Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,556,088 | G→A | R204R (CGC→CGT) | b2441 ← | ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,556,088 | 0 | G | A | 99.0% | 722.8 / ‑5.8 | 208 | R204R (CGC→CGT) | b2441 | ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (114/91); total (114/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CGCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGC > NC_000913/2555998‑2556177 | cTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGc > 2:1378654/1‑93 (MQ=255) cTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGc > 1:5283566/1‑93 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATTACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:2552413/1‑93 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:5183795/1‑93 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt < 2:4251678/93‑1 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:5289920/1‑93 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt < 2:5557870/93‑1 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 1:5078226/1‑93 (MQ=255) tCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCtt > 1:1678684/1‑93 (MQ=255) gATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTaa < 2:3949562/93‑1 (MQ=255) gATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAATACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTaa < 2:5393671/93‑1 (MQ=255) gATCTGGGTGATGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTaa < 2:1255232/93‑1 (MQ=255) aTCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGCCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAg > 1:6423603/1‑93 (MQ=255) tCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCAAACACACGGCTTAAGt > 2:7203727/1‑93 (MQ=255) cTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGtt > 1:2353780/1‑93 (MQ=255) tGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGttt < 2:3182429/93‑1 (MQ=255) gtggtgACGTGCACCAGTACACAGCCCTGAGTTGGAATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAAATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTcc < 1:6021452/93‑1 (MQ=255) tggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCa > 2:3765454/1‑93 (MQ=255) tggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCa < 2:5705848/93‑1 (MQ=255) gggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCa < 2:4827202/92‑1 (MQ=255) ggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAc < 1:6937777/93‑1 (MQ=255) ggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAc < 2:6929202/93‑1 (MQ=255) ggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAc < 1:2055359/93‑1 (MQ=255) gtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcg > 2:1562281/1‑93 (MQ=255) gtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcg > 2:3265814/1‑93 (MQ=255) tgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgt < 2:2908670/93‑1 (MQ=255) gACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGCTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtc > 1:5671195/1‑93 (MQ=255) gACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtc > 2:4528281/1‑93 (MQ=255) gACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtc < 2:1174015/93‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtcgt > 1:2103641/1‑93 (MQ=255) tGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtca < 1:6328003/93‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtca < 2:7861891/93‑1 (MQ=255) cgcCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCTATCACGCCATAGATGGTATCCACCACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtcagt < 2:7886984/93‑1 (MQ=255) gcCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtcagtc < 1:7457064/93‑1 (MQ=255) ccAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtcagtca > 2:2816352/1‑93 (MQ=255) ccAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtcagtca < 2:6075347/93‑1 (MQ=255) ccAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtcagtca > 2:7700153/1‑93 (MQ=255) cAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAc < 1:1054098/93‑1 (MQ=255) 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aGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTaa > 1:7597668/1‑93 (MQ=255) gCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAAc < 1:3042303/93‑1 (MQ=255) gCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAAc > 2:5878754/1‑93 (MQ=255) ccTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGc > 1:2306908/1‑93 (MQ=255) ccTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGc > 1:2501674/1‑93 (MQ=255) tGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCg > 1:1071847/1‑93 (MQ=255) aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt < 2:4569293/93‑1 (MQ=255) aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt > 1:471420/1‑93 (MQ=255) aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt > 1:2231036/1‑93 (MQ=255) gTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATc > 2:5997239/1‑93 (MQ=255) ttGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATcc > 1:7115983/1‑92 (MQ=255) ttGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCa > 1:4770895/1‑93 (MQ=255) tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 2:4943046/1‑93 (MQ=255) tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc < 1:5340575/93‑1 (MQ=255) gggATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAcc > 2:1031648/1‑93 (MQ=255) tGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCAt > 2:2059409/1‑93 (MQ=255) 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aTTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGTATCGCCCa > 2:2078575/1‑93 (MQ=255) ttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAcc > 1:944687/1‑93 (MQ=255) aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 2:1635752/1‑93 (MQ=255) ccGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 1:3476782/92‑1 (MQ=255) aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa > 2:845973/1‑93 (MQ=255) aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 2:6964772/93‑1 (MQ=255) ggCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaaa < 1:551887/92‑1 (MQ=255) cGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaaa > 2:263914/1‑93 (MQ=255) 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tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt > 1:3551529/1‑93 (MQ=255) tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt < 1:7203797/93‑1 (MQ=255) tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt > 1:7335595/1‑93 (MQ=255) tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt > 1:1697144/1‑93 (MQ=255) tGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGt < 1:3225783/93‑1 (MQ=255) gTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAg > 1:194985/1‑93 (MQ=255) tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCCTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa > 2:4679772/1‑93 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTTCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATTGCCCACCCCGAAGGAAACCCCTTCGTAGCtt > 1:4951289/1‑93 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 2:6348261/1‑93 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 2:7273683/1‑93 (MQ=255) ccAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAttt < 1:6669178/93‑1 (MQ=255) acacacGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcg > 1:4314321/1‑93 (MQ=255) cacaCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcgc > 2:7691139/1‑93 (MQ=255) cacaCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcgc > 2:2706757/1‑93 (MQ=255) | CGCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGC > NC_000913/2555998‑2556177 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |