 (MQ=255)

                                               tAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcg                                       >  2:1332574/1‑93 (MQ=255)

                                                 atgatgatgATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGcgcg                                     >  2:2593879/1‑93 (MQ=255)

                                                  tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGa                                    >  1:5985565/1‑93 (MQ=255)

                                                  tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa                                    >  1:6222101/1‑93 (MQ=255)

                                                   gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt                                   >  2:6470312/1‑93 (MQ=255)

                                                     tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 >  1:5343599/1‑93 (MQ=255)

                                                     tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 <  1:6060256/93‑1 (MQ=255)

                                                        tgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa                              <  1:4446539/93‑1 (MQ=255)

                                                        tgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa                              <  2:2014679/93‑1 (MQ=255)

                                                         gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaac                             <  1:1785303/93‑1 (MQ=255)

                                                             cAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAggg                         <  1:3921337/93‑1 (MQ=255)

                                                              aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa                        >  1:2974736/1‑93 (MQ=255)

                                                              aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACCGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa                        <  2:1714248/93‑1 (MQ=255)

                                                                  ttggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa                    <  2:2705686/92‑1 (MQ=255)

                                                                   tggttgTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  1:3088488/93‑1 (MQ=255)

                                                                   tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  1:1169775/93‑1 (MQ=255)

                                                                    ggtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATa                  <  1:6875610/93‑1 (MQ=255)

                                                                     gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg                 <  1:1503711/93‑1 (MQ=255)

                                                                      tggtCAGTCTTGGTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                <  2:2483452/93‑1 (MQ=255)

                                                                       ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               >  1:3777987/1‑93 (MQ=255)

                                                                        gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              <  2:4152363/93‑1 (MQ=255)

                                                                        gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              <  1:7484208/93‑1 (MQ=255)

                                                                          cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  2:3413894/93‑1 (MQ=255)

                                                                          cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  2:6171459/93‑1 (MQ=255)

                                                                           aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg           <  1:185624/93‑1 (MQ=255)

                                                                            gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATCGTTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACACCAGGGAAAGATAGTCAgggg          <  1:7009024/93‑1 (MQ=255)

                                                                            gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          <  1:5023131/93‑1 (MQ=255)

                                                                             tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGGAAGCTAGTCAGGGGa         >  1:334881/1‑93 (MQ=255)

                                                                             tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         >  2:4903547/1‑93 (MQ=255)

                                                                             tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         <  2:4547520/93‑1 (MQ=255)

                                                                             tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         >  2:1223379/1‑93 (MQ=255)

                                                                              cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggggca        >  2:5858583/1‑91 (MQ=255)

                                                                              cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa        <  1:552889/93‑1 (MQ=255)

                                                                               tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  1:2095774/1‑93 (MQ=255)

                                                                                ggTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAAc      <  1:5124519/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     >  1:71009/1‑93 (MQ=255)

                                                                                   tATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAc   <  2:94014/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   tATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAc   <  1:4476983/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   tATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAc   <  1:4765290/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   tATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAc   <  2:2873424/93‑1 (MQ=255)

ACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479568‑1479744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 30 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`