Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,091,572 | 3461 bp→GCATGCGGATCCTCTAGAGTCGACATATG | [rhaD]–rhaB | [rhaD], rhaA, rhaB |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4091572 | 4095032 | 3461 | 232 [0] | [0] 236 | [rhaD]–rhaB | [rhaD],rhaA,rhaB |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4091571 | 0 (0.000) | 164 (1.320) +GCATGCGGATCCTCTAGAGTCGACATATG |
86/126 | 0.1 | 100% | coding (283/825 nt) | rhaD | rhamnulose‑phosphate aldolase |
? | NC_000913 | 4095033 = | 0 (0.000) | intergenic (‑4/‑284) | rhaB/rhaS | rhamnulokinase/RhaS |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GGCTGCGGCATTCACGCTCGTAACGCGCCAGCATCACGCGCCCACTGGATGCGCCGAGATCGACGGCGACACAATTGCGAAAGGTCATAATGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCA > NC_000913/4094942‑4095125 | gtggggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGt < 1:2248700‑M2/2‑1 (MQ=255) ggggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGa > 1:4227106‑M2/90‑93 (MQ=255) gacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcc > 1:92619‑M2/87‑93 (MQ=255) acggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCct < 2:3754126‑M2/8‑1 (MQ=255) acggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCct < 1:460399‑M2/8‑1 (MQ=255) ggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgc > 2:3141262‑M2/84‑93 (MQ=255) ggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgc < 2:684028‑M2/10‑1 (MQ=255) ggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgc > 2:3397979‑M2/84‑93 (MQ=255) ggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgc < 1:2060320‑M2/10‑1 (MQ=255) ggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagccgacatatgGTGATCctgc > 1:279753‑M2/84‑93 (MQ=255) gcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgct < 1:116021‑M2/11‑1 (MQ=255) gcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgct > 2:2848355‑M2/83‑93 (MQ=255) tcgttggttaccccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGaa < 2:2143384‑M2/14‑1 (MQ=255) tcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGaa > 1:4255011‑M2/80‑93 (MQ=255) tcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGaa > 1:3738523‑M2/80‑93 (MQ=255) cgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAt < 2:4383905‑M2/15‑1 (MQ=255) cgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAt < 2:595464‑M2/15‑1 (MQ=255) gttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctattgtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAtt > 1:4683414‑M2/78‑93 (MQ=255) gttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAtt > 1:2784401‑M2/78‑93 (MQ=255) ttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAttt > 1:2137536‑M2/77‑93 (MQ=255) ttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAttt > 1:2885792‑M2/77‑93 (MQ=255) tggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTc > 2:4254815‑M2/76‑93 (MQ=255) tggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTc < 2:1840251‑M2/18‑1 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt > 1:3831149‑M2/74‑93 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt > 2:1578273‑M2/74‑93 (MQ=255) ttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAtt < 2:3841059‑M2/21‑1 (MQ=255) ttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAtt > 2:377278‑M2/73‑93 (MQ=255) ttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCCGAATTTCAtt > 2:2976406‑M2/73‑93 (MQ=255) taacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa < 1:4456769‑M2/22‑1 (MQ=255) taacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa < 1:740326‑M2/22‑1 (MQ=255) acccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACg > 2:1374702‑M2/70‑93 (MQ=255) cccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGa > 2:1194146‑M2/69‑93 (MQ=255) cccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGa > 2:2091705‑M2/69‑93 (MQ=255) ccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggctcctctagaatcgacatatgGTGATCCTGGTGAATTTCATTACGACCa > 2:2045505‑M2/66‑93 (MQ=255) ccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCa < 2:2717552‑M2/28‑1 (MQ=255) ccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCa > 2:2577150‑M2/66‑93 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg < 2:2266976‑M2/29‑1 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg > 1:2620922‑M2/65‑93 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg > 2:1419709‑M2/65‑93 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg < 1:2240949‑M2/29‑1 (MQ=255) agaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGCATTTCATTACGACCAGTCt > 1:2968082‑M2/62‑93 (MQ=255) agaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCt > 1:901162‑M2/62‑93 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTa > 2:479615‑M2/61‑93 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTa < 1:857253‑M2/33‑1 (MQ=255) atgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaaa < 1:3423484‑M2/35‑1 (MQ=255) atgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaaa < 2:3989786‑M2/35‑1 (MQ=255) gtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaaaaa < 2:4163773‑M2/37‑1 (MQ=255) tggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAg > 1:3248706‑M2/56‑93 (MQ=255) tggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAg > 2:2871926‑M2/56‑93 (MQ=255) ggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAgc > 2:1734705‑M2/55‑93 (MQ=255) agcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGcc < 1:2917926‑M2/42‑1 (MQ=255) cccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTg > 1:3592557‑M2/50‑93 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa > 2:1509816‑M2/49‑93 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa > 1:4104495‑M2/49‑93 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa < 1:23644‑M2/45‑1 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa > 1:1090527‑M2/49‑93 (MQ=255) gccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc < 1:1054084‑M2/49‑1 (MQ=255) gccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc < 1:446351‑M2/49‑1 (MQ=255) gccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc < 2:4545514‑M2/49‑1 (MQ=255) gccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc < 2:1934514‑M2/49‑1 (MQ=255) gccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc < 1:1366560‑M2/49‑1 (MQ=255) gtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgcg > 1:532203‑M2/42‑93 (MQ=255) cgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGAc < 2:2041631‑M2/54‑1 (MQ=255) gctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGAcc > 2:1212392‑M2/39‑93 (MQ=255) ctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCt < 1:1496730‑M2/56‑1 (MQ=255) gtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc < 2:112305‑M2/58‑1 (MQ=255) gtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc > 1:745938‑M2/36‑93 (MQ=255) gtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc < 1:2431336‑M2/58‑1 (MQ=255) tcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtct > 2:850683‑M2/35‑93 (MQ=255) cgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtctc < 2:1001208‑M2/60‑1 (MQ=255) acgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGt < 2:1319553‑M2/62‑1 (MQ=255) cgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGtt > 1:1620194‑M2/31‑93 (MQ=255) gcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTa < 2:675728‑M2/64‑1 (MQ=255) gcatgcgcatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTa > 1:190547‑M2/30‑93 (MQ=255) atgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACt > 2:903992‑M2/28‑93 (MQ=255) atgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACt > 1:4165529‑M2/28‑93 (MQ=255) tgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTg > 2:4653632‑M2/27‑93 (MQ=255) gcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGa > 1:3211643‑M2/26‑93 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACa > 2:2593420‑M2/24‑93 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACa < 2:805508‑M2/70‑1 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACa < 2:2809579‑M2/70‑1 (MQ=255) gatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAg > 2:3331303‑M2/23‑93 (MQ=255) gatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAg < 1:3050926‑M2/71‑1 (MQ=255) gatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAg > 2:3262029‑M2/23‑93 (MQ=255) ctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaa > 1:718006‑M2/19‑93 (MQ=255) ctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaa > 2:794209‑M2/19‑93 (MQ=255) ctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaa > 2:1023560‑M2/19‑93 (MQ=255) ctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaa > 1:1675666‑M2/19‑93 (MQ=255) ctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaa > 2:3523646‑M2/19‑93 (MQ=255) tctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaaa > 1:1695176‑M2/18‑93 (MQ=255) tctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaaa > 1:1456558‑M2/18‑93 (MQ=255) tctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaaa < 1:4022953‑M2/76‑1 (MQ=255) agagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAAtga > 2:3940972‑M2/15‑92 (MQ=255) tcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCa > 1:3948985‑M2/11‑93 (MQ=255) gacatatgGTGATGCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCAtt > 2:4502351‑M2/9‑93 (MQ=255) atatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGc > 1:222791‑M2/6‑93 (MQ=255) atatgGAGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGTGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGGCAGGAAAATGAGCCATTGGc > 2:734235‑M2/6‑93 (MQ=255) tatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCa > 2:3609400‑M2/5‑93 (MQ=255) gGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAAcc < 1:2899489‑M2/92‑1 (MQ=255) gtgATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAACCa > 2:1616416/1‑93 (MQ=255) | GGCTGCGGCATTCACGCTCGTAACGCGCCAGCATCACGCGCCCACTGGATGCGCCGAGATCGACGGCGACACAATTGCGAAAGGTCATAATGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCA > NC_000913/4094942‑4095125 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |