| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,315,907 | +A | coding (436/759 nt) | phnK ← | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,315,903 | 1 | . | A | 99.0% | 699.3 / ‑1.1 | 193 | coding (440/759 nt) | phnK | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base A (90/101); total (91/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
ATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑AAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCG > NC_000913/4315812‑4315989 | ccAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGATTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAGACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaa > 1:1905061/1‑93 (MQ=255) aGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaa < 1:111138/93‑2 (MQ=255) aGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaa < 1:2918571/93‑2 (MQ=255) aGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGAGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑caaaa > 1:499474/1‑92 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag < 1:4538357/93‑3 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag < 1:3594398/93‑3 (MQ=255) ccccGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag < 2:1206355/92‑3 (MQ=255) cccGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaagg > 1:1026779/1‑90 (MQ=255) cccGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGGTGCCGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaagg > 2:4653886/1‑90 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaaggt < 1:3050787/93‑5 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑ggtgg < 1:4045095/93‑1 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑ggtgg < 1:3761193/93‑1 (MQ=255) ccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑ggtggt < 1:2480866/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTc > 1:2697973/1‑93 (MQ=255) ggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCg < 2:2021420/93‑1 (MQ=255) cggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCa < 2:271329/93‑1 (MQ=255) ggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAg < 1:718932/93‑1 (MQ=255) ggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAg < 2:727054/93‑1 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGTCAgg > 1:1694721/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACAACAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGgt > 1:3796137/1‑93 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGgtcg > 2:2196495/1‑93 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGgtcg < 1:3286988/93‑1 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGgtcgt < 2:236229/93‑1 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGgtcgtc > 2:3126863/1‑93 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGgtcgtc < 1:4014066/93‑1 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCCCCAGGTTGCGGGCAAGCTGCAAACGGTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGGGGACGGCAGGccgtcgc > 1:3316666/1‑92 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGa < 1:2582794/93‑1 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGa > 1:3137967/1‑93 (MQ=255) tAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc > 1:1177543/1‑93 (MQ=255) tAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc < 1:2381312/93‑1 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc < 1:2343749/93‑1 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc < 1:88620/93‑1 (MQ=255) aaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCg < 1:4572727/93‑1 (MQ=255) aaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCg < 2:1457414/93‑1 (MQ=255) cacCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGt < 2:4386507/93‑1 (MQ=255) acCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt < 2:2310736/93‑1 (MQ=255) acAGATTCGGAAGCGTCACCAGGTTGCGGCCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGCCAGGTCGTCGATCCGGTTg < 2:692937/92‑1 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg < 1:4311974/93‑1 (MQ=255) aGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGc > 1:1350676/1‑93 (MQ=255) gCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCg > 2:3806151/1‑93 (MQ=255) cTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCgg < 1:2800690/93‑1 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGTggg > 1:1374318/1‑93 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg < 2:2010451/93‑1 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg > 2:3459523/1‑93 (MQ=255) ggATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGCCGTCGATCCGGCTTGCGGGAAt > 2:4081497/1‑93 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc < 2:1531/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc < 2:315430/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTGGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc < 2:619171/93‑1 (MQ=255) tGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtctc < 2:2579097/93‑1 (MQ=255) tGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtctc > 1:443723/1‑93 (MQ=255) tGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtctc > 1:3158975/1‑93 (MQ=255) gCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTcc < 2:3716297/93‑1 (MQ=255) cACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACct > 1:2399519/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTTCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc < 2:452077/93‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc > 2:3291083/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc < 1:2602210/93‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc > 1:3551566/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc < 1:544110/93‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAGCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 2:1653988/93‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct > 1:2106832/1‑93 (MQ=255) cAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCtt > 2:1409828/1‑93 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCCCCACCTCTTc > 1:4168238/1‑93 (MQ=255) tGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGc < 1:3538985/93‑1 (MQ=255) cGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGccc > 1:2617055/1‑92 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc < 2:1266689/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc > 2:654083/1‑93 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc < 1:2029119/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCCTCCAGGCAc > 2:2399448/1‑93 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc < 2:2910907/93‑1 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc < 2:2743155/93‑1 (MQ=255) tGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgcgc < 1:1602520/93‑1 (MQ=255) tGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgcgc < 2:2620840/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGt < 2:3030172/93‑1 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTg < 2:220340/93‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGc < 2:1062520/93‑1 (MQ=255) cGCTGCTCCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGc < 1:1528535/93‑1 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCa > 2:1357366/1‑93 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc < 1:2926222/93‑1 (MQ=255) tgctgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg > 1:3833514/1‑93 (MQ=255) tgctgcATACCGACGA‑AAAACGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCGGTTTGGCGGGAATCTCCCCCTTTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg < 2:4036439/93‑1 (MQ=255) ctgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGaa > 1:679899/1‑93 (MQ=255) ctgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGaa < 1:2755047/93‑1 (MQ=255) ctgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGaa < 1:753224/93‑1 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat < 2:379218/93‑1 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat < 2:2477332/93‑1 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 1:1820500/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGGTGGCGGGAATGTCCACCTCTTCCAGCCCCTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 1:919396/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCGG‑AAAACGGAGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCGCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGTat > 2:1762979/1‑93 (MQ=255) tcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 2:2794333/92‑1 (MQ=255) gcATCCCGCCGGAAAAA‑GCGGGTCGGCAGGTCGGCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 2:2996870/93‑1 (MQ=255) gcATACCGCGGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 2:2073333/93‑1 (MQ=255) gcATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 1:4449186/93‑1 (MQ=255) cATCCCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat < 2:4543058/93‑1 (MQ=255) cATACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat < 1:1443880/93‑1 (MQ=255) tACCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCg > 2:3527456/1‑93 (MQ=255) aCCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc > 1:2077939/1‑93 (MQ=255) aCCGCCGGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc < 2:2523720/93‑1 (MQ=255) ccgccgGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGcc < 1:3730978/93‑1 (MQ=255) ccgccgGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGcc > 1:3675342/1‑93 (MQ=255) cgccgGAAAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCg > 1:3906361/1‑93 (MQ=255) | ATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑AAAA‑GGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCG > NC_000913/4315812‑4315989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |