Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,825,102 | T→C | F230L (TTC→CTC) | srlE → | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,825,102 | 0 | T | C | 99.6% | 829.7 / NA | 263 | F230L (TTC→CTC) | srlE | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (117/145); total (118/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT > NC_000913/2825012‑2825190 | aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc > 1:1187057/1‑93 (MQ=255) aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 1:4988556/93‑1 (MQ=255) aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 1:6188664/93‑1 (MQ=255) tGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCgg < 1:4344371/93‑1 (MQ=255) cccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGcc < 2:1966095/93‑1 (MQ=255) ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc > 2:5337520/1‑93 (MQ=255) cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa > 2:4182913/1‑93 (MQ=255) cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa < 1:5164284/93‑1 (MQ=255) cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa > 1:809437/1‑93 (MQ=255) aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg > 1:7689886/1‑93 (MQ=255) aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg < 2:1245066/93‑1 (MQ=255) tCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcgc < 1:1775958/93‑1 (MQ=255) tCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcgc < 2:6592091/93‑1 (MQ=255) tGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGt > 1:3724735/1‑93 (MQ=255) cTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTa < 1:1625847/93‑1 (MQ=255) tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt < 2:766958/93‑1 (MQ=255) tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt > 1:4019951/1‑93 (MQ=255) ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc > 1:4463077/1‑93 (MQ=255) ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCCCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc > 1:6843498/1‑93 (MQ=255) cGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCg > 2:1052912/1‑93 (MQ=255) tGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac < 2:3974900/93‑1 (MQ=255) tGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac < 2:1647893/93‑1 (MQ=255) ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca > 2:74081/1‑93 (MQ=255) ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 1:2134568/93‑1 (MQ=255) ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCACGCGCAGTTATCGcaca > 2:1865657/1‑93 (MQ=255) gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt < 2:4236713/93‑1 (MQ=255) gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt > 1:4805407/1‑93 (MQ=255) aGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCGCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGtt > 2:6772778/1‑93 (MQ=255) aGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGtt > 1:6040451/1‑93 (MQ=255) gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa > 1:2513931/1‑93 (MQ=255) accATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCTCCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa < 2:6663149/92‑1 (MQ=255) ccATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAt < 2:5580654/93‑1 (MQ=255) ccATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAt < 2:3892202/93‑1 (MQ=255) cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:133870/93‑1 (MQ=255) cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc > 2:1299835/1‑93 (MQ=255) aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTTACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg < 1:1941400/93‑1 (MQ=255) aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg > 2:4484830/1‑93 (MQ=255) tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg > 1:5430565/1‑93 (MQ=255) tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg > 2:2965767/1‑93 (MQ=255) tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGGTATCgg > 2:578825/1‑93 (MQ=255) cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg > 2:7192852/1‑93 (MQ=255) cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg > 2:3486845/1‑93 (MQ=255) cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg < 1:3824146/93‑1 (MQ=255) cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg < 1:2931591/93‑1 (MQ=255) aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt > 2:5990513/1‑93 (MQ=255) aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt > 1:7129975/1‑93 (MQ=255) cTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTa < 1:356625/93‑1 (MQ=255) tGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTat > 1:2455581/1‑93 (MQ=255) tGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTCCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTat < 2:4942759/93‑1 (MQ=255) gggTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTatt < 2:1017134/93‑1 (MQ=255) tCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgat < 2:1147245/93‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg > 2:2555973/1‑93 (MQ=255) tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg > 2:2171763/1‑93 (MQ=255) tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg < 2:160731/93‑1 (MQ=255) ggTCATTCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTgg < 1:2832352/93‑1 (MQ=255) ggTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTgg < 2:292872/93‑1 (MQ=255) gTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc > 2:6978542/1‑93 (MQ=255) cATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGt < 2:6291862/93‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:648430/1‑93 (MQ=255) tGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:7054373/1‑93 (MQ=255) gCTGGCTCTCATCTGCTCCTTCCCGCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATGGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 1:4100718/93‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:2094817/93‑1 (MQ=255) tGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGa > 2:2770483/1‑93 (MQ=255) ggCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAt < 1:2049601/93‑1 (MQ=255) gcgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 1:5779018/93‑1 (MQ=255) cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt < 1:331114/93‑1 (MQ=255) cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt < 1:6582490/93‑1 (MQ=255) tCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc < 1:1074717/93‑1 (MQ=255) tCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc > 1:2415176/1‑93 (MQ=255) ccATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc < 2:6869430/92‑1 (MQ=255) cATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtct < 1:1457787/93‑1 (MQ=255) aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 2:6256483/1‑93 (MQ=255) aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 1:2103164/1‑93 (MQ=255) aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCACGCGCCGGTATCGCACAGGCTATCTGCGTATTGAATGGCGTGCAGATTGGtctg > 2:4816790/1‑92 (MQ=255) ctccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCaa > 2:2058728/2‑93 (MQ=255) ctccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCaa > 1:4205801/2‑93 (MQ=255) tccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAat > 1:7250260/1‑93 (MQ=255) cttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAatat > 1:7306985/1‑93 (MQ=255) cttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAatat < 2:7914050/93‑1 (MQ=255) ttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAtt > 1:2352175/1‑93 (MQ=255) cccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTcc < 2:3353550/93‑1 (MQ=255) ccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccg > 1:5593305/1‑93 (MQ=255) ccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccg < 1:4902176/93‑1 (MQ=255) cACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgc > 1:1320461/1‑93 (MQ=255) aCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgcc > 2:5052954/1‑93 (MQ=255) cTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgccg > 1:6293865/1‑93 (MQ=255) cTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgccg < 1:595892/93‑1 (MQ=255) cgttCACCTGTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAGTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAt < 2:1389360/91‑1 (MQ=255) cTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAt > 2:7391624/1‑93 (MQ=255) cTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAt < 1:3806772/93‑1 (MQ=255) tttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATc < 1:699870/93‑1 (MQ=255) tttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATc > 1:1073870/1‑93 (MQ=255) tttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATc > 2:4554473/1‑93 (MQ=255) ttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCt < 2:1565969/93‑1 (MQ=255) ttCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCt < 2:3260752/93‑1 (MQ=255) tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 1:4233283/93‑1 (MQ=255) tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 2:5476157/93‑1 (MQ=255) tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 1:741389/93‑1 (MQ=255) cACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTgg > 1:7075054/1‑93 (MQ=255) aCCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGc < 1:5741963/93‑1 (MQ=255) | ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT > NC_000913/2825012‑2825190 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |