| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,559,003 | G→A | intergenic (+85/‑385) | b2443 → / → b2444 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,559,003 | 0 | G | A | 99.6% | 824.2 / NA | 229 | intergenic (+85/‑385) | b2443/b2444 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (105/123); minor base C (0/1); total (105/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG > NC_000913/2558913‑2559092 | aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc > 2:2837385/1‑93 (MQ=255) aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaa < 1:5840562/93‑1 (MQ=255) tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCcaa > 1:4201355/1‑93 (MQ=255) tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaa > 2:378835/1‑93 (MQ=255) aCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAg > 1:7781704/1‑93 (MQ=255) ggAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGtt < 1:2704937/93‑1 (MQ=255) gAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTg > 1:595675/1‑93 (MQ=255) aaTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGc < 2:5116493/93‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGcc > 1:4636269/1‑93 (MQ=255) tCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCg > 1:2375910/1‑93 (MQ=255) cAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGt > 1:5655393/1‑93 (MQ=255) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt > 1:2964136/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTa < 2:5729816/93‑1 (MQ=255) gCGGGCAATGTTCGCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTaa > 1:1962281/1‑93 (MQ=255) gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg > 1:7613350/1‑93 (MQ=255) gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 1:5220953/93‑1 (MQ=255) ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAggg > 2:6903991/1‑92 (MQ=255) ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 1:5893006/93‑1 (MQ=255) ggCAATGTCCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 2:2885315/93‑1 (MQ=255) aaTATTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:5813604/1‑93 (MQ=255) aTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt > 1:3173804/1‑93 (MQ=255) aTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt > 1:7245479/1‑93 (MQ=255) aTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt > 2:5051523/1‑93 (MQ=255) aTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt > 2:5697879/1‑93 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATGAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc > 1:6894993/1‑93 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 1:534999/93‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc > 2:7883302/1‑93 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc > 2:4156216/1‑93 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 1:2546202/1‑93 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 1:3817755/1‑93 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 1:4975076/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGt < 2:6112737/93‑1 (MQ=255) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 1:4428861/1‑93 (MQ=255) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 2:5561929/93‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg > 2:72595/1‑93 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 1:2499126/93‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:4687582/93‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc > 1:361107/1‑93 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc > 2:1799643/1‑93 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc > 1:912068/1‑93 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc > 1:2754964/1‑93 (MQ=255) tttCTTTGCCTGAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTTGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 2:4799171/93‑1 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 1:469451/93‑1 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 2:6262335/1‑93 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:1333197/93‑1 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:7462991/93‑1 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg > 2:4986107/1‑93 (MQ=255) gCCTTAATTGCATGAACTCAGGTGGGTCAAAAGGTTCCCGTAGTTGTGGATCAAAAGGTCCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 2:2692510/93‑1 (MQ=18) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 1:5495648/93‑1 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 2:4499015/93‑1 (MQ=255) ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 1:3412749/93‑1 (MQ=255) cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:4427636/93‑1 (MQ=255) cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:1235778/93‑1 (MQ=255) cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGGTAGTGGTGGATCAAACGATGCAGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 1:3445905/1‑93 (MQ=25) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 2:422767/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg < 1:5106739/93‑1 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:6166405/1‑93 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTTGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 2:3217753/93‑1 (MQ=255) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 2:7823311/1‑93 (MQ=255) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg < 1:6295649/93‑1 (MQ=255) aTGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGt < 1:4332914/93‑1 (MQ=255) tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 1:7050692/1‑93 (MQ=255) aaTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:2397775/93‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 1:1776599/93‑1 (MQ=255) cAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAg < 1:5098073/93‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt < 1:386508/93‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt < 1:2862760/93‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTa < 2:1377483/93‑1 (MQ=255) gtaggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa < 2:83890/90‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa > 2:1836390/1‑93 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa < 1:842346/93‑1 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 2:5287751/93‑1 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 1:1306954/93‑1 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGgaagaa > 1:6824498/1‑93 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAt < 2:3853536/93‑1 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGCGTAAGAATTct > 1:190596/1‑93 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTct > 2:7697356/1‑93 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTct > 2:4679460/1‑93 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta < 1:488070/93‑1 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta > 2:5183058/1‑93 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAGCGGTGGATCAAAAGATGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTTCAGCTAAGGTGGGTTAAAAGTTGCCGGGGAACAAtgcat > 2:6699036/1‑89 (MQ=17) aGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctact > 1:532495/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta > 2:3483436/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta > 1:101539/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta > 1:2291047/1‑93 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAg > 1:5908584/1‑93 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAg > 2:3588812/1‑93 (MQ=255) ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa > 2:6748227/1‑93 (MQ=255) ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa < 1:3271792/93‑1 (MQ=255) ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa > 1:2017255/1‑93 (MQ=255) aGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAtt > 1:4671375/1‑93 (MQ=255) gtggtgGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 1:3760864/93‑1 (MQ=255) gtggtgGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 1:1462394/93‑1 (MQ=255) tggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCCAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAtttt > 2:4110628/1‑91 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa > 2:3323369/1‑93 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa > 2:5140698/1‑93 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:6106744/93‑1 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa > 1:7382739/1‑93 (MQ=255) gtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAg < 2:651013/93‑1 (MQ=255) tggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg > 2:4592781/1‑93 (MQ=255) | AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG > NC_000913/2558913‑2559092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |