| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 175,526 | C→T | G140G (GGC→GGT) | yadQ → | putative channel transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 175,526 | 0 | C | T | 98.9% | 922.3 / NA | 274 | G140G (GGC→GGT) | yadQ | putative channel transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (146/124); minor base G (3/0); total (149/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CGGAAATTGAAGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGCGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGG > NC_000913/175435‑175615 | cGGAAATTGAAGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGCATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTcggcg > 1:6189774/1‑93 (MQ=255) ggAAATTGAAGGGGAGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTcggtgg > 2:5385681/1‑93 (MQ=255) aTTGAAGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGc > 2:3577258/1‑93 (MQ=255) aTTGAAGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGGGGAGGc > 1:264391/1‑93 (MQ=255) gAAGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATg > 2:5949491/1‑93 (MQ=255) aGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGgt < 2:7756237/93‑1 (MQ=255) aGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGgt < 1:2886276/93‑1 (MQ=255) ggggCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGgtg > 1:7619698/1‑93 (MQ=255) gggCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGgtgt < 1:4228457/93‑1 (MQ=255) gggCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGgtgt < 2:3355960/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTg < 1:4022367/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTg < 2:490528/93‑1 (MQ=255) cgcTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTgg < 2:7234700/93‑1 (MQ=255) cgcTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTgg < 2:3795095/93‑1 (MQ=255) cgcTGGAAGAGCAACGTCCCGTGCGCTGGTGGCGTGTATTGCAGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACCCTCGGTGGAGGCATGGTGTTgg < 2:4683911/93‑1 (MQ=255) cTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGGGTTgggg > 2:4688695/1‑93 (MQ=255) gAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGgcgc > 1:2446175/1‑93 (MQ=255) gAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGgcgc > 2:7383884/1‑93 (MQ=255) gAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGgcgc < 2:2663156/93‑1 (MQ=255) aaGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGcgcg > 1:1229791/1‑93 (MQ=255) aGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGa < 2:480758/93‑1 (MQ=255) gATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGaa > 2:2818286/1‑93 (MQ=255) gATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGaa > 1:6716543/1‑93 (MQ=255) gATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGaa > 2:6889294/1‑93 (MQ=255) aaTCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGAATGGTGTTGGGGCGCGaa < 1:640945/92‑1 (MQ=255) aTCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAg > 1:3268956/1‑93 (MQ=255) tCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAgg < 2:900472/93‑1 (MQ=255) taaCGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAggg < 1:5708358/92‑1 (MQ=255) cAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAggg < 2:7569760/93‑1 (MQ=255) aCGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGcc > 1:7069621/1‑93 (MQ=255) aCGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGGGTTGGGGCGGGGAGGGca > 1:4374432/1‑92 (MQ=255) cGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCa > 1:5923331/1‑93 (MQ=255) tCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAAc < 1:7121033/93‑1 (MQ=255) tCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAAc < 1:2239976/93‑1 (MQ=255) cGTTCGCTGGTGGCGTGTATTTCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGt < 1:6535726/93‑1 (MQ=255) cGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCgg > 1:734328/1‑92 (MQ=255) gTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCggg > 2:5625522/1‑91 (MQ=255) gTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTg > 2:6755740/1‑93 (MQ=255) ttCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTAGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGc > 1:5225317/1‑93 (MQ=255) tCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGGGCGAAGGGCCAACCGTGCa > 2:2120918/1‑93 (MQ=255) tCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCa > 2:3141607/1‑93 (MQ=255) cTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGCGCCAACCGTGCAGAt < 1:7709266/93‑1 (MQ=255) tggtggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGAtg > 1:1701831/1‑92 (MQ=255) tggtggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATc < 2:6570199/93‑1 (MQ=255) tggtggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATc > 2:3104972/1‑93 (MQ=255) ggtggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCCGATcg > 2:2359355/1‑93 (MQ=255) gtggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATcgg > 1:4543380/1‑93 (MQ=255) tggCGTGTATTGCCGGTGAGGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCATCCGTGCAGATcggc < 2:2228951/93‑1 (MQ=255) tggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATcggg > 2:6192048/1‑92 (MQ=255) ggCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATcggcg > 1:1971356/1‑93 (MQ=255) gCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATcggcgg > 2:4325120/1‑93 (MQ=255) gtATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAAc > 1:787250/1‑93 (MQ=255) gtATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAAc > 1:4912841/1‑93 (MQ=255) tATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACa < 1:5875460/93‑1 (MQ=255) tATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACa < 1:3892501/93‑1 (MQ=255) cttGCTGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACAt < 1:3356602/92‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACAt > 1:940912/1‑93 (MQ=255) ttGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACAtt < 1:2080786/93‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTg < 1:3518416/93‑1 (MQ=255) cGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGcc > 2:2753002/1‑93 (MQ=255) ggTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCg > 2:1279360/1‑93 (MQ=255) ggTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCg > 1:3083894/1‑93 (MQ=255) gTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTTGGGCGCGAAGGGCGAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGt > 1:1134694/1‑93 (MQ=255) gTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGt > 1:192760/1‑93 (MQ=255) tGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTa > 1:867317/1‑93 (MQ=255) tGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTa > 1:1485743/1‑93 (MQ=255) gAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTAt < 1:1161646/93‑1 (MQ=255) gAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTAt > 1:2274523/1‑93 (MQ=255) aaGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATg < 2:6861725/93‑1 (MQ=255) gTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATggg > 1:374104/1‑92 (MQ=255) gTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGt > 2:2074299/1‑93 (MQ=255) ttCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTg < 1:6349095/93‑1 (MQ=255) tCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGc > 2:1020349/1‑93 (MQ=255) tCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGc > 1:6120785/1‑93 (MQ=255) tCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGc > 2:7641279/1‑93 (MQ=255) tttGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCtt > 2:4595452/1‑93 (MQ=255) tttGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCtt > 1:5332598/1‑93 (MQ=255) tttGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCtt < 1:2419121/93‑1 (MQ=255) tttGGCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCtt > 1:4426434/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGat < 1:2967709/93‑1 (MQ=255) ggCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGGGCTTGat > 1:5568486/1‑93 (MQ=255) gCGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGata > 1:68854/1‑93 (MQ=255) cGGGCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGatat < 2:6123948/93‑1 (MQ=255) gggCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATAtt < 2:454852/93‑1 (MQ=255) gggCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATAtt > 2:526465/1‑93 (MQ=255) gggCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATAtt < 2:5680220/93‑1 (MQ=255) gggCGGGGGACGCTCGGTGGAGTCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATAtt < 1:963109/93‑1 (MQ=255) ggCTGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATAttt > 2:4020420/1‑93 (MQ=255) tGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTcc < 2:7150786/93‑1 (MQ=255) tGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTcc > 2:2088535/1‑93 (MQ=255) tGGGGACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTcc < 2:5138261/93‑1 (MQ=255) ggACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGcc < 1:3404271/93‑1 (MQ=255) ggACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGcc < 2:7815857/93‑1 (MQ=255) gACACTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCt < 2:117046/93‑1 (MQ=255) cacTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGa > 1:2545120/1‑93 (MQ=255) cacTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGa > 2:3049830/1‑93 (MQ=255) acTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTTaa > 1:5063615/1‑93 (MQ=255) cTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGaaa > 2:7286901/1‑93 (MQ=255) cTCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGaaa < 2:1730098/93‑1 (MQ=255) tCGGTGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACAATGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAg > 1:4830243/1‑93 (MQ=255) | CGGAAATTGAAGGGGCGCTGGAAGATCAACGTCCCGTTCGCTGGTGGCGTGTATTGCCGGTGAAGTTCTTTGGCGGGCTGGGGACACTCGGCGGAGGCATGGTGTTGGGGCGCGAAGGGCCAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGG > NC_000913/175435‑175615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |