Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,107,690 | C→T | W157* (TGG→TGA) | rfbC ← | dTDP‑6‑deoxy‑D‑glucose‑3,5 epimerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,107,690 | 0 | C | T | 99.6% | 890.8 / NA | 251 | W157* (TGG→TGA) | rfbC | dTDP‑6‑deoxy‑D‑glucose‑3,5 epimerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (104/146); total (105/146) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TATTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGCCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTCAGC > NC_000913/2107600‑2107779 | tATTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTca < 1:3039631/93‑1 (MQ=255) aTTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaa > 1:888494/1‑93 (MQ=255) ttCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaat < 2:6592536/93‑1 (MQ=255) tCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaatc < 1:395865/93‑1 (MQ=255) cATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaatca > 2:1386392/1‑93 (MQ=255) cATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaatca > 2:3429871/1‑93 (MQ=255) cATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaatca > 2:4323562/1‑93 (MQ=255) aTGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGtcaatcaa > 1:458451/1‑93 (MQ=255) tGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaatcaat < 2:2280863/93‑1 (MQ=255) gCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGTATTAACCCTGATGTTTGGGCTCAATCAAtt < 1:2677490/93‑1 (MQ=255) cAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTg > 2:7674450/1‑93 (MQ=255) cAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTg > 1:5144231/1‑93 (MQ=255) cAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTg < 1:278819/93‑1 (MQ=255) ttaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCaa < 2:7931166/93‑1 (MQ=255) ttaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCaa > 2:1583033/1‑93 (MQ=255) taattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAAt > 1:5667830/1‑93 (MQ=255) aattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATg < 1:6808366/93‑1 (MQ=255) aattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATg < 1:2065873/93‑1 (MQ=255) aattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATg > 1:1528359/1‑93 (MQ=255) attTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGc > 1:4133017/1‑93 (MQ=255) attTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGc < 2:2851096/93‑1 (MQ=255) tttAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGt < 2:365369/93‑1 (MQ=255) tAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtc < 1:4860598/93‑1 (MQ=255) aaTCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtca > 2:7146351/1‑93 (MQ=255) aaTCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTATGGCGAAAGGAATAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtca < 1:7020210/93‑1 (MQ=255) aTCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcat < 2:4949134/93‑1 (MQ=255) tCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcatc > 1:1393653/1‑93 (MQ=255) cTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcatca < 1:7173888/93‑1 (MQ=255) cTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcatca < 1:669761/93‑1 (MQ=255) cTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcatca < 1:6449018/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat > 2:46873/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat > 2:7075489/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat < 1:5628225/93‑1 (MQ=255) gATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTCTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCAtt < 1:1174662/93‑1 (MQ=255) aTAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTc < 1:5823824/93‑1 (MQ=255) aTAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTc < 2:243740/93‑1 (MQ=255) tAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTcc > 1:2502727/1‑93 (MQ=255) aGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCaa > 1:1837887/1‑93 (MQ=255) gCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAAc > 1:5780664/1‑93 (MQ=255) gCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAAc > 1:2401242/1‑93 (MQ=255) gCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAAc < 1:6741774/93‑1 (MQ=255) cTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACa < 2:4127904/93‑1 (MQ=255) tCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACat > 1:223128/1‑93 (MQ=255) cATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACata < 1:4300857/93‑1 (MQ=255) aTCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACatat > 1:5225901/1‑93 (MQ=255) aTCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACatat < 1:2555469/93‑1 (MQ=255) tCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATAtt < 2:2233659/93‑1 (MQ=255) tCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATAtt > 1:6125077/1‑93 (MQ=255) cTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTc < 1:3574647/93‑1 (MQ=255) cTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTc > 2:591180/1‑93 (MQ=255) tAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTcc > 2:534885/1‑93 (MQ=255) tAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTcc < 2:7852886/93‑1 (MQ=255) tAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTcc < 2:7775606/93‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAAt > 2:6286822/1‑93 (MQ=255) tAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAAt > 2:7368481/1‑93 (MQ=255) gaaaGAGCCTTTCATCTTTTGGCGCAAGCATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAAt < 1:6625501/92‑1 (MQ=255) aaaGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATc < 2:6312545/93‑1 (MQ=255) gagCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCt < 2:4808689/93‑1 (MQ=255) gagCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATAGCt > 2:6478304/1‑93 (MQ=255) agCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCtt < 1:4470863/93‑1 (MQ=255) gCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCttt < 1:7936987/93‑1 (MQ=255) ccTTTCTTCTTTTGGCGCACGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTc < 2:7035509/93‑1 (MQ=255) cTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCa < 1:361323/93‑1 (MQ=255) tttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAg > 2:5535565/1‑93 (MQ=255) tttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAg > 1:7704909/1‑93 (MQ=255) tCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga < 1:7353082/93‑1 (MQ=255) tCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga < 1:4074081/93‑1 (MQ=255) tCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatga > 2:6701788/1‑93 (MQ=255) tCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatga < 1:5546471/93‑1 (MQ=255) ttttGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGata < 2:2154310/93‑1 (MQ=255) ttGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGataat < 2:5315634/93‑1 (MQ=255) ggCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAg < 2:6787095/93‑1 (MQ=255) ggCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAg > 2:3986722/1‑93 (MQ=255) ggCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAg < 1:4501933/93‑1 (MQ=255) gCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGt < 1:3987937/93‑1 (MQ=255) cGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGtt < 1:371898/93‑1 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt < 1:1320371/93‑1 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt < 2:3189704/93‑1 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt > 1:6303907/1‑93 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt < 2:211544/93‑1 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt < 2:2049501/93‑1 (MQ=255) aaaGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTg > 2:2655214/1‑93 (MQ=255) aGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTa > 2:4402881/1‑93 (MQ=255) aGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTa < 2:1933909/93‑1 (MQ=255) ttAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGttt < 2:6239918/93‑1 (MQ=255) ttAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGttt < 1:1740199/93‑1 (MQ=255) ttAACCCTGATGTTTGGGGCCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGttt > 2:1288748/1‑93 (MQ=255) aaCCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTta < 1:6336625/93‑1 (MQ=255) aaCCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGAAGTTTta < 2:3237479/93‑1 (MQ=255) aCCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTtat < 2:3760224/93‑1 (MQ=255) cccTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTtata > 1:1042028/1‑93 (MQ=255) cccTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTtata > 2:4435473/1‑93 (MQ=255) cTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATAtt < 1:5434695/93‑1 (MQ=255) tGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTg > 1:5924749/1‑93 (MQ=255) gTTTGGGGTCAATCAGTTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAAt > 2:7821225/1‑93 (MQ=255) tttGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAAtt > 2:1468181/1‑93 (MQ=255) ttGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTc < 1:3356014/93‑1 (MQ=255) tGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTCa < 1:6806693/93‑1 (MQ=255) ggggTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTCAg < 1:3344143/93‑1 (MQ=255) gggTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTCAGc < 1:7674451/93‑1 (MQ=255) | TATTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGCCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTCAGC > NC_000913/2107600‑2107779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |