| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,316,594 | (C)5→4 | coding (1219/1362 nt) | trpC ← | N‑(5‑phosphoribosyl)anthranilate isomerase and indole‑3‑glycerolphosphate synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,316,590 | 0 | C | . | 98.9% | 389.9 / ‑3.1 | 88 | coding (1223/1362 nt) | trpC | N‑(5‑phosphoribosyl)anthranilate isomerase and indole‑3‑glycerolphosphate synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (43/44); minor base G (0/1); total (43/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
CTTTGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGCCCCCCGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTCT > NC_000913/1316498‑1316676 | cTTTGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGc < 2:3613674/93‑1 (MQ=255)cTTTGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGc < 1:3697727/93‑1 (MQ=255) tttGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcc < 1:4683665/93‑1 (MQ=255) tttGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcc > 1:4494216/1‑93 (MQ=255) tttGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcc > 1:2644803/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGccc < 2:4572134/93‑1 (MQ=255) tGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcccc < 1:770303/93‑1 (MQ=255) gATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcccct > 1:2174184/1‑92 (MQ=255) aTGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcccctg > 1:874169/1‑91 (MQ=255) tGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcccctgc > 2:2432165/1‑90 (MQ=255) tGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGcccctgc < 1:3624408/93‑4 (MQ=255) ggTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCcagca > 1:3576395/1‑93 (MQ=255) ttGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGa < 2:534531/93‑1 (MQ=255) ttGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGa < 1:4117705/93‑1 (MQ=255) ttGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCACTGCCAGCAGa > 1:3257951/1‑93 (MQ=255) tGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGaa < 2:3875354/93‑1 (MQ=255) tGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGaa < 2:2386480/93‑1 (MQ=255) gCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAAc > 1:2005330/1‑93 (MQ=255) gACTCTGGAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGt < 2:20520/93‑1 (MQ=255) gACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGt < 1:1217292/93‑1 (MQ=255) gACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGt < 1:3207396/93‑1 (MQ=255) ctctACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTg > 1:4535501/1‑93 (MQ=255) tctACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGc > 2:206845/1‑93 (MQ=255) tctACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGc > 2:3149792/1‑93 (MQ=255) tACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCa > 2:2641419/1‑93 (MQ=255) tACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCa > 1:4629656/1‑93 (MQ=255) cagcagAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAg < 2:2969068/93‑1 (MQ=255) agcagAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGc < 2:1869798/93‑1 (MQ=255) gcagAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCg > 1:1650543/1‑93 (MQ=255) agAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAt < 1:2586683/93‑1 (MQ=255) agAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAt > 2:2663406/1‑93 (MQ=255) gAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAtt > 1:18521/1‑93 (MQ=255) gAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAtt < 1:1383140/93‑1 (MQ=255) gAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAtt > 1:290970/1‑93 (MQ=255) gAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAtt > 1:4674296/1‑93 (MQ=255) gAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGAtt > 2:2005968/1‑93 (MQ=255) aTTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGa > 1:4654634/1‑93 (MQ=255) aTTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGa > 2:3025566/1‑93 (MQ=255) aTTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGa > 2:1260171/1‑93 (MQ=255) ttAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGAc < 2:234463/93‑1 (MQ=255) aaaaTCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCa < 2:4254229/93‑1 (MQ=255) aaTCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCAtt > 1:270334/1‑93 (MQ=255) aaTCAAGTCCGCCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTCCCACGCAGTTGTCTGCGCCT‑AGGCCCCTGCCAGCAGAACGGTGCCAAGCGATTGACCAtt < 2:4576012/93‑1 (MQ=255) tCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTa < 2:1334400/93‑1 (MQ=255) cAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTaa < 2:1791320/93‑1 (MQ=255) cAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTaa < 1:3936581/93‑1 (MQ=255) cAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTaa < 2:2939879/93‑1 (MQ=255) cAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTaa > 1:1029264/1‑93 (MQ=255) aaGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAAt < 2:1129978/93‑1 (MQ=255) aGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATa < 2:2017373/93‑1 (MQ=255) aGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATa < 1:2988856/93‑1 (MQ=255) aGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATa > 1:2484550/1‑93 (MQ=255) tCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGt < 1:3537843/93‑1 (MQ=255) cGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGa > 1:1329017/1‑93 (MQ=255) ggCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGAc < 2:1232392/93‑1 (MQ=255) ggCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGAc > 1:3165144/1‑93 (MQ=255) gcgcAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGAcc < 1:1899159/93‑1 (MQ=255) gcgcAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGAcc > 2:4278606/1‑93 (MQ=255) gcAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAg < 2:2156306/93‑1 (MQ=255) cAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGt < 2:3121883/93‑1 (MQ=255) cAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGt > 2:3450553/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCa < 1:4137952/93‑1 (MQ=255) ccGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCaa > 1:1528918/1‑93 (MQ=255) cGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCaaa > 1:3420819/1‑93 (MQ=255) ggTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCaaaa > 2:1632002/1‑93 (MQ=255) ggTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCaaaa < 2:1847414/93‑1 (MQ=255) ggTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCaaaa > 2:4068766/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGCTTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAAc > 2:3008541/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAAc > 1:4334240/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAAc < 1:2198690/93‑1 (MQ=255) gTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAAc < 2:2762337/93‑1 (MQ=255) tttGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACg > 2:2384072/1‑93 (MQ=255) ttGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGCCCAGTCAAAACGt < 1:3398688/93‑1 (MQ=255) tgtgCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGtt < 1:3422608/93‑1 (MQ=255) tgCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGc > 2:490640/1‑93 (MQ=255) ttCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCtt < 1:653819/93‑1 (MQ=255) ttCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCtt < 1:1329297/93‑1 (MQ=255) ccACGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTcc > 2:2203923/1‑93 (MQ=255) cGCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCAcc > 1:3854719/1‑93 (MQ=255) gCAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCAccc > 2:1001555/1‑93 (MQ=255) cAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCt > 2:157370/1‑93 (MQ=255) cAGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGGGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCt > 2:1372631/1‑93 (MQ=255) aGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTg > 1:1011930/1‑93 (MQ=255) aGTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTg < 1:1601144/93‑1 (MQ=255) gTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTgg < 1:3229451/93‑1 (MQ=255) gTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTgg < 1:2028674/93‑1 (MQ=255) gTTATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTgg > 1:2494100/1‑93 (MQ=255) ttATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGc < 1:4363139/93‑1 (MQ=255) ttATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGc < 2:3932370/93‑1 (MQ=255) ttATCTGCACCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGc < 1:2766561/93‑1 (MQ=255) tATCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGcc > 1:279856/1‑93 (MQ=255) aTCTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCg > 2:3322081/1‑93 (MQ=255) cTGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGtt < 1:3342728/93‑1 (MQ=255) tGCGCCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTg < 2:3142669/93‑1 (MQ=255) gcgcCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGCTGt > 2:2810678/1‑93 (MQ=255) cgcCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTc < 1:4051439/93‑1 (MQ=255) cgcCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTc < 1:1923343/93‑1 (MQ=255) cgcCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTc < 2:2005330/93‑1 (MQ=255) cgcCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTc < 1:954461/93‑1 (MQ=255) gcCTAAG‑CCCCTGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTCt > 1:171648/1‑93 (MQ=255) | CTTTGATGCCCGGTTGCGACTCTACAGCAGAATTAAAATCAAGTCCGGCGCAGCCGGTTTGTGCCGCTTCCACGCAGTTATCTGCGCCTAAGCCCCCCGCCAGCAGAACGTTGCCAAGCGATTGACCATTTAATAGTGACCAGTCAAAACGTTGCCCGCTTCCACCCTGGCCGTTGTCT > NC_000913/1316498‑1316676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |