Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,899,957 | (C)5→6 | coding (1373/1413 nt) | bglB ← | phospho‑beta‑glucosidase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,899,952 | 1 | . | C | 99.6% | 765.7 / NA | 247 | L460V (CTG→GTG) | bglB | phospho‑beta‑glucosidase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); major base C (114/131); minor base A (1/0); total (116/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
ATGGTGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑C‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTGCATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGATC > NC_000913/3899860‑3900039 | aTGGTGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAg > 1:3734793/1‑93 (MQ=255) tGGTGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑c > 2:4468275/1‑93 (MQ=255) gTGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTATTTTTTTTTAATGACAG‑c‑c < 1:1044472/93‑1 (MQ=255) gTGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑c‑cc < 1:4093037/93‑1 (MQ=255) tGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑c‑ccc > 2:3851203/1‑93 (MQ=255) gCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑c‑cccc > 1:868127/1‑93 (MQ=255) aagaaagaATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑c‑cccccgc > 1:3895456/1‑90 (MQ=255) aaagaaTTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTc < 1:717988/93‑1 (MQ=255) aaagaaTTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTc < 1:2745191/93‑1 (MQ=255) aagaaTTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCt < 1:3355156/93‑1 (MQ=255) agaaTTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCtt > 2:1087079/1‑93 (MQ=255) aTTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGAt > 1:955582/1‑93 (MQ=255) aTTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGAt < 1:2168339/93‑1 (MQ=255) ttAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATc < 1:2345369/93‑1 (MQ=255) ttAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATc < 2:4577442/93‑1 (MQ=255) ttAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGAC‑CCCCGCGTCTTGATc > 2:372632/1‑93 (MQ=255) aCGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCAcc > 2:299594/1‑93 (MQ=255) aCGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATCAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATGAcc < 2:4132984/93‑1 (MQ=255) tcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACctctac > 2:1984612/1‑91 (MQ=255) tcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACctctac < 2:4437492/93‑3 (MQ=255) tcgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCGTGATCACctctac < 2:4606044/93‑3 (MQ=255) cgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCCCCTCTACa < 2:3220065/93‑1 (MQ=255) cgcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACa < 1:739464/93‑1 (MQ=255) gcatcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACAt < 2:1587424/93‑1 (MQ=255) tcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAcc < 1:2116684/93‑1 (MQ=255) tcCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑CACCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAcc > 2:2706434/1‑93 (MQ=255) cAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCAt > 2:2571951/1‑93 (MQ=255) cAGACTGTTCTGAATGCGACCATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCAt < 2:4216438/93‑1 (MQ=255) aGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATc > 2:1542191/1‑93 (MQ=255) gACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATcc > 1:1189871/1‑93 (MQ=255) cTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGa > 1:2151114/1‑93 (MQ=255) tGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGaa < 1:1665871/93‑1 (MQ=255) tGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGaa > 1:2297562/1‑93 (MQ=255) gTTCTGAATGCGCCGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAg < 2:2127244/93‑1 (MQ=255) ttCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGc < 1:4650627/93‑1 (MQ=255) tCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTATTTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGc > 2:434347/1‑93 (MQ=255) tGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCttt < 2:1403260/93‑1 (MQ=255) tGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCCTTGTCACCCCTCCATACCATCCCAAACttt > 2:866895/1‑93 (MQ=255) aaTGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTc < 1:4155416/93‑1 (MQ=255) aaTGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTc > 1:2389711/1‑93 (MQ=255) aTGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCt < 2:1897395/93‑1 (MQ=255) tGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCtt < 1:3970843/93‑1 (MQ=255) gacgaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCg > 1:3088452/1‑93 (MQ=255) gacgaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCCTGCg > 2:4147519/1‑93 (MQ=255) acgaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgt < 1:2572053/93‑1 (MQ=255) acgaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgt < 1:2720593/93‑1 (MQ=255) gaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgtgt < 2:3689286/93‑1 (MQ=255) gaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCgtgt > 2:3650896/1‑93 (MQ=255) gaTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAACATCCGAAGCTTTTCTTGCgtgt > 1:2473415/1‑93 (MQ=255) aTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGtt > 2:3115525/1‑93 (MQ=255) aTAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGtt > 2:3326156/1‑93 (MQ=255) tAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTc > 1:4417114/1‑93 (MQ=255) tAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTc < 2:1370884/93‑1 (MQ=255) tAATTAAGGGGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGATTTTCTTGCGTGTTc > 1:2070209/1‑93 (MQ=255) aaTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCt > 1:1313158/1‑93 (MQ=255) aaTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCt < 1:356517/93‑1 (MQ=255) aaTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCt < 2:2650330/93‑1 (MQ=255) aaTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATAACATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCt > 1:1619398/1‑93 (MQ=255) aTTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCtt < 2:1032926/93‑1 (MQ=255) ttAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtg < 2:2820495/93‑1 (MQ=255) ttAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtg < 1:41703/93‑1 (MQ=255) ttAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtg < 1:55942/93‑1 (MQ=255) aaGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtgtg < 2:1461615/93‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTtgtgg > 2:1654547/1‑92 (MQ=255) aGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGa > 1:3523057/1‑93 (MQ=255) ggTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAg > 2:2206073/1‑93 (MQ=255) tGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGc > 2:1926979/1‑93 (MQ=255) gCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGct > 2:496860/1‑93 (MQ=255) gCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGCCTTGATTACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTTTTGCGTGTTCTTGTGAGGct > 2:3283563/1‑93 (MQ=255) tttAATTGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCCCCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttc < 1:1003761/93‑1 (MQ=255) tttAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttc > 1:788170/1‑93 (MQ=255) ttAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttcc < 2:2053619/93‑1 (MQ=255) taTGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGcttcctt < 1:461197/92‑1 (MQ=255) tGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGCTCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCg > 2:769766/1‑93 (MQ=255) ggTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGTGGCTTCCTTCGc > 1:4297172/1‑93 (MQ=255) ggTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGc > 1:4540985/1‑93 (MQ=255) ggTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGc > 2:3565208/1‑93 (MQ=255) gTTA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGcc < 1:1407534/93‑1 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa > 2:3390571/1‑93 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa > 1:1357019/1‑93 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa < 2:4020417/93‑1 (MQ=255) ttA‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCa < 2:3858187/93‑1 (MQ=255) a‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCAtt < 2:3099523/93‑1 (MQ=255) a‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCAtt > 2:1216481/1‑93 (MQ=255) a‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCAtt < 2:3494967/93‑1 (MQ=255) a‑TTTTTTTTAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCAtt > 1:1628705/1‑93 (MQ=255) ttttttttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTa < 2:1712964/93‑1 (MQ=255) tttttttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTat < 1:3875543/93‑1 (MQ=255) tttttttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTat < 1:1767476/93‑1 (MQ=255) ttttttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTatc < 1:3039535/93‑1 (MQ=255) ttttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTatcat < 1:3156492/93‑1 (MQ=255) ttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCTCCATTAtcatca > 2:1281559/1‑93 (MQ=255) ttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTAtcatca < 2:2416575/93‑1 (MQ=255) ttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTAtcatca > 2:582912/1‑93 (MQ=255) ttAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTAtcatca > 1:3654593/1‑93 (MQ=255) tAATGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCAc > 1:485158/1‑93 (MQ=255) aaTGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACg < 1:2835904/93‑1 (MQ=255) aaTGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACg > 1:1956762/1‑93 (MQ=255) aaTGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACg > 1:1503407/1‑93 (MQ=255) aTGACAGCC‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTACATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGa < 1:2367261/93‑1 (MQ=255) | ATGGTGCAAAGAAAGAATTAACGCATCGCATCCAGACTGTTCTGAATGCGACGATAATTAAGGTGCTTTAATGGTTA‑TTTTTTTTAATGACAG‑C‑CCCCGCGTCTTGATCACCTCTGCATACCATCCGAAGCTTTTCTTGCGTGTTCTTGTGAGGCTTCCTTCGCCATTATCATCACGATC > NC_000913/3899860‑3900039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |