| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 17,618 | A→G | T44A (ACG→GCG) | nhaA → | pH dependent Na+/H antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 17,618 | 0 | A | G | 99.7% | 967.0 / NA | 312 | T44A (ACG→GCG) | nhaA | pH dependent Na+/H antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (149/162); minor base T (0/1); total (149/163) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GGAGGCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGACGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTATTTTTCCTG > NC_000913/17528‑17707 | gAGGCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGgcgc > 2:201799/1‑93 (MQ=255) aGGCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGcc > 1:6216373/1‑93 (MQ=255) aGGCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGcc > 1:4694413/1‑93 (MQ=255) ggCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCg > 1:2039984/1‑93 (MQ=255) ggCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCg < 2:1370897/93‑1 (MQ=255) cATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGt > 2:510793/1‑93 (MQ=255) attattCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGtt < 2:7802514/93‑1 (MQ=255) attattCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGtt < 1:3845460/93‑1 (MQ=255) ttattCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTc > 2:6360294/1‑93 (MQ=255) ttattCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTc > 2:5779248/1‑93 (MQ=255) ttattCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTc > 1:4247217/1‑93 (MQ=255) ttattCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTc < 2:2332440/93‑1 (MQ=255) ttCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGc > 2:4352458/1‑93 (MQ=255) cTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTc > 2:3411752/1‑93 (MQ=255) cTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTc < 1:5011543/93‑1 (MQ=255) cTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTc < 1:921085/93‑1 (MQ=255) ttATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTcc < 2:7497070/93‑1 (MQ=255) tATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCg < 2:7384055/93‑1 (MQ=255) aTCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCgg < 2:79975/93‑1 (MQ=255) cATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTAGGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggt < 1:1666458/93‑1 (MQ=255) aTTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggtt < 2:2172569/93‑1 (MQ=255) aTTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggtt > 2:3703939/1‑93 (MQ=255) ttGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttg < 2:1428308/93‑1 (MQ=255) ttGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttg > 1:984496/1‑93 (MQ=255) ttGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttg > 1:7923944/1‑93 (MQ=255) ttGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttg < 1:5226694/93‑1 (MQ=255) gCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttggt < 1:1156178/93‑1 (MQ=255) ccGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttggtt > 2:6820963/1‑93 (MQ=255) ccGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGggttggtt > 1:4962351/1‑93 (MQ=255) cGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTc > 2:2995223/1‑93 (MQ=255) cGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTc < 2:1900783/93‑1 (MQ=255) gCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCa > 1:4343818/1‑93 (MQ=255) gCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCa > 1:7063068/1‑93 (MQ=255) gCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCa > 2:3257395/1‑93 (MQ=255) cTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCAc > 2:7068022/1‑93 (MQ=255) tATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACt < 2:4621819/93‑1 (MQ=255) tATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACt < 1:2601298/93‑1 (MQ=255) tATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACt < 1:2292106/93‑1 (MQ=255) cgccTGGCGATGATGATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGTCGCCGGTTCAGCTCCGGGTGGGTTCACTc < 2:6309422/91‑1 (MQ=255) aTCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTc > 1:6141417/1‑93 (MQ=255) aTCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGGTCAGCTCCGGGTTGGTCCACTc > 2:6189423/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCg > 2:3447396/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCg > 1:6971273/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCg < 1:6850439/93‑1 (MQ=255) tGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGaaa < 2:4991443/93‑1 (MQ=255) ggCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAAt > 1:1348000/1‑93 (MQ=255) gCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAAta > 2:1749747/1‑92 (MQ=255) gCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATc > 2:5216028/1‑93 (MQ=255) gatgatTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATcaa > 1:287563/1‑93 (MQ=255) gatgatTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATcaa > 1:6599200/1‑93 (MQ=255) gatgatTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATcaa < 1:647360/93‑1 (MQ=255) atgatTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGCAATccac > 2:3158597/1‑93 (MQ=255) atgatTATGGCCAACAGCGGCACAACCAGTGGATGGTATCACTACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATcaac < 2:6553825/93‑1 (MQ=255) gatTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATcaacaa > 2:7648660/1‑93 (MQ=255) ttATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGGATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACaaaa > 2:1903593/1‑93 (MQ=255) tATGGCGAGCAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTGCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACaaaaa < 1:1952311/93‑1 (MQ=255) tGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACa > 1:4787217/1‑93 (MQ=255) ggCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACAt > 1:3387905/1‑93 (MQ=255) ccAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGc < 2:6596800/93‑1 (MQ=255) cAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCt < 1:3165546/93‑1 (MQ=255) cAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCt > 2:3968027/1‑93 (MQ=255) cAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCt < 1:7650299/93‑1 (MQ=255) aCAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACTACTTTCTGGAGGCGCTGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGt < 1:1511806/93‑1 (MQ=255) aCAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGt > 1:2564283/1‑93 (MQ=255) aGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTa < 2:7263427/93‑1 (MQ=255) gcggcgCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTAt < 2:5382586/93‑1 (MQ=255) ggcgCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATgg < 2:4817316/93‑1 (MQ=255) ggcgCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATgg < 1:5321840/93‑1 (MQ=255) gcgcAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGa > 1:7417238/1‑93 (MQ=255) gcgcAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGa < 2:5845514/93‑1 (MQ=255) gcgcAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGa < 2:2533620/93‑1 (MQ=255) cAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATaa < 1:7514948/93‑1 (MQ=255) aaCCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATaaa < 1:5613042/93‑1 (MQ=255) aaCCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATaaa < 2:276598/93‑1 (MQ=255) aaCCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATaaa < 1:3745675/93‑1 (MQ=255) ccAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGGCGGCTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATg > 2:1202245/1‑93 (MQ=255) ccAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATg < 1:6568407/93‑1 (MQ=255) ccAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATg > 2:5757642/1‑93 (MQ=255) cAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGa < 2:7151539/93‑1 (MQ=255) aGTGGATGGTATCACTACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGAc < 2:6428745/93‑1 (MQ=255) aGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGAc < 1:7136194/93‑1 (MQ=255) gTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGAcg > 1:7757124/1‑93 (MQ=255) tGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGAcgc > 1:5889124/1‑93 (MQ=255) tGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGAcgc < 2:3577307/93‑1 (MQ=255) ggATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGAcgcg > 2:2853473/1‑93 (MQ=255) gATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACgcgc < 1:6030723/93‑1 (MQ=255) gATGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACgcgc < 1:1048799/93‑1 (MQ=255) tGGTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTg > 2:226839/1‑93 (MQ=255) ggTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGa < 1:4040310/93‑1 (MQ=255) ggTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGa < 1:2372535/93‑1 (MQ=255) gTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGAt < 2:1049178/93‑1 (MQ=255) gTATCACGACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGAt > 2:7756339/1‑93 (MQ=255) gACTTTCTGGGGGCCCCGGTTCAACTCCGGGTTGGTTCACTGGAAATCAACAACAACATGCTGGAATGGCTAAATGATCCGCTGTTTGCGGTa > 2:4485820/1‑93 (MQ=255) gACTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTa > 2:5690863/1‑93 (MQ=255) aCTTTCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGGTGGTTCACTCGAAATCAACAACAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGGAt > 2:2956344/1‑93 (MQ=255) tttCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTAttt > 1:1917725/1‑93 (MQ=255) ttCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTAtttt > 2:110121/1‑93 (MQ=255) tCTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTAttttt > 2:1507962/1‑93 (MQ=255) cTGGAGGCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTATTTTTc < 2:4115165/93‑1 (MQ=255) gaggCGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTATTTTTCCTg < 1:449065/93‑1 (MQ=255) | GGAGGCATTATTCTTATCATTGCCGCTATCCTGGCGATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGACGCCGGTTCAGCTCCGGGTTGGTTCACTCGAAATCAACAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCGCTGATGGCGGTATTTTTCCTG > NC_000913/17528‑17707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |