| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,949,436 | 0 | A | G | 51.5% | 12.1 / inf | 237 | L6L (CTA→CTG) | yecE | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/44); new base G (77/45); total (148/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC > NC_000913/1949344‑1949528 | cacaATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTAc < 2:4544535/93‑1 (MQ=255) aaTAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGc < 1:2666925/93‑1 (MQ=255) aaTAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGc < 2:4276353/93‑1 (MQ=255) aTAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCa > 1:1437325/1‑93 (MQ=255) tAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGTAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCaa < 1:3295921/93‑1 (MQ=255) tAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCaa > 2:3080838/1‑93 (MQ=255) cAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATgg < 1:2161354/93‑1 (MQ=255) gTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTc > 2:485018/1‑93 (MQ=255) tATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCg < 1:3827673/93‑1 (MQ=255) tATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCg > 1:3469357/1‑93 (MQ=255) tATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGCTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCg > 2:3169880/1‑93 (MQ=255) taatcATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCAt > 1:4375826/5‑93 (MQ=255) taatcATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCAt > 1:2941485/5‑93 (MQ=255) aaCCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTATACCGCAATGGTCGCATc > 2:1444889/1‑93 (MQ=255) atcATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATcc > 1:1834201/3‑93 (MQ=255) tcATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCt < 2:2093367/92‑1 (MQ=255) tcATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCt > 1:1254254/2‑93 (MQ=255) ccATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCt < 2:915538/93‑1 (MQ=255) cATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTa < 1:4635177/93‑1 (MQ=255) atatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTaa > 2:2280420/1‑93 (MQ=255) tatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTaaa > 2:1358332/1‑93 (MQ=255) tatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTaaa < 2:3706590/93‑1 (MQ=255) atCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAt < 1:4553511/93‑1 (MQ=255) atCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAt < 1:1881890/93‑1 (MQ=255) tCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATg > 2:2921661/1‑93 (MQ=255) tCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATg > 1:2757067/1‑93 (MQ=255) ctccccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATgg < 2:975968/90‑1 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 1:2209913/1‑93 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 1:4221745/1‑93 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg < 2:771151/93‑1 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg < 1:3871987/93‑1 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGGGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 2:1983173/1‑93 (MQ=255) aCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGt > 2:4450155/1‑93 (MQ=255) cccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTg > 1:815755/1‑93 (MQ=255) cccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTg < 2:1735061/93‑1 (MQ=255) ccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGc > 1:3480749/1‑93 (MQ=255) gcgcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCgg > 2:1034765/1‑93 (MQ=255) cgcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGt < 2:2884151/93‑1 (MQ=255) gcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGtt < 1:3521465/93‑1 (MQ=255) gcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGtt < 2:257967/93‑1 (MQ=255) gcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGtt > 2:2243134/1‑93 (MQ=255) gcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGtt > 2:3656793/1‑93 (MQ=255) gcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGtt > 2:1057705/1‑93 (MQ=255) cATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTg > 1:3739112/1‑93 (MQ=255) aTCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgg < 1:4477174/93‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgg < 1:3846394/93‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgg > 2:571073/1‑93 (MQ=255) tCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTggg > 2:3098493/1‑93 (MQ=255) tCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTggg < 1:4520386/93‑1 (MQ=255) cGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgggt > 1:1722603/1‑92 (MQ=255) cccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTAt > 2:1649340/1‑93 (MQ=255) ccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATc > 1:3644928/1‑93 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAcc > 1:2275963/1‑93 (MQ=255) tgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAg < 2:3775189/93‑1 (MQ=255) cGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGcc > 2:4592952/1‑93 (MQ=255) cGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGcc < 2:88675/93‑1 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCt > 2:1417975/1‑93 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCt < 2:436061/93‑1 (MQ=255) tAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCtt > 1:1360404/1‑93 (MQ=255) tAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCtt < 1:2415713/93‑1 (MQ=255) gaGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCtt < 2:2139327/92‑1 (MQ=255) cGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGaa < 2:1826249/93‑1 (MQ=255) gTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAag > 2:590877/1‑93 (MQ=255) gTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAag > 1:1389682/1‑93 (MQ=255) tGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAaga < 2:4024802/93‑1 (MQ=255) tGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAaga < 2:352567/93‑1 (MQ=255) ggAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAagag < 2:2566222/93‑1 (MQ=255) ggAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAagag < 2:1518431/93‑1 (MQ=255) gAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGt < 2:1205028/93‑1 (MQ=255) gAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGt < 2:3232730/93‑1 (MQ=255) gAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGt > 1:3224698/1‑93 (MQ=255) agagATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAt > 2:3928069/1‑93 (MQ=255) agagATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAt > 1:1032276/1‑93 (MQ=255) agagATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAt < 1:3011845/93‑1 (MQ=255) gagaTCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATg > 1:2114586/1‑93 (MQ=255) aTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGccc > 2:1551431/1‑93 (MQ=255) tCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCg > 1:1026161/1‑93 (MQ=255) ttcaCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATAACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCa > 2:2799468/4‑93 (MQ=255) accggTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGGGCGGTTGGGGATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACtt < 2:635849/89‑1 (MQ=255) gcgTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTa > 1:3208224/1‑93 (MQ=255) gcgTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTa > 1:897119/1‑93 (MQ=255) gcattATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTa > 1:4354345/4‑93 (MQ=255) gtttATGATTTACACCGGTCTCCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTaa < 2:4136510/91‑1 (MQ=255) gTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAc > 2:1505373/1‑93 (MQ=255) ttATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACt < 1:1182588/93‑1 (MQ=255) aTGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGc > 1:736219/1‑93 (MQ=255) gATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGt < 2:316447/93‑1 (MQ=255) aTTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTg > 1:3081532/1‑93 (MQ=255) aTTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTg > 2:239668/1‑93 (MQ=255) tttACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTga > 1:1606352/1‑92 (MQ=255) tttACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTga > 1:2032941/1‑92 (MQ=255) aTCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGc > 2:3534829/1‑93 (MQ=255) tCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTACATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGCATGGGCGCCACCTTAACTGCGTGGAGGGCa > 2:2198258/1‑93 (MQ=255) tCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGAGTCGAGCGCa > 2:4507416/1‑93 (MQ=255) cGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCaa > 2:1885386/1‑93 (MQ=255) ggTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAac > 2:3424848/1‑93 (MQ=255) gTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAaca > 2:2002329/1‑93 (MQ=255) tctcCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAacac < 2:3434270/93‑1 (MQ=255) cTACCGCAGTGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAAGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcacc > 2:4313483/1‑93 (MQ=255) tACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAAcacca > 2:2474279/1‑93 (MQ=255) | GCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC > NC_000913/1949344‑1949528 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |