Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,935,409 | T→C | intergenic (+28/‑51) | fucI → / → fucK | L‑fucose isomerase/L‑fuculokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,935,409 | 0 | T | C | 99.5% | 624.4 / ‑5.2 | 204 | intergenic (+28/‑51) | fucI/fucK | L‑fucose isomerase/L‑fuculokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (94/109); total (94/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
ATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAA > NC_000913/2935319‑2935498 | aTGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCg > 2:1184189/1‑93 (MQ=255) gATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTc > 2:1745602/1‑93 (MQ=255) gATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTc > 1:2525939/1‑93 (MQ=255) atatTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTcc > 2:259873/1‑93 (MQ=255) atatTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTcc > 1:1805139/1‑93 (MQ=255) atatTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTcc < 1:3363044/93‑1 (MQ=255) tatTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCg > 2:3242553/1‑93 (MQ=255) atTGAATGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCgg < 1:482748/93‑1 (MQ=255) ttGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGc < 2:1281355/93‑1 (MQ=255) tGAAGGCCAGGATTGCCGCTCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCt < 1:4087597/93‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGTATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTa < 2:1973924/93‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTa < 1:1680522/93‑1 (MQ=255) aGGCCAGGATTCCCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTAcc < 2:3153475/93‑1 (MQ=255) aGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTAcc < 2:4464554/93‑1 (MQ=255) ggCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCg < 2:1060336/93‑1 (MQ=255) ggCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCg > 1:1041277/1‑93 (MQ=255) ccAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCggg > 1:3923738/1‑93 (MQ=255) cAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGc > 2:2850100/1‑93 (MQ=255) cAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGc > 2:1078222/1‑93 (MQ=255) cAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGc > 1:3067070/1‑93 (MQ=255) cAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGc < 1:3076737/93‑1 (MQ=255) aGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGcc > 2:1405472/1‑93 (MQ=255) aGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGcc < 2:1864547/93‑1 (MQ=255) aGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGcc > 1:635468/1‑93 (MQ=255) gATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCAGCTACCGGGCCTg > 1:3949567/1‑93 (MQ=255) aTTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGa < 2:3052144/93‑1 (MQ=255) aTTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGa > 2:2083706/1‑93 (MQ=255) aTTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGa < 1:177169/93‑1 (MQ=255) aTTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGa > 2:2134622/1‑93 (MQ=255) aCCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAca > 2:1569736/1‑93 (MQ=255) aCCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAca > 2:861148/1‑93 (MQ=255) ccGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAcaa < 2:1177623/93‑1 (MQ=255) gcgcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAcaagc > 1:2569163/1‑93 (MQ=255) gcgcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAcaagc > 1:4373039/1‑93 (MQ=255) gcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAcaagcaa > 1:2442353/1‑93 (MQ=255) gcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAcaagcaa < 1:2162979/93‑1 (MQ=255) cTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCGGCTCCGGCTACTGGGCCTGAAcaagcaag > 1:1060397/1‑93 (MQ=255) cTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAAcaagcaag < 2:2538934/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAaga < 1:187369/93‑1 (MQ=255) ccAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTg < 2:1012981/93‑1 (MQ=255) aGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGt < 1:1335571/93‑1 (MQ=255) gAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGtt < 1:1134005/93‑1 (MQ=255) aaCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTa < 2:4361311/93‑1 (MQ=255) aaCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTa < 2:428544/93‑1 (MQ=255) aaCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTa < 2:2334740/93‑1 (MQ=255) aaCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTa < 2:2045456/93‑1 (MQ=255) aCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAg > 1:3685335/1‑93 (MQ=255) cTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGc < 1:1718044/93‑1 (MQ=255) cTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGCGGCTAGc > 1:4014614/1‑93 (MQ=255) ggTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGGCGGa > 1:1108376/1‑93 (MQ=255) ggTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGa < 1:4517469/93‑1 (MQ=255) gTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGAt < 2:252565/93‑1 (MQ=255) gTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGAt > 1:1466403/1‑93 (MQ=255) cGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAg > 1:3788228/1‑93 (MQ=255) cGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAg < 2:2436354/93‑1 (MQ=255) cGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGAGGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAg < 1:2712956/93‑1 (MQ=255) ttGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCa > 2:3394194/1‑93 (MQ=255) tGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGTTGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCaa < 2:4027107/93‑1 (MQ=255) tGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCaa < 2:2805850/93‑1 (MQ=255) tGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCaa < 2:352225/93‑1 (MQ=255) gTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAAt < 1:155846/93‑1 (MQ=255) gTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAAt < 2:4233773/93‑1 (MQ=255) aCAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGt > 1:3046014/1‑93 (MQ=255) cAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGtt > 2:1695239/1‑93 (MQ=255) aaGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTa < 2:4662838/93‑1 (MQ=255) aGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTAt < 1:3114136/93‑1 (MQ=255) gCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATc < 1:2350324/93‑1 (MQ=255) gCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATc < 2:1912228/93‑1 (MQ=255) gTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGCGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCg > 1:996484/1‑93 (MQ=255) tAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGc < 1:4526674/93‑1 (MQ=255) aCATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCtata < 2:3998473/93‑1 (MQ=255) aCATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCtata < 2:3341932/93‑1 (MQ=255) cATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTatat < 2:1586282/93‑1 (MQ=255) cATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTatat < 1:355940/93‑1 (MQ=255) aTTGCTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATAtt < 2:783081/93‑1 (MQ=255) aTTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATAtt < 1:1943973/93‑1 (MQ=255) aTTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATAtt < 1:4244522/93‑1 (MQ=255) aTTACTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATAtt > 1:2801801/1‑93 (MQ=255) aCTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCa > 1:744160/1‑93 (MQ=255) cTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAg < 1:2728036/93‑1 (MQ=255) cTCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAg < 2:3483043/93‑1 (MQ=255) tCCCTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAgg > 2:4509488/1‑93 (MQ=255) cccTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGa > 1:3473749/1‑93 (MQ=255) ccTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGATACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATAGTGCAGGAg < 1:2859223/93‑1 (MQ=255) cTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGc < 2:2643227/93‑1 (MQ=255) cTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGc < 1:3389838/93‑1 (MQ=255) cTGATGTGATGCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGc > 1:2238555/1‑93 (MQ=255) gatgtgatgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGa > 1:591430/1‑93 (MQ=255) atgtgatgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGAt < 2:1891924/93‑1 (MQ=255) tgtgatgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCCGGAGCGAtt > 1:1445946/1‑93 (MQ=255) gtgatgCGCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTa > 2:3804381/1‑93 (MQ=255) gtgatgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTa < 1:1195616/93‑1 (MQ=255) gtgatgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTa < 1:2092126/93‑1 (MQ=255) atgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGa > 1:1991011/1‑93 (MQ=255) atgCCCGGCCGCTCCGGCTACCGGGCATGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGa < 1:4035373/93‑1 (MQ=255) cccGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGaaaa > 1:901067/1‑92 (MQ=255) cccGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGGGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGaaaa > 2:359958/1‑92 (MQ=255) ccGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACa < 2:442304/93‑1 (MQ=255) cGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCTGGAGCGATTATGAAACaa > 1:529229/1‑93 (MQ=255) cGGCCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACaa < 2:635468/93‑1 (MQ=255) | ATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAA > NC_000913/2935319‑2935498 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |