Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,099,309 | (G)7→8 | coding (48/993 nt) | kdgT → | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,099,302 | 1 | . | G | 99.2% | 395.1 / ‑5.1 | 129 | P14R (CCG→CGG) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); major base G (91/36); minor base A (1/0); total (92/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
ACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAC > NC_000913/4099210‑4099389 | acTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATcc‑c > 2:1267311/1‑93 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑gg > 2:3737765/1‑93 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTAAGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑gg > 2:2986045/1‑93 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggg > 1:565425/1‑93 (MQ=255) aTGCTCCATTCAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGGGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggag > 2:2392442/1‑91 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggggg < 2:1434070/93‑1 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑gggggggg > 1:1053527/1‑92 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑gggggggg > 1:730190/1‑92 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggggggggt > 2:3852805/1‑91 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑gggggggga < 1:674247/93‑3 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggggggggat < 1:4245574/93‑4 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggggggggat > 1:2195078/1‑90 (MQ=255) aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑ggggggggatg < 2:3790047/93‑5 (MQ=255) tGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGgatgat > 2:1646967/1‑93 (MQ=255) gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGatgatg > 2:858164/1‑93 (MQ=255) gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGatgatg > 1:4251678/1‑93 (MQ=255) ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCt > 2:3537648/1‑93 (MQ=255) ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCt > 1:1900887/1‑93 (MQ=255) gAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTc > 1:4587389/1‑93 (MQ=255) aaTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCg > 1:1293534/1‑93 (MQ=255) ttACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTc > 1:4434016/1‑93 (MQ=255) ttACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTc > 1:2937291/1‑93 (MQ=255) aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTccc < 2:4410038/93‑1 (MQ=255) gCATCAGCCCTTGAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGc < 1:1464846/93‑1 (MQ=255) gCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGc > 2:2907185/1‑93 (MQ=255) cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCt > 1:3515555/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTa < 1:4647527/93‑1 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTa > 1:2758952/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt > 1:3913597/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt > 2:523190/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAAATAAAACGCTCGATTGAGAAAACCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt < 1:2023642/93‑1 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt > 2:3552961/1‑93 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt > 2:656312/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTc < 1:2998469/93‑1 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:364678/1‑93 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:2654316/1‑93 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 2:3327160/1‑93 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 2:3289778/1‑93 (MQ=255) cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:3948393/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg > 1:1832865/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg > 1:3417272/1‑93 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc > 2:3974310/1‑93 (MQ=255) atatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGTTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt > 1:1517838/1‑93 (MQ=255) atGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgt < 2:1510328/93‑1 (MQ=255) gCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGc < 2:3641476/93‑1 (MQ=255) cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca > 1:1042995/1‑93 (MQ=255) cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca < 1:2051232/93‑1 (MQ=255) cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca < 1:4521716/93‑1 (MQ=255) cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca < 1:3554298/93‑1 (MQ=255) acgggTGAGGAAAATGCAAAAAAACCGCTGAATGGAAAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca < 2:1812261/90‑1 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAGTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcata < 2:4490127/93‑3 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca > 1:2137296/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca > 2:4420843/1‑93 (MQ=255) cAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCacac > 1:175034/1‑93 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc < 2:4439219/93‑1 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc > 2:2276059/1‑93 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTCGCGCCCTGTGCCACAcc > 2:3780849/1‑93 (MQ=255) aGGGGATGAAAATGCAGAAAAACCGCTCGTTTGAGAAACTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc < 1:4083829/93‑1 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 1:2314435/1‑93 (MQ=255) gATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtct > 1:668233/1‑93 (MQ=255) aTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc > 1:926929/1‑93 (MQ=255) aTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc < 2:3748847/93‑1 (MQ=255) aTGGAAATGCAGATAAAAAGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCGCGCTAGTCCTTGGCGCACTGTGCCACACGTtctc > 1:1270978/1‑93 (MQ=255) tGGAAGTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCg > 2:4342275/1‑93 (MQ=255) gAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc < 2:3826331/93‑1 (MQ=255) gAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 2:177792/1‑93 (MQ=255) gAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 2:3116122/1‑93 (MQ=255) aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgg > 2:3342594/1‑93 (MQ=255) aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CAGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgg > 1:4569171/1‑93 (MQ=255) tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg > 2:2181649/1‑93 (MQ=255) tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTCCTCGCCgggg > 2:3082915/1‑93 (MQ=255) gaGATAAACCGCTCGATTGAAAAACTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGc < 1:3372338/92‑1 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg < 1:988619/93‑1 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg > 2:364632/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCCTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg > 2:263886/1‑93 (MQ=255) aaaaaaCCCTCGATTGAGAAAGGCCGG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg < 2:2769795/91‑1 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg > 1:188590/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg < 1:4667113/93‑1 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg > 1:4352511/1‑93 (MQ=255) aaaCGCTCGATTCAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCCCTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGCGCGGGGaa > 1:771830/1‑93 (MQ=255) accGCTCGATTGAAAAACCCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACTCCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa < 1:1640496/91‑1 (MQ=255) aaCGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 2:2731252/1‑93 (MQ=255) aCGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAat > 1:1338721/1‑93 (MQ=255) aCGCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAat > 2:2599765/1‑93 (MQ=255) cGCTCGATTGAAAAAACCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata < 2:129671/93‑1 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAatat > 1:3460487/1‑93 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAatat > 2:4365357/1‑93 (MQ=255) cTCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt > 2:3274835/1‑93 (MQ=255) cTCGATGGAGAAACCCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt < 2:1869775/93‑1 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAATAttt > 1:134314/1‑93 (MQ=255) aTTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAATATTTTgg > 1:2410839/1‑93 (MQ=255) aTTGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg > 1:1533207/1‑93 (MQ=255) ttGAGAAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGTGAAATATTTTGGa < 2:2965394/93‑1 (MQ=255) gagaAAATCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATc > 2:243298/1‑93 (MQ=255) ggaAAAGCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCa < 2:2922196/92‑1 (MQ=255) aaaaTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAtt < 1:735822/93‑1 (MQ=255) aaaaTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAtt > 1:4658154/1‑93 (MQ=255) aaaTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTc < 2:3042408/93‑1 (MQ=255) aaTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCa > 1:4386202/1‑93 (MQ=255) aTCC‑CGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAATATTTTGGATCATTCAc > 1:29385/1‑93 (MQ=255) | ACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑C‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAC > NC_000913/4099210‑4099389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |