Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,025,603 T→C G154G (GGT→GGC ygfQ → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,025,6030TC100.0% 1005.9 / NA 319G154G (GGT→GGCygfQhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (163/156);  total (163/156)

Only 100 of 365 total aligned reads displayed.

CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCAGTGGCGCTCGGTGC  >  NC_000913/3025513‑3025691
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                    ccGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGa                                                                     <  1:5351231/93‑1 (MQ=255)
                     cGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAt                                                                    <  1:3027169/93‑1 (MQ=255)
                     cGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAt                                                                    >  2:1403637/1‑93 (MQ=255)
                        taCCGGGGTTCGTATCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgc                                                                 <  1:2426845/92‑1 (MQ=255)
                         aCCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgct                                                                <  2:4809465/93‑1 (MQ=255)
                           cGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgctgc                                                              <  1:2775164/93‑1 (MQ=255)
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                           cGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgctgc                                                              <  1:5504625/93‑1 (MQ=255)
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                            ggTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTgctgct                                                             >  1:1172702/1‑93 (MQ=255)
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                                                                   aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGCTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGc                      >  1:6558961/1‑93 (MQ=255)
                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                     <  1:4108236/93‑1 (MQ=255)
                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                     >  1:980859/1‑93 (MQ=255)
                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                     >  1:7532617/1‑93 (MQ=255)
                                                                     cGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCtt                    <  1:1498948/93‑1 (MQ=255)
                                                                      gCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTg                   >  2:6213366/1‑93 (MQ=255)
                                                                       cTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGc                 <  2:6035556/93‑1 (MQ=255)
                                                                        tCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcc                >  1:4089618/1‑92 (MQ=255)
                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcca               <  1:4234700/93‑3 (MQ=255)
                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcca               <  1:448057/93‑3 (MQ=255)
                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcca               >  1:3267223/1‑91 (MQ=255)
                                                                          aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGccag              <  1:126589/93‑4 (MQ=255)
                                                                             gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg            <  1:5136491/93‑1 (MQ=255)
                                                                                cAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcgc         <  1:6845334/93‑1 (MQ=255)
                                                                                      tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGGATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTg   >  2:3489991/1‑93 (MQ=255)
                                                                                       cggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGc  <  2:5539483/93‑1 (MQ=255)
                                                                                          |                                                                                         
CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCAGTGGCGCTCGGTGC  >  NC_000913/3025513‑3025691

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: