| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,321,092 | G→A | A403T (GCC→ACC) | atoC → | ornithine decarboxylase antizyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,321,092 | 0 | G | A | 99.2% | 848.0 / ‑4.4 | 253 | A403T (GCC→ACC) | atoC | ornithine decarboxylase antizyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (135/114); total (135/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181 | gtcgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcc < 1:4823212/93‑1 (MQ=255)gtcgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcc > 1:1845289/1‑93 (MQ=255) tcgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAccc > 1:2648849/1‑93 (MQ=255) cgtGATGAATTCAGGCCCGATCAGTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcccc < 2:5368890/93‑1 (MQ=255) gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt < 2:7747642/93‑1 (MQ=255) tgatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTg > 1:1971645/1‑93 (MQ=255) tgatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGGAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCGTg > 2:6694833/1‑93 (MQ=255) gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt > 2:6782565/1‑93 (MQ=255) gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt < 2:7733846/93‑1 (MQ=255) gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTCAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt > 1:4761998/1‑93 (MQ=255) atgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTc < 1:7675523/93‑1 (MQ=255) tgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCg > 2:2012802/1‑93 (MQ=255) tgaATTCAGCCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCg < 2:3054110/93‑1 (MQ=255) gaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCgg > 1:7566317/1‑93 (MQ=255) 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ccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt < 2:6791815/93‑1 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 2:6021881/1‑93 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 1:1571041/1‑93 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGACACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 2:2625707/1‑93 (MQ=255) gATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAttt > 2:5069825/1‑93 (MQ=255) aTCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTa > 2:1046450/1‑93 (MQ=255) aTCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTa > 2:251079/1‑93 (MQ=255) cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaa > 1:7481332/1‑93 (MQ=255) aTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa < 1:1181906/93‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa > 1:2727280/1‑93 (MQ=255) ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag > 2:407809/1‑93 (MQ=255) ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag > 1:5058595/1‑93 (MQ=255) ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag > 2:1748507/1‑93 (MQ=255) tttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAaga < 1:2525554/93‑1 (MQ=255) tttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAaga < 1:7815181/93‑1 (MQ=255) ttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAagag > 2:4106049/1‑93 (MQ=255) ttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAagag < 2:2213283/93‑1 (MQ=255) ttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAagag < 2:5214344/93‑1 (MQ=255) ttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAagag < 2:7323298/93‑1 (MQ=255) cTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGaaa < 2:6425413/93‑1 (MQ=255) cTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGaaa > 2:3284374/1‑93 (MQ=255) tGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAt > 2:197162/1‑93 (MQ=255) gaggagCTTCCGCCACAGATCCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAtt < 1:5861460/93‑1 (MQ=255) ggATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTaa > 1:6862123/1‑93 (MQ=255) 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acaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaa > 2:4346619/1‑93 (MQ=255) acaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaa > 2:3841254/1‑93 (MQ=255) caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaaa > 1:4493025/1‑93 (MQ=255) caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaaa > 2:4170844/1‑93 (MQ=255) aGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAc > 1:2104975/1‑93 (MQ=255) aGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAc < 2:4258352/93‑1 (MQ=255) gATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACg > 1:6592855/1‑93 (MQ=255) gATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACg > 1:6798438/1‑93 (MQ=255) 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gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa < 1:5958914/93‑1 (MQ=255) gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa < 2:7126685/93‑1 (MQ=255) aaaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAgg < 2:3586577/93‑1 (MQ=255) aaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGa < 2:6567247/93‑1 (MQ=255) aaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGa < 1:7277841/93‑1 (MQ=255) aacaacCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGaaa < 1:3209149/93‑1 (MQ=255) | GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |