Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 134,838 | A→G | W249R (TGG→CGG) | speD ← | S‑adenosylmethionine decarboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 134,838 | 0 | A | G | 99.4% | 1057.1 / ‑5.2 | 338 | W249R (TGG→CGG) | speD | S‑adenosylmethionine decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (187/149); total (187/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
TAAATAAATCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCACAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAACTCTTTAA > NC_000913/134748‑134927 | aaataaatCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcag > 2:7830512/1‑93 (MQ=255) aataaatCTGGCGGAGCTTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagc < 2:689998/93‑1 (MQ=255) aataaatCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagc < 1:945234/93‑1 (MQ=255) taaatCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagcgc > 2:4292199/1‑93 (MQ=255) aaatCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagcgca < 1:3711546/93‑1 (MQ=255) aaatCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagcgca > 1:1206248/1‑93 (MQ=255) atCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCgcagcgcagc < 2:641832/93‑1 (MQ=255) tCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagcgcagcg > 2:5909880/1‑93 (MQ=255) tCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagcgcagcg > 1:414089/1‑93 (MQ=255) tCTGGCGGAGCCTGGAAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGcagcgcagcg < 1:3551936/93‑1 (MQ=255) tGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGt < 2:7511253/93‑1 (MQ=255) cGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAAt < 1:2414693/93‑1 (MQ=255) cGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAAt > 1:2254799/1‑93 (MQ=255) cGGAGCCTGGGAGCGCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAAt < 1:109223/93‑1 (MQ=255) ggAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAAtt > 1:303395/1‑93 (MQ=255) ggAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAAtt < 1:3172665/93‑1 (MQ=255) ggAGCCTGGGAGCCCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAAtt < 2:7668084/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTc > 2:1264612/1‑93 (MQ=255) gCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTcc > 2:4210764/1‑93 (MQ=255) gCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTcc < 2:5714057/93‑1 (MQ=255) ccTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCt < 2:7301257/93‑1 (MQ=255) tGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTgg > 2:1923249/1‑93 (MQ=255) tGGGAGCTCCGCAAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTgg < 2:7826937/93‑1 (MQ=255) gggAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGgc > 2:1731587/1‑93 (MQ=255) ggAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGgcg < 1:5310952/93‑1 (MQ=255) ggAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGgcg > 2:5361985/1‑93 (MQ=255) ggAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGACCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGgcg > 1:1371251/1‑93 (MQ=255) gAGCGCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGgcgc < 1:3432176/93‑1 (MQ=255) tCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGcgctcgc > 1:2004246/1‑93 (MQ=255) cccGACAGAGCCGTTAAACAGCTGGTATAGTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGcgctagc < 2:3739292/92‑1 (MQ=255) ccGCCAGAGCCGTTAAACAGCTTGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGcgctcgct < 2:7923472/93‑1 (MQ=255) gCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGt > 1:720709/1‑93 (MQ=255) gCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGt < 2:4856668/93‑1 (MQ=255) agagCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCgg < 1:5652711/93‑1 (MQ=255) agagCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCgg > 1:6422518/1‑93 (MQ=255) gagCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGt > 2:4899745/1‑93 (MQ=255) gagCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGt < 2:2138722/93‑1 (MQ=255) agCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGtt < 2:7594860/93‑1 (MQ=255) agCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGtt > 1:6751876/1‑93 (MQ=255) gCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTa > 1:4992426/1‑93 (MQ=255) gCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTa > 2:2940466/1‑93 (MQ=255) ccGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTaa > 1:2511925/1‑93 (MQ=255) cGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAg > 2:3535493/1‑93 (MQ=255) gTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGt > 1:2580018/1‑93 (MQ=255) ttAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGGTGTCGGTTAAGTc > 1:6612048/1‑93 (MQ=255) ttAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGtt > 1:6292640/1‑92 (MQ=255) tAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCt < 2:7224918/93‑1 (MQ=255) aaCAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTc > 1:2742515/1‑93 (MQ=255) aaCAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTc > 1:7157603/1‑93 (MQ=255) aCAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTcc < 2:2991981/93‑1 (MQ=255) aCAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTcc < 2:506174/93‑1 (MQ=255) cAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCg > 1:7441693/1‑93 (MQ=255) gCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGt > 2:2431218/1‑93 (MQ=255) cTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGACGGTTAAGTCTTCCGGtt > 1:3899218/1‑93 (MQ=255) ggCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTg > 1:3819952/1‑93 (MQ=255) cATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGgt < 2:6261223/93‑1 (MQ=255) atatTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGgtg < 1:767398/93‑1 (MQ=255) atatTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGgtg < 1:7741459/93‑1 (MQ=255) atatTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGgtg > 1:7014986/1‑93 (MQ=255) tGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGa < 1:2387768/93‑1 (MQ=255) gcCCGTAATAAATCTCGCGCAGGTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACa > 1:1410718/1‑93 (MQ=255) ccGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATg < 1:4735514/93‑1 (MQ=255) ccGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATg < 1:6721406/93‑1 (MQ=255) cGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGt > 1:1661071/1‑93 (MQ=255) taataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAg < 2:1428701/93‑1 (MQ=255) taataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAg > 1:3759676/1‑93 (MQ=255) aataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCTCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGt < 2:4604065/93‑1 (MQ=255) aataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGt > 2:198720/1‑93 (MQ=255) aataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGt < 1:1332434/93‑1 (MQ=255) aataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGt < 1:5945044/93‑1 (MQ=255) aataaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTGCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGt < 1:465470/93‑1 (MQ=255) aataaATCCCGCGCATTTCTTTCCGCAGCCCAGCCGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGt < 2:5525551/93‑1 (MQ=255) taaATCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGc > 1:1038325/1‑93 (MQ=255) aaaTCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCt > 2:2728030/1‑93 (MQ=255) aaTCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCtt > 2:6795919/1‑93 (MQ=255) aTCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTa < 2:3310784/93‑1 (MQ=255) aTCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTa > 2:3618992/1‑93 (MQ=255) aTCTCGCGCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGCGGAACATGTAGTGCTTa < 2:3242067/93‑1 (MQ=255) 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cgcgCATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGt < 1:4430859/93‑1 (MQ=255) gcgcATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTc < 1:7585005/93‑1 (MQ=255) cgcATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCg < 2:5730/93‑1 (MQ=255) gcATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGa < 2:2638800/93‑1 (MQ=255) cATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGaa < 1:4202459/93‑1 (MQ=255) cATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGaa > 2:6612647/1‑93 (MQ=255) cATTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGaa > 2:7398217/1‑93 (MQ=255) aTTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAAc > 2:1091634/1‑93 (MQ=255) aTTTCTTTCCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAAc > 2:4007669/1‑93 (MQ=255) aTTTCTTTCCACAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAAc < 1:5196519/93‑1 (MQ=255) tttctttcCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAAct > 2:7447972/1‑93 (MQ=255) tttcCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAACTCttt < 1:3200372/93‑1 (MQ=255) tttcCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAACTCttt > 1:6860546/1‑93 (MQ=255) tttcCGCAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAACTCttt > 2:3984099/1‑93 (MQ=255) | TAAATAAATCTGGCGGAGCCTGGGAGCTCCGCCAGAGCCGTTAAACAGCTGGCATATTGCGCCCGTAATAAATCTCGCGCATTTCTTTCCACAGCGCAGCGGTAATTTCCTGGCGCTCGCTGTCGGTTAAGTCTTCCGGTTTGGTGTGGAACATGTAGTGCTTAAGGTCGAACTCTTTAA > NC_000913/134748‑134927 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |