| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,709,504 | T→C | G355G (GGT→GGC) | nadB → | quinolinate synthetase B protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,709,504 | 0 | T | C | 99.6% | 688.4 / ‑5.2 | 222 | G355G (GGT→GGC) | nadB | quinolinate synthetase B protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (102/119); total (103/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CCCGATGATTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGTGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACGGCGCTA > NC_000913/2709414‑2709592 | ccGATGATTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCggcggt > 1:1104928/1‑93 (MQ=255) ccGATGATTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCggcggt < 1:867339/93‑1 (MQ=255) ccGATGATTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCggcggt > 1:2943762/1‑93 (MQ=255) cGATGATTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGgcggtg < 2:7841812/93‑1 (MQ=255) gatgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGgtgt < 2:7296325/93‑1 (MQ=255) gatgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGgtgt > 1:2299766/1‑93 (MQ=255) gatgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGgggt > 2:1918225/1‑93 (MQ=255) tgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTaa < 2:608637/93‑1 (MQ=255) tgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTaa < 2:4525403/93‑1 (MQ=255) tgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTaa > 1:444925/1‑93 (MQ=255) tgatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTaa > 1:2043286/1‑93 (MQ=255) gatTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAAt < 1:3515051/93‑1 (MQ=255) tttATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATgg > 2:6017983/1‑93 (MQ=255) tttATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATgg > 1:4039082/1‑93 (MQ=255) tATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTTTTGGtt > 2:5702651/1‑93 (MQ=255) tATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGtt > 1:5400852/1‑93 (MQ=255) tGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtga > 1:5142659/1‑93 (MQ=255) tGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtga > 1:7674338/1‑93 (MQ=255) tGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtga < 2:6360762/93‑1 (MQ=255) aaaaGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtgatg > 2:3979829/1‑93 (MQ=255) aaaGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGACCCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtgatga < 2:313381/93‑1 (MQ=255) aaaGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtgatga > 1:2865632/1‑93 (MQ=255) aaaGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTtgatga > 1:2389264/1‑93 (MQ=255) aaGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTgatgat > 1:3357996/1‑93 (MQ=255) aGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATc < 2:2057146/93‑1 (MQ=255) gctgctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCa > 1:3544215/1‑93 (MQ=255) ctgctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCAt < 2:4919406/93‑1 (MQ=255) ctgctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCAt < 2:6902313/93‑1 (MQ=255) tgctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATg < 1:3840649/93‑1 (MQ=255) tgctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATg < 2:17643/93‑1 (MQ=255) tgctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATg < 1:7525786/93‑1 (MQ=255) tgctCGGGCTGGGGATTGATCGGACACAAGAACCGTTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATg > 1:1385213/1‑93 (MQ=255) gctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATgg > 1:6890690/1‑93 (MQ=255) gctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATgg < 1:7189034/93‑1 (MQ=255) gctCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCAGTGTAATGGTTGATGATCATgg < 2:4978564/93‑1 (MQ=255) gggCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGt < 2:2172033/93‑1 (MQ=255) gCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTAc < 1:1700312/93‑1 (MQ=255) tGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACgg < 2:4461164/93‑1 (MQ=255) tGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACgg > 2:5300172/1‑93 (MQ=255) ggggATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGa < 2:5186110/93‑1 (MQ=255) ggggATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGa < 1:7789770/93‑1 (MQ=255) gggATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGAc < 1:1595350/93‑1 (MQ=255) ggATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATGCCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACg < 1:3289359/93‑1 (MQ=255) ggATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACg < 1:5668349/93‑1 (MQ=255) ggATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACg < 2:697272/93‑1 (MQ=255) aTTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTc > 1:1827890/1‑93 (MQ=255) ttGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCg > 1:1757429/1‑93 (MQ=255) tcaTCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGa < 2:3731394/91‑1 (MQ=255) tGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCgg > 2:6031341/1‑92 (MQ=255) gATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAg < 1:102543/93‑1 (MQ=255) ctcACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGc < 2:5352414/93‑1 (MQ=255) tcACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCt > 2:3588101/1‑93 (MQ=255) tcACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCt < 2:4039548/93‑1 (MQ=255) acacaAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTg < 2:5649000/93‑1 (MQ=255) acacaAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTg < 2:4830084/93‑1 (MQ=255) acaAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTa < 2:6805021/93‑1 (MQ=255) acaAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTa < 1:6687364/93‑1 (MQ=255) acaAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTa > 2:5440049/1‑93 (MQ=255) caAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTAt < 1:3953891/93‑1 (MQ=255) aGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGc > 1:3165113/1‑93 (MQ=255) aGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGc < 2:3459595/93‑1 (MQ=255) gAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGcc < 1:6484724/93‑1 (MQ=255) 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aTTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAgggg > 1:6412390/1‑91 (MQ=255) aTTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTg < 1:5002464/93‑1 (MQ=255) ttGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGa < 2:672776/93‑1 (MQ=255) ttGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGa < 2:421007/93‑1 (MQ=255) tgtgCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAg < 2:5272557/93‑1 (MQ=255) gtgCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGt > 2:7559178/1‑93 (MQ=255) gCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTta < 2:5030770/93‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTta < 1:5591046/93‑1 (MQ=255) ccTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTtat < 2:1653419/93‑1 (MQ=255) ccTGCTGCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTtat > 2:5963390/1‑93 (MQ=255) ctgctgCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTtata < 1:3686636/93‑1 (MQ=255) ctgctgCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTtata < 2:2529032/93‑1 (MQ=255) ctgctgCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTtata < 1:1805139/93‑1 (MQ=255) ctgctgCACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTtata < 1:527911/93‑1 (MQ=255) tgctgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATAc < 1:469398/93‑1 (MQ=255) tgctgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATAc < 1:2434613/93‑1 (MQ=255) tgctgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATAc < 1:1572401/93‑1 (MQ=255) gctgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATAcc > 1:6348672/1‑93 (MQ=255) gctgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATAcc < 2:3367442/93‑1 (MQ=255) ctgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGGGAGTTATACCg > 1:6159598/1‑93 (MQ=255) tgcACATTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGGGAGTTATACCgg > 1:398151/1‑93 (MQ=255) cacaTTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCt < 2:2909044/93‑1 (MQ=255) caTTATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTa < 1:7911208/93‑1 (MQ=255) ttATACCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTaca < 2:235142/93‑1 (MQ=255) ataCCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACg > 2:3066267/1‑93 (MQ=255) taCCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACgg < 2:2221158/93‑1 (MQ=255) taCCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACgg > 1:267488/1‑93 (MQ=255) taCCTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACgg > 2:2616391/1‑93 (MQ=255) ccTGCGGCGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACGgcg > 2:152548/1‑93 (MQ=255) gcggcgGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACGGCGCTa > 1:1240255/1‑93 (MQ=255) | CCCGATGATTTATGAAAAGCTGCTCGGGCTGGGGATTGATCTCACACAAGAACCGGTACCGATTGTGCCTGCTGCACATTATACCTGCGGTGGTGTAATGGTTGATGATCATGGGCGTACGGACGTCGAGGGCTTGTATGCCATTGGCGAGGTGAGTTATACCGGCTTACACGGCGCTA > NC_000913/2709414‑2709592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |