Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,324,986 | (C)6→7 | coding (858/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,324,980 | 1 | . | C | 98.2% | 336.9 / ‑0.7 | 112 | coding (852/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base C (58/52); total (60/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑CC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCT > NC_000913/2324890‑2325066 | tgcGGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc < 2:3435413/93‑1 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c > 2:447725/1‑93 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑c > 2:1905680/1‑93 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑cc > 2:3991423/1‑93 (MQ=255) ctctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑ccc < 1:1058634/93‑2 (MQ=255) ctctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑ccc > 2:1639713/1‑92 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑cccg > 2:1225160/1‑91 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑cccgc < 1:4495240/93‑4 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑cc‑c‑c‑cccgca > 1:3657038/1‑89 (MQ=255) gTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCAtt < 1:1845147/93‑1 (MQ=255) gTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCAtt > 1:2728716/1‑93 (MQ=255) tGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTg > 1:4020242/1‑93 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCGGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGa < 1:2131004/93‑1 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGa < 1:3702562/93‑1 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGGTATGCCAGCGGTGGCGTG‑CCGC‑C‑CC‑GCATTGa > 2:1778094/1‑93 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGAt > 2:2472505/1‑93 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGAt < 1:1919515/93‑1 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGAt > 2:3062994/1‑93 (MQ=255) ttATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCCTTGATg > 2:2335534/1‑93 (MQ=255) tATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATgg > 1:4337567/1‑93 (MQ=255) tATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATgg < 2:2646932/93‑1 (MQ=255) tGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGt > 2:1716466/1‑93 (MQ=255) tGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGt < 1:1330957/93‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGGGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATgggaa > 1:2675614/1‑91 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTa > 2:549521/1‑93 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTAt < 2:4476440/93‑1 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGCGTggg > 2:1740153/1‑93 (MQ=255) tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGcc < 1:358178/93‑1 (MQ=255) tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGCATGGGGcc > 2:2169368/1‑93 (MQ=255) cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCa > 2:104582/1‑93 (MQ=255) cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCa < 1:2583747/93‑1 (MQ=255) tGCGGAGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGCGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAg > 1:1409892/1‑93 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAc < 1:82189/93‑1 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAc < 2:1561924/93‑1 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGACAGTAc > 1:4119007/1‑93 (MQ=255) gcgcTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAcc > 2:3168103/1‑93 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCt < 2:1549509/93‑1 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCt < 1:4388410/93‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc < 2:4643889/93‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc > 1:1046111/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc > 1:4304650/1‑93 (MQ=255) gcagcaGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGGATGGGGCCAGTACCTGCCAc > 2:475022/1‑93 (MQ=255) agcagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc > 1:636280/1‑93 (MQ=255) gcagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa > 2:2502280/1‑93 (MQ=255) gcagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa > 2:1899431/1‑93 (MQ=255) gcagGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa > 1:962847/1‑93 (MQ=255) agGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaa > 2:3370018/1‑93 (MQ=255) gCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaaaa > 2:4160429/1‑93 (MQ=255) gCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaaaa > 2:2205964/1‑93 (MQ=255) ccTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGCTGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 2:1194427/1‑93 (MQ=255) ccTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 1:2713643/1‑93 (MQ=255) ttACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg < 2:1825661/93‑1 (MQ=255) ttACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg < 1:2134494/93‑1 (MQ=255) tACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt < 2:4649006/93‑1 (MQ=255) aCCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:2051612/93‑1 (MQ=255) aCCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:3587425/93‑1 (MQ=255) aCCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:3663784/93‑1 (MQ=255) ccccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa > 2:1607868/1‑93 (MQ=255) ccccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa < 2:405632/93‑1 (MQ=255) cccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc < 1:4103780/93‑1 (MQ=255) cccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc < 1:2305168/93‑1 (MQ=255) ccccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACa > 2:2827161/1‑93 (MQ=255) cccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACaa > 1:549885/1‑93 (MQ=255) cccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACaa > 2:4563655/1‑93 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc > 1:206147/1‑93 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc < 2:3410500/93‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc < 2:1303314/93‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAAc > 1:753020/1‑93 (MQ=255) ggCTCGGATCAAAAGTTATGGAAGCGTTGGCGCG‑CC‑CAC‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg < 2:311072/93‑1 (MQ=255) ggCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg < 2:866862/93‑1 (MQ=255) ggCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg > 2:4255851/1‑93 (MQ=255) ggCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTgg < 2:3664452/93‑1 (MQ=255) cTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCg > 2:2762021/1‑93 (MQ=255) tCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑CC‑C‑CTCC‑GCATTGATGGGTATCGGGCAAGTACCTGGCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCgg > 2:796492/1‑93 (MQ=255) cGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCggg < 1:546241/93‑1 (MQ=255) gCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCgggg < 1:1191557/93‑1 (MQ=255) cATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGc < 1:2857889/93‑1 (MQ=255) cATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGc < 1:4170836/93‑1 (MQ=255) cATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGc < 2:4534437/93‑1 (MQ=255) tAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGc < 1:878254/93‑1 (MQ=255) aaaGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCaa < 1:3816273/93‑1 (MQ=255) aaGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAAc < 1:3003379/93‑1 (MQ=255) aGTTATGCCAGCGGTGTCTTC‑CC‑C‑C‑CCTGCATTGATGGGTATGGGACGAGTTCCTGCCCCGCAAAAAGCATTACAGCTGGCGGGTCTACAACt < 2:1766447/93‑1 (MQ=255) aGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACt > 2:242780/1‑93 (MQ=255) gTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTg < 2:3549124/93‑1 (MQ=255) gTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCAAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCGGAAACTg > 1:1139628/1‑93 (MQ=255) ttATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTgg > 2:3665894/1‑93 (MQ=255) tATGCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGc < 1:203233/93‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCGAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGa < 1:2896168/93‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGa < 1:3083909/93‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGa < 1:386913/93‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGa > 2:2004802/1‑93 (MQ=255) gCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATCtt > 1:3746239/1‑93 (MQ=255) gCGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATAtt > 1:3489765/1‑93 (MQ=255) cGGTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGGTATTg > 2:4005911/1‑93 (MQ=255) gTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAt > 1:183899/1‑93 (MQ=255) gTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAt < 2:4687350/93‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAt < 1:409648/93‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATGGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAt < 2:394560/93‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAtc < 1:209381/93‑1 (MQ=255) | TGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑CC‑C‑C‑CC‑GCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCT > NC_000913/2324890‑2325066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |